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2026-04-03 11:35:27大腸桿菌檢測
大腸桿菌檢測是一種常用的微生物檢測方法,用于評估食品、水源、環(huán)境等樣本中的大腸桿菌含量,以判斷其衛(wèi)生狀況。該方法通常包括樣本采集、培養(yǎng)、計數(shù)等步驟,通過顯微鏡觀察、生化試驗等手段確認(rèn)大腸桿菌的存在。大腸桿菌檢測對于預(yù)防和控制腸道傳染病具有重要意義,廣泛應(yīng)用于食品安全、環(huán)境監(jiān)測、醫(yī)療衛(wèi)生等領(lǐng)域。檢測時應(yīng)遵循專業(yè)操作規(guī)范,確保結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。

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2022-08-02 10:43:38單個大腸桿菌檢測新思路| naica?全自動微滴芯片數(shù)字PC
導(dǎo)讀盡管各國衛(wèi)生系統(tǒng)發(fā)展迅速,但由病原菌引起的傳染病仍然是人類健康的主要威脅之一。據(jù)報道,全世界每年有220多萬人死于水傳播大腸桿菌病原體。盡管大多數(shù)大腸菌群是無害的,但某些大腸桿菌的存在可能會導(dǎo)致甚至威脅到人類健康,例如,大腸桿菌O157:H7和其他產(chǎn)志賀毒素的大腸桿菌菌株(非O157 STEC)是食源性疾病的常見因素,可能對健康造成嚴(yán)重后果,尤其是對幼兒。因此,檢測大腸桿菌對于生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用以及食品、水和空氣質(zhì)量監(jiān)測非常重要。大連理工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,工業(yè)生態(tài)學(xué)與環(huán)境工程教育部重點實驗室的科學(xué)家,開發(fā)出基于naica?全自動微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)的單細(xì)菌檢測方法,該方法可以在1.5小時內(nèi)以單細(xì)胞靈敏度選擇性檢測臨床尿液樣本中的大腸桿菌 。該方法發(fā)表在《Analytical Methods》,題為“Single bacteria detection by droplet DNAzyme-coupled rolling circle amplification”。應(yīng)用亮點:?  dDRCA系統(tǒng),能夠快速、選擇性地檢測具有單細(xì)胞敏感性的大腸桿菌 ,dDRCA系統(tǒng)的檢測靈敏度比之前報道的PAD高1000倍。? 證明了dDRCA系統(tǒng)在尿路感染診斷中的潛在臨床適用性,dDRCA能夠在不到1.5小時內(nèi),從20份臨床尿液樣本中成功識別出5名UTI患者,而傳統(tǒng)的基于培養(yǎng)的方法需要數(shù)小時。文中采用naica??全自動微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)液滴微流控技術(shù),快速精準(zhǔn)的檢測到復(fù)雜樣本和高背景樣本中的致病大腸桿菌。通常擴(kuò)增需要約4小時進(jìn)行定量大腸桿菌檢測。在這項研究中,我們描述了DNA酶偶聯(lián)滾圈擴(kuò)增(RCA),這是一種高效的等溫酶DNA復(fù)制過程,可在naica??全自動微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)上進(jìn)行,以建立液滴DNA酶偶聯(lián)RCA(表示為dDRCA)系統(tǒng)。我們進(jìn)一步證明,該系統(tǒng)能夠在1.5小時內(nèi)以單細(xì)胞敏感性選擇性檢測臨床尿液樣本中的大腸桿菌?!鴪D2(a)通過瓊脂糖凝膠電泳分析RCA產(chǎn)物(RP)。(b) 反應(yīng)混合物在指示反應(yīng)條件下的熒光響應(yīng):+RFD-EC1/+ RDS/+ E. coli (blue line);  RFD-EC1/+ RDS/+ E. coli (green line);  RFD-EC1/+ RDS/-E. coli (red line); + RFD-EC1/+ RDS/-E. coli (pink line)。(c) Naica Prism3閱讀器圖像(左)、CLSM圖像(中)和熒光顯微鏡圖像(右)為微晶芯片液滴的大小。比例尺:1.4 mm(左)和100 mm(中、右)。指示反應(yīng)條件下dDRCA系統(tǒng)的熒光圖像和熒光滴數(shù):(d)+RFD-EC1/+ RDS/+ E. coli;(e)-RFD-EC1/+ RDS/+ E. coli; (f) -RFD-EC1/+ RDS/  E. coli; (g) + RFD-EC1/+ RDS/  E. coli.使用Naica Prism3閱讀器對生成的熒光液滴進(jìn)行成像和分析。dDRCA系統(tǒng)能夠在75分鐘內(nèi)選擇性計數(shù)具有單細(xì)胞敏感性的大腸桿菌,包括20分鐘的細(xì)胞裂解時間、12分鐘的液滴生成時間和43分鐘的液滴反應(yīng)時間。通過比較其他三種常見細(xì)菌,包括枯草芽孢桿菌(B.subtilis)、酸性乳片球菌(P.acidilactici)和唐菖蒲伯克霍爾德菌(B.gladioli)存在時的信號反應(yīng),也檢查了dDRCA檢測大腸桿菌的選擇性。當(dāng)用緩沖液或尿液中的這些意外靶點測試每個dDRCA系統(tǒng)時,未觀察到明顯的熒光液滴(圖4c和S4?)。▲圖4(a)不同大腸桿菌濃度(每毫升細(xì)胞數(shù))下dDRCA反應(yīng)的熒光圖像。比例尺:1.4 mm。(b) 不同濃度下計數(shù)的液滴數(shù)與大腸桿菌之間的關(guān)系。提供了計數(shù)的液滴數(shù)量,插圖顯示了1–104大腸桿菌范圍內(nèi)的線性反應(yīng)。誤差條代表三個獨(dú)立實驗的標(biāo)準(zhǔn)偏差。(c) dDRCA的特異性。最終證明了dDRCA系統(tǒng)在尿路感染(UTI)診斷中的潛在臨床適用性。分析了20份患者和健康獻(xiàn)血者的臨床尿樣。整個操作程序包括:(1)細(xì)胞收集和裂解(25分鐘);(2) 液滴生成(12分鐘);(3) 液滴反應(yīng)(43分鐘)。如圖5c所示,五個尿樣,即ID 6、8、9、12和14,比其他尿樣產(chǎn)生大量熒光液滴(>3000)。使用傳統(tǒng)的大腸桿菌培養(yǎng)方法進(jìn)一步確認(rèn)了這些有無大腸桿菌感染的樣本(圖5d)。因此,對UTI的診斷有很大的希望?!鴪D5(a)檢測尿液樣本中的大腸桿菌。(b) 顯示尿液樣本中計數(shù)數(shù)與大腸桿菌細(xì)胞在1-104范圍內(nèi)的線性相關(guān)性的曲線圖。(c) 20份臨床尿液樣本中陽性液滴的數(shù)量。(d) CLED(胱氨酸、乳糖電解質(zhì)缺乏)瓊脂細(xì)菌尿液培養(yǎng)板。黃色菌落代表大腸桿菌在37℃的CLED瓊脂中培養(yǎng)22小時后的生長。該系統(tǒng)能夠在不到1.5小時的分析時間內(nèi),從20份臨床尿液樣本中成功識別出5名UTI患者,而傳統(tǒng)的基于培養(yǎng)的方法需要數(shù)小時。naica?六通道數(shù)字PCR系統(tǒng)法國Stilla Technologies公司naica?六通道數(shù)字PCR系統(tǒng),源于Crystal微滴芯片式數(shù)字PCR技術(shù),自動化微滴生成和擴(kuò)增,每個樣本孔可實現(xiàn)6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時內(nèi)即可獲得至少6個靶標(biāo)基因的絕對拷貝數(shù)濃度。
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