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揭示隱藏信號(hào):光譜流式細(xì)胞術(shù)如何克服自發(fā)熒光的干擾

來(lái)源:貝克曼庫(kù)爾特商貿(mào)(中國(guó))有限公司 更新時(shí)間:2025-06-12 13:30:19 閱讀量:304
導(dǎo)讀:揭示隱藏信號(hào):光譜流式細(xì)胞術(shù)如何克服自發(fā)熒光的干擾

什么是自發(fā)熒光?

自發(fā)熒光 (Autofluorescence, AF) 是指細(xì)胞內(nèi)因存在的某些熒光成分和代謝產(chǎn)物在受到特定波長(zhǎng)光激發(fā)時(shí)產(chǎn)生的固有熒光。常見的內(nèi)源性熒光物質(zhì),如還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NADH) 、氧化型黃素輔酶 (FMN/FAD) 、維生素以及含有芳香族氨基酸(如色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸)的蛋白質(zhì)。


自發(fā)熒光(AF)干擾給流式細(xì)胞術(shù)的檢測(cè)帶來(lái)巨大的困擾,使熒光信號(hào)的檢測(cè)、定量和解釋更加復(fù)雜。同時(shí),異質(zhì)性的自發(fā)熒光在不同細(xì)胞類型和成分之間變化,使結(jié)果分析復(fù)雜性增加。



流式細(xì)胞術(shù)中AF的挑戰(zhàn)



雖然AF有助于評(píng)估細(xì)胞狀態(tài),但其光譜干擾(尤其在400-600 nm區(qū)間)會(huì)掩蓋弱信號(hào)標(biāo)記物(如FITC/Alexa Fluor 488),導(dǎo)致:

信號(hào)分辨率下降:巨噬細(xì)胞、死細(xì)胞等高AF細(xì)胞影響顯著;

動(dòng)態(tài)波動(dòng)干擾:細(xì)胞大小、代謝狀態(tài)、固定方法均會(huì)改變AF強(qiáng)度;

影響細(xì)胞類型結(jié)果特異性:髓系細(xì)胞(富含熒光顆粒)、抗原呈遞細(xì)胞(高線粒體含量)AF本底高。


圖1:細(xì)胞自發(fā)熒光差異示例

A. 植物細(xì)胞流式分析:由于不同細(xì)胞成分和色素導(dǎo)致的各個(gè)通道的AF差異,特別是葉綠素導(dǎo)致特定通道高AF(數(shù)據(jù)來(lái)源:都柏林大學(xué)學(xué)院(UCD)流式細(xì)胞技術(shù)核心主任Alfonso Blanco博士分享)


如圖1所示,在未染色的植物提取物中檢測(cè)到升高的自發(fā)熒光(AF)水平,提示后續(xù)實(shí)驗(yàn)分析可能存在潛在的復(fù)雜性。實(shí)驗(yàn)程序和染色技術(shù),如醛固定和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的供應(yīng),也會(huì)影響細(xì)胞的自發(fā)熒光水平,從而增加細(xì)胞分析中自發(fā)熒光的復(fù)雜性和變異性。


傳統(tǒng)的流式細(xì)胞術(shù)無(wú)法有效區(qū)分AF,業(yè)內(nèi)的研究都把希望寄托在光譜流式細(xì)胞術(shù),但此前的光譜流式細(xì)胞術(shù)也面臨諸多難題。



光譜流式細(xì)胞術(shù)中的AF難題



光譜流式細(xì)胞術(shù)通過捕捉每種熒光分子在廣泛波長(zhǎng)范圍內(nèi)的整個(gè)發(fā)射光譜,為其生成唯一的光譜特征,隨后用于特定光譜解混和識(shí)別。然而,光譜流式通過全光譜捕獲實(shí)現(xiàn)多色解混,但AF仍帶來(lái)三大挑戰(zhàn)(圖2):

異質(zhì)性AF干擾:不同細(xì)胞類型的AF光譜特征各異;

弱信號(hào)掩蔽:高AF背景淹沒低表達(dá)靶標(biāo)信號(hào);

光譜重疊:AF與熒光標(biāo)記發(fā)射譜重疊導(dǎo)致假陽(yáng)性。


圖2:AF在光譜流式中的典型干擾

A. 不同細(xì)胞的異質(zhì)性AF信號(hào);B. 高AF導(dǎo)致弱信號(hào)群體難識(shí)別;C. AF與目標(biāo)熒光光譜重疊


如何應(yīng)對(duì)這些挑戰(zhàn)和難題,需要全面了解樣本、精心設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)、嚴(yán)格的去混合技術(shù)以及適當(dāng)?shù)膶?duì)照,以提高數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性。同時(shí),使用多個(gè)通道區(qū)分自發(fā)熒光信號(hào)和特定的熒光染料至關(guān)重要,因此我們需要一臺(tái)功能更全面的科研利器的助力。



近期上市的??CytoFLEX mosaic光譜流式分析儀可提供10個(gè)未染色通道,可從中提取不同群體的自發(fā)熒光特征,提升弱信號(hào)的檢測(cè)能力,幫助發(fā)現(xiàn)低豐度亞群。


下圖顯示了在CytoFLEX mosaic光譜流式分析儀上評(píng)估了AF提取對(duì)白細(xì)胞群體譜解混的影響,并評(píng)估了使用多個(gè)AF特征是否進(jìn)一步改善了解混。



針對(duì)不同細(xì)胞群體(中性粒細(xì)胞、嗜酸粒細(xì)胞、單核細(xì)胞、淋巴細(xì)胞)表面標(biāo)志物表達(dá)的直方圖,在同一文件中考慮了0、1、2或4個(gè)自發(fā)熒光簽名在解混矩陣中的影響。紅色(No AF)表示沒有進(jìn)行自發(fā)熒光提取的數(shù)據(jù),藍(lán)色(1 AF)表示去除一個(gè)自發(fā)熒光簽名后的數(shù)據(jù),橙色(2 AF)表示去除兩個(gè)自發(fā)熒光簽名后的數(shù)據(jù),綠色(4 AF)表示去除四個(gè)自發(fā)熒光簽名后的數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示,通過優(yōu)化AF校正,減少了嗜酸細(xì)胞、單核細(xì)胞和淋巴細(xì)胞中假陽(yáng)性CD16的情況,同時(shí)保留了真實(shí)的生物信號(hào)。



超越噪音:光譜流式細(xì)胞術(shù)

自發(fā)熒光管理的策略



光譜流式方案

1

對(duì)于簡(jiǎn)單樣本:未染色的自發(fā)熒光細(xì)胞有獨(dú)特光譜指紋,可將其作內(nèi)源性染料,設(shè)計(jì)檢測(cè)方案,計(jì)算去除自發(fā)熒光,能準(zhǔn)確分析特定標(biāo)記熒光,對(duì)識(shí)別低豐度標(biāo)記、描繪其表達(dá)和亞群分布及提高陽(yáng)性群體分辨率關(guān)鍵。

2

對(duì)于異質(zhì)性AF樣本:建立多類型AF光譜數(shù)據(jù)庫(kù);采用多元未染色對(duì)照捕獲AF變異,建議使用多樣的未染色對(duì)照,能夠有效地考慮不同細(xì)胞類型所展現(xiàn)的自發(fā)熒光強(qiáng)度的固有變異性。??CytoFLEX mosaic光譜流式分析儀可提供多達(dá)10個(gè)未染色通道,可幫助異質(zhì)性樣本建立更多元的光譜模型。

3

靶標(biāo)結(jié)合光譜變異:對(duì)像串聯(lián)聚合物染料這樣的熒光素,通過基于微球或細(xì)胞對(duì)照驗(yàn)證實(shí)現(xiàn)最佳解析結(jié)果,排除自發(fā)熒光信號(hào)影響。

4

通過門控分群、降維聚類等方法提升AF解析精度:先進(jìn)的光譜去混合算法和適當(dāng)?shù)难a(bǔ)償對(duì)照可以更好地將真實(shí)信號(hào)與噪聲隔離,從而顯著提高流式細(xì)胞術(shù)實(shí)驗(yàn)的精度和可靠性。CytoFLEX mosaic??提供泊松混合 (Poisson hybrid) 算法,憑借更符合實(shí)際的統(tǒng)計(jì)模型、更精準(zhǔn)的信號(hào)控制能力,以及更高的抗干擾能力,能夠有效地提高光譜流式細(xì)胞術(shù)的分析精度和數(shù)據(jù)質(zhì)量。



CytoFLEX mosaic還提供了光譜拆分后的結(jié)果驗(yàn)證功能,實(shí)時(shí)評(píng)估解析準(zhǔn)確性。當(dāng)數(shù)據(jù)出現(xiàn)異常時(shí),儀器能自動(dòng)提示潛在問題通道,讓研究人員輕松快速地排除數(shù)據(jù)隱患,保障實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。最后,光譜分析軟件CytExpert for Spectral,延續(xù)了CytExpert軟件智能易操作的特點(diǎn),非常容易學(xué)習(xí)和操作。


參考文獻(xiàn):

· https://www.mybeckman.cn/resources/reading-material/application-notes/overcoming-autofluorescence-in-spectral-flow-cytometry-analysis

· https://www.mybeckman.cn/resources/reading-material/application-notes/cytoflex-mosaic-enhanced-spectral-unmixing-of-white-blood-cell-populations

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貝克曼庫(kù)爾特公司對(duì)顆粒特性的研究始于上世紀(jì)的四十年代。從發(fā)明電子感應(yīng)區(qū)技術(shù)(庫(kù)爾特原理)用于分析顆粒大小和數(shù)目開始至今半個(gè)多世紀(jì)以來(lái),貝克曼庫(kù)爾特公司一直專注于顆粒分析的研究開發(fā)與應(yīng)用。其顆粒特性分析儀器已經(jīng)成為當(dāng)今具競(jìng)爭(zhēng)力和獨(dú)當(dāng)一面的表征顆粒特性的產(chǎn)品!無(wú)論是對(duì)粒度的分析,還是顆粒的計(jì)數(shù);無(wú)論是在微米-亞微米范圍的測(cè)量,還是在納米尺度內(nèi)的測(cè)量;既擁有應(yīng)用庫(kù)爾特原理的產(chǎn)品,同時(shí)也擁有應(yīng)用激光衍射散射原理以及動(dòng)態(tài)光散射原理的產(chǎn)品,使貝克曼庫(kù)爾特公司成為粒度分析同業(yè)的翹楚!貝克曼庫(kù)爾特的產(chǎn)品已成為“高準(zhǔn)確性”、“高分辨率”的代名詞,在用戶中享有盛譽(yù)。在粒度分析行業(yè)發(fā)展中一直發(fā)揮著深遠(yuǎn)

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