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【深藍(lán)云直播課】Echo顯微鏡使用技巧—Rebel

艾普拜生物科技(蘇州)有限公司 2020-08-24 15:00:55 607  瀏覽
  • 顯微鏡是由一個透鏡或幾個透鏡的組合構(gòu)成的一種光學(xué)儀器,是人類進(jìn)入原子時代的標(biāo)志。顯微鏡是人類最偉大的發(fā)明物之一,那么該如何使用顯微鏡呢?長期使用顯微鏡的小伙伴們,長期觀察目鏡筒是否會感到眼睛酸澀?想要分享視野中的發(fā)現(xiàn)時是否會困擾如何去跟別人描述新發(fā)現(xiàn)的位置?想要記錄視野圖像時是否需要反復(fù)的找合適角度拍照?


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    直播課



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【深藍(lán)云直播課】Echo顯微鏡使用技巧—Rebel

顯微鏡是由一個透鏡或幾個透鏡的組合構(gòu)成的一種光學(xué)儀器,是人類進(jìn)入原子時代的標(biāo)志。顯微鏡是人類最偉大的發(fā)明物之一,那么該如何使用顯微鏡呢?長期使用顯微鏡的小伙伴們,長期觀察目鏡筒是否會感到眼睛酸澀?想要分享視野中的發(fā)現(xiàn)時是否會困擾如何去跟別人描述新發(fā)現(xiàn)的位置?想要記錄視野圖像時是否需要反復(fù)的找合適角度拍照?


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直播課



2020-08-24 15:00:55 607 0
深藍(lán)云網(wǎng)絡(luò)直播講座預(yù)告 | 遇見ECHO REVOLVE——玩“轉(zhuǎn)”顯微鏡

您是否有過長時間觀察顯微鏡而眼睛酸澀?您是否有過為觀察玻片和培養(yǎng)皿而在兩臺顯微鏡之間奔波?您是否有過為觀察傳統(tǒng)顯微鏡繁冗操作而愁苦?

不必說明場全視野觀察,高清晰顯示,極簡化操作;也不必說熒光模塊自動轉(zhuǎn)換,多通道熒光疊加,圖像輔助編輯;單是正倒置一體式觀察,就備受科研工作者的青睞。

尊重傳統(tǒng),勇于創(chuàng)新,來自ECHO公司的顯微鏡REVOLVE采用IPAD替代傳統(tǒng)目鏡,釋放您的雙眼;明場/熒光雙相機雙光源,提高觀察效果;APP軟件控制,簡化顯微操作;給您帶來不一樣的觀察體驗!

大家知道顯微觀察中,正置顯微鏡更適合于玻片觀察、油鏡觀察;倒置顯微鏡則更適合于培養(yǎng)皿/培養(yǎng)瓶觀察、孔板觀察,不僅如此,往往還需要明場與熒光觀察。因此,一臺顯微鏡滿足以上所有需要,就顯得彌足珍貴。

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2020-04-13 17:12:41 292 0
深藍(lán)云直播課:實時熒光定量PCR的關(guān)鍵數(shù)據(jù)及常見問題分析

實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)已成為分子生物學(xué)研究不可或缺的一種技術(shù)手段,常見應(yīng)用于基因表達(dá)分析、腫瘤疾病診斷、病原微生物檢測、食品安全分析和動植物育種等。qPCR檢測技術(shù)由于具有高靈敏度的特性,應(yīng)盡量避免操作中的實驗誤差,確保獲得可靠真實的數(shù)據(jù)。那么如何確保實驗數(shù)據(jù)的可靠性和真實性,則需要通過對qPCR關(guān)鍵數(shù)據(jù)的評估來進(jìn)行判斷。除此之外,如何分析qPCR異常數(shù)據(jù),也是每一位qPCR實驗者需要經(jīng)歷的必要環(huán)節(jié)。


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2020-07-31 09:20:34 519 0
深藍(lán)云直播課堂視頻新聞回放上線啦

你想從Western Blot小白進(jìn)階到實驗高手嗎?想了解Z先進(jìn)的數(shù)字PCR定量技術(shù)嗎?想了解新冠病毒數(shù)字PCR檢測方案嗎?想知道不一樣的正倒置一體熒光顯微鏡嗎?想了解實時熒光定量PCR原理與分析方法嗎?你想知道的問題都在深藍(lán)云直播課堂。

有些朋友說因時間關(guān)系,沒能趕上直播講座,沒關(guān)系, 小編為您雙手奉上精彩的直播視頻分享~



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2020-04-29 16:56:59 445 0
深藍(lán)云直播課堂-如何獲得高質(zhì)量的引物和探針?

對于做分子生物學(xué)實驗的科研人員來說,引物探針是一個無比熟悉的詞語。不管是普通的PCR、實時熒光定量PCR(qPCR)還是靈敏度及jing準(zhǔn)度更高的數(shù)字PCR(dPCR),高質(zhì)量的引物和探針都是實驗成功的關(guān)鍵。

然而想要獲得的引物探針,得到一個好的實驗結(jié)果也并非那么容易。好的實驗結(jié)果千篇一律,不好的實驗結(jié)果各不相同,可能一不小心就有了非特異性產(chǎn)物或者擴增不出產(chǎn)物等等。從實驗小白到大神,不斷地學(xué)習(xí)和摸索是少不了的。針對不同的PCR在引物和探針設(shè)計上又有哪些不同呢?如何評估設(shè)計的引物和探針的質(zhì)量呢?為了讓您少走彎路,深藍(lán)云直播間與您在線交流如何獲得更優(yōu)的qPCR、dPCR引物及探針,為您的實驗助一份力!



2020-04-20 09:18:15 419 0
深藍(lán)云直播課堂: MIQE指南下數(shù)字PCR技術(shù)文章發(fā)表

目前,越來越多的領(lǐng)域都會用到數(shù)字PCR(dPCR)技術(shù),但關(guān)于實驗細(xì)節(jié)和結(jié)果評估缺少一個共識。在很多發(fā)表的文章中都缺乏足夠的dPCR實驗細(xì)節(jié),這樣不利于評審文章,甚至難以根據(jù)文章重復(fù)實驗。

為了讓大家更好地遵循MIQE進(jìn)行實驗,科學(xué)家依托于法國Stilla Technologies的Naica數(shù)字PCR平臺發(fā)布了一篇文章Reproducible and Sensitive Assays using 3-and 6-colour Crystal Digital PCR? for Detecting Point Mutations in Human Breast Cancer,通過6色熒光數(shù)字PCR技術(shù)檢測了乳腺癌相關(guān)靶點,并借此闡述了整個數(shù)字PCR操作流程以及如何運用MIQE。


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2020-07-17 16:51:12 870 0
深藍(lán)云直播課堂 | 單重PCR到多重PCR實驗設(shè)計

PCR技術(shù)以特異性的寡核苷酸引物放大擴增特定的DNA片段,一對引物在單次反應(yīng)擴增單個基因。通常每個靶標(biāo)分別進(jìn)行檢測,即單重PCR反應(yīng),但當(dāng)我們需要檢測多個靶標(biāo)基因時,單重PCR費時費力同時無法排除不同樣品孔間的加樣差異,如內(nèi)參基因的歸一化檢測,需要在同一反應(yīng)管中檢測內(nèi)參基因和目標(biāo)基因,多重PCR實驗無疑是最簡單直接的解決方案。

多重PCR也稱復(fù)合PCR,是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上改進(jìn)并發(fā)展起來的一種PCR擴增技術(shù),即可在一個反應(yīng)體系中加入兩對以上引物,同時擴增出多個核酸片段。在熒光定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(digital PCR)技術(shù)中,多重PCR設(shè)計配合多熒光通道可以進(jìn)行更多靶標(biāo)的相對于標(biāo)準(zhǔn)品的檢測和直接的JD定量檢測,既具有單重PCR的敏感性和特異性,同時又比單重PCR更加GX、快捷和經(jīng)濟。

多重PCR實驗具體如何進(jìn)行?又有哪些注意事項?實時熒光定量PCR和數(shù)字PCR如何和多重PCR結(jié)合?北京深藍(lán)云生物科技有限公司云課堂將為您答疑解惑。

想要了解更多關(guān)于單重PCR和多重PCR實驗設(shè)計的相關(guān)信息,快來參加5月13號的直播課堂吧!


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2021-05-08 09:36:15 425 0
深藍(lán)云網(wǎng)絡(luò)直播講座預(yù)告 | 實時熒光定量PCR原理與分析方法

2020-03-23 10:04:57 342 0
深藍(lán)云網(wǎng)絡(luò)直播講座預(yù)告 | 如何跳出Western Blot設(shè)下的陷阱

做蛋白研究的小伙伴都知道,一個完整的Western Blot包括了很多個步驟,從蛋白提取到配膠、上樣電泳,再到轉(zhuǎn)膜、封閉,Z后孵育一抗二抗后才能進(jìn)行檢測。時間跨度非常長,而且這中間的每一步都包含了很多的小細(xì)節(jié),稍有不慎就會導(dǎo)致結(jié)果出錯,然后又得從頭來過。所以,關(guān)于WB,幾乎每一經(jīng)驗豐富的實驗老手都有著一本厚厚的血淚史。



2020-03-26 14:06:12 393 0
【深藍(lán)云直播課堂】Naica數(shù)字PCR技術(shù)用于基因編輯和多重突變檢測

基因編輯技術(shù)指能夠讓人類對目標(biāo)基因進(jìn)行“編輯”,實現(xiàn)對特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技術(shù)自問世以來,就有著其它基因編輯技術(shù)無可比擬的優(yōu)勢,技術(shù)不斷改進(jìn)后,更被認(rèn)為能夠在活細(xì)胞中最有效、最便捷地“編輯”任何基因。



但是在CRISPR基因編輯之后,工作并沒有結(jié)束,你需要驗證感興趣的基因是否成功突變。想知道如何利用高靈敏度、高jingzhun度的數(shù)字PCR技術(shù)來檢測基因編輯嗎?快來參加本次深藍(lán)云直播課堂吧!



2020-08-17 12:22:13 462 0
生物工程哪些課需要用顯微鏡
生物工程哪些課需要用顯微鏡... 生物工程哪些課需要用顯微鏡 展開
2018-11-28 11:08:17 444 0
顯微鏡|Echo Revolve顯微鏡在血腦屏障功能研究中的

血腦屏障 (BBB) 是哺乳動物的一種特殊結(jié)構(gòu),通過調(diào)節(jié)血液和血液之間離子、氧氣和營養(yǎng)物質(zhì)的流入和流出,將大腦與血液分開,并維持zhongshu神經(jīng)系統(tǒng) (CNS) 的穩(wěn)態(tài)。該屏障主要由腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞 (BMEC)、星形膠質(zhì)細(xì)胞和周細(xì)胞組成。

轉(zhuǎn)化生長因子β1 (TGFβ1) 是轉(zhuǎn)化生長因子β (TGFβ) 家族成員之一,是一種多效性細(xì)胞因子,在多種病理和生理過程中發(fā)揮重要作用。

Hedgehog信號通路是重要的信號傳導(dǎo)通路,在多個物種中是保守的,并且在生理和病理過程的許多方面發(fā)揮著重要作用。典型Hedgehog信號由三種分泌配體Shh、Ihh和Dhh激活,細(xì)胞間信號由轉(zhuǎn)錄因子Gli1、Gli2和Gli3轉(zhuǎn)導(dǎo)。在zhongshu神經(jīng)系統(tǒng)中,Hedgehog信號通路決定了神經(jīng)管的形成和發(fā)育。

目前,已有研究表明Hedgehog信號與TGFβ1級聯(lián)反應(yīng)在癌癥發(fā)展和轉(zhuǎn)移中的相互作用。那么Hedgehog信號和TGFβ1級聯(lián)反應(yīng)之間的串?dāng)_是否會影響血腦屏障的功能呢,目前還尚不清晰。

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點實驗室和湖北省預(yù)防獸醫(yī)學(xué)重點實驗室聯(lián)合在Brain Sciences雜志上發(fā)表了一篇名為《Astrocyte-Derived TGFβ1 Facilitates Blood–Brain Barrier Function via Non-Canonical Hedgehog Signaling in Brain Microvascular Endothelial Cells》,該文闡明了TGFβ1 介導(dǎo)的星形膠質(zhì)細(xì)胞和大腦內(nèi)皮細(xì)胞之間的細(xì)胞間交流,這一發(fā)現(xiàn)將拓寬關(guān)于血腦屏障內(nèi)穩(wěn)態(tài)的現(xiàn)有知識,也可能有助于進(jìn)一步改善血腦屏障功能障礙的治療策略。

作者通過構(gòu)建人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞 (hBMECs) 與U251的單培養(yǎng)和共培養(yǎng)模型,證實了星形膠質(zhì)細(xì)胞衍生的TGFβ1增強了BMECs的屏障功能。實時熒光定量PCR、免疫印跡和酶聯(lián)免疫吸附試驗等多種實驗表明TGFβ1在BMECs中觸發(fā)Smad2/3的激活增加了Gli2的表達(dá),Gli2是Hedgehog信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。Gli2與ZO-1啟動子結(jié)合,增強ZO-1的表達(dá),從而維持血腦屏障。星形膠質(zhì)細(xì)胞來源的TGFβ1觸發(fā)BMECs中的TGFβ1-TGFBRII-Smad2/3-Gli1/2-ZO-1軸并維持正常的BBB功能。

文中作者通過免疫熒光技術(shù),利用Echo Revolve正倒置一體顯微鏡進(jìn)行免疫熒光觀察。使用50ng/mL的重組TGFβ1 (rTGFβ1) 來刺激單層hBMECs,BMECs用綠色CD31標(biāo)記,結(jié)果表明與對照組相比,ZO-1表達(dá)顯著增加。

用4mg/kg的TGFβ/Smads信號抑制劑SD208處理小鼠,圖中虛線環(huán)表示BMECs中的Gli1或Gli2的表達(dá)量,結(jié)果表明與對照組相比,ZO-1、 Gli1和Gli2表達(dá)量均減少。

內(nèi)皮屏障功能方面發(fā)揮重要作用,提高了對血腦屏障功能的研究。這一發(fā)現(xiàn)也可能表明未來有可能使用TGFβ1和Hedgehog信號級聯(lián)來輔助治療血腦屏障功能障礙。


參考文獻(xiàn):

Fu J, Li L, Huo D, et al. Astrocyte-Derived TGFβ1 Facilitates Blood-Brain Barrier Function via Non-Canonical Hedgehog Signaling in Brain Microvascular Endothelial Cells. Brain Sci. 2021;11(1):77. Published 2021 Jan 8. doi:10.3390/brainsci11010077


2021-11-25 09:36:17 374 0
【日立直播課】原子吸收分光光度計常見問題解析

課程大綱與簡介

1.原子吸收分光光度計基本原理和結(jié)構(gòu)

2.火焰法中常見的問題與解決方案

3.石墨爐法中常見的問題與解決方案

 

課程亮點

1.出現(xiàn)進(jìn)樣問題時,如何進(jìn)行問題排除和解決?

2.出現(xiàn)低靈敏度、線性差,重現(xiàn)性和回收率不良等問題時應(yīng)采取哪些措施?

 

直播時間:3月17日  15:00-16:00

培訓(xùn)費用:免費

聽課方式:日立微學(xué)院(提交表單后掃碼進(jìn)群)

 

為了給您帶來更優(yōu)質(zhì)的服務(wù),感謝您抽出1分鐘填寫表單完善需求。


表單地址:https://jinshuju.net/f/h2e7Gt


2020-03-16 10:50:20 376 0
深藍(lán)云qPCR知識小課堂---TaqMan探針法

在之前發(fā)表的文章《實時熒光定量PCR檢測方法,你選對了嗎?》中提到,實時熒光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探針法、分子信標(biāo)、熒光共振能量傳遞(FRET)和LUX Primers等。那么應(yīng)用最為廣泛的則是SYBR Green染料法和TaqMan探針法,兩者各有所長。今天,先給大家介紹TaqMan探針法,它優(yōu)秀在哪里?

TaqMan 探針法

最關(guān)鍵的Taqman探針,是一條與靶序列特異性結(jié)合的寡核苷酸序列,其能夠結(jié)合到正反向引物結(jié)合區(qū)域的中間部位,隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,DNA聚合酶在延伸到探針位置時會將其水解,從而釋放熒光基團,擴增產(chǎn)物產(chǎn)生信號。

TaqMan探針法的優(yōu)勢

?  高特異性,只有在探針和靶標(biāo)基因之間發(fā)生特異性的水解,才會生成熒光信號。

?  多重分析,可選擇不同的報告基因染料標(biāo)記探針,在一個反應(yīng)管內(nèi)擴增并檢測多個不同的序列。

?  無需PCR后處理,減少分析工作量并節(jié)省材料成本。

探針序列的設(shè)計原則

1. TaqMan探針的長度zuihao不超過30bp。理想情況下,有15bp可獲得ZJ特異性;

2. Tm值在67℃-72℃之間,確保探針的Tm值比引物的高5-10℃,在退火過程中優(yōu)先結(jié)合到模板上;

3. 探針序列的GC含量在20%至80%之間,避免多個重復(fù)的堿基出現(xiàn),尤其要避免4個或超過4個的G堿基;

4. 探針盡量避免出現(xiàn)二聚體或者發(fā)夾結(jié)構(gòu),以保證足夠高的模板結(jié)合效率;

5. 探針5’端不能為G,因為即使單個G堿基與FAM熒光報告基團相連時,G也可以淬滅FAM基團所發(fā)出的熒光信號,從而導(dǎo)致假陰性的出現(xiàn)。

引物探針設(shè)計不再犯愁

深藍(lán)云生物為您提供Gene-π網(wǎng)站在線設(shè)計引物探針,可為您快速設(shè)計引物探針并進(jìn)行評估,復(fù)制鏈接可進(jìn)行查詢:https://www.gene-pi.com/item/primers-and-probes-2/

如何選擇熒光基團和淬滅基團

修飾基團的選擇是探針法的重要環(huán)節(jié),那么我們需要注意以下幾項:

1. 根據(jù)熒光定量PCR儀熒光通道,選擇適配的熒光基團,優(yōu)先選擇常用的熒光基團,如FAM、VIC或CY5等;

2. 根據(jù)熒光基團類型選擇淬滅基團。早期的淬滅基團TAMRA,自身會發(fā)出熒光信號,干擾檢測結(jié)果,后續(xù)慢慢地被其他淬滅基團替代。目前淬滅基團最常用的就是BHQ、NFQ-MGB或QSY等;

3. 進(jìn)行多重qPCR檢測時,每個通道要選擇不同的熒光基團,且避免各標(biāo)記基團的激發(fā)和發(fā)射波長重疊,出現(xiàn)熒光干擾的情況。

Azure Cielo?實時熒光定量PCR

來自美國Azure Biosystems公司的Azure Cielo?實時熒光定量PCR系統(tǒng),為您提供Azure Cielo-3通道和Azure Cielo-6通道,可根據(jù)實驗需求靈活配置。


除此之外,Azure Cielo?實時熒光定量PCR系統(tǒng)融合了高品質(zhì)Peltier溫度模塊和基于光纖傳輸?shù)墓鈱W(xué)檢測系統(tǒng),可為您的科學(xué)研究就提供高jingzhun、高靈敏可靠結(jié)果。



?   數(shù)據(jù)可靠性

連續(xù)1000次實驗后,結(jié)果高度一致,溫控jingzhun,性能穩(wěn)定可靠。

?  應(yīng)用靈活性

提供多種qPCR應(yīng)用分析,定制化報告。

?   流程智能化

中英文用戶界面,觸控操作,可多機聯(lián)用。

?   交互靈活性

主機可獨立運行qPCR程序,電腦、Wi-Fi、網(wǎng)絡(luò)交互。


2020-07-24 16:53:08 1398 0
直播課發(fā)布:Western Blot歸一化方法介紹

做Western Blot的小伙伴,是不是還在為選擇何種歸一化方法而糾結(jié),看家蛋白還是總蛋白?期刊都推薦總蛋白了,那看家蛋白數(shù)據(jù)還能用嗎?看家蛋白有哪些優(yōu)點和挑戰(zhàn),需要注意什么?如何選擇看家蛋白呢?如選擇總蛋白歸一化,用什么總蛋白試劑進(jìn)行歸一化,如何進(jìn)行歸一化,優(yōu)點和挑戰(zhàn)是什么?


本周邀請Azure Biosystems產(chǎn)品應(yīng)用專家劉楚珠給正在迷茫中的小伙伴解惑。


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2020-08-07 17:44:26 414 0
深藍(lán)云干貨課堂——如何抓住qPCR數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵

同學(xué)們又是做qPCR實驗的一天,有沒有懷著忐忑又期待的心情去點開“analysis”的呢?點開之后,發(fā)現(xiàn)擴增曲線不正常,或者Cq值過大,又或者SD值太高,那這樣的實驗結(jié)果還靠譜嗎?現(xiàn)在讓小編來告訴你,qPCR實驗的成功與否,關(guān)鍵在于各組數(shù)據(jù)是否達(dá)到判定標(biāo)準(zhǔn)以及是否符合實驗預(yù)期,小小的qPCR實驗它可以變得很簡單,也可以變得很復(fù)雜,如何抓住qPCR數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵,是分析qPCR結(jié)果可信度的diyi步。

qPCR數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵

qPCR數(shù)據(jù)分析主要是利用Cq值進(jìn)行計算,所以我們需要了解qPCR反應(yīng)中幾個重要的參數(shù),根據(jù)參數(shù)的表現(xiàn)來進(jìn)行實驗評估:


擴增曲線:圖1反映的是熒光信號變化量的對數(shù)與qPCR反應(yīng)循環(huán)數(shù)的關(guān)系。圖2反映的是隨著qPCR反應(yīng)的進(jìn)行相應(yīng)的熒光信號的變化,比較直觀,但是指數(shù)期很短。標(biāo)準(zhǔn)的擴增曲線是呈現(xiàn)出“S”型,具有特征性的形狀:首先背景信號,然后是三個增長階段(指數(shù)增長期、線性增長期和平臺期)。


圖1:擴增曲線對數(shù)圖譜。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

圖2:擴增曲線線性圖譜。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

基線:通常3-15個循環(huán)時,熒光信號變化不大,變化趨勢接近于一條直線,即擴增曲線的水平部分,這樣的直線就是基線。同一次反應(yīng)中針對不同的基因需單獨設(shè)置基線。

閾值:是一個熒光強度值,穿過閾值與X軸平行的直線稱為閾值線,自動設(shè)置是3-15個循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。手動設(shè)置是置于指數(shù)擴增期,剛好可以清楚地看到熒光信號明顯增強。同一次反應(yīng)中針對不同的基因可單獨設(shè)置閾值,但對于同一個基因擴增一定要用同一個閾值。

Cq值:qPCR擴增過程中,擴增產(chǎn)物的熒光信號達(dá)到設(shè)定的閾值時所經(jīng)過的擴增循環(huán)次數(shù),與起始濃度的對數(shù)成線性關(guān)系。分析定量時一般取Cq:15-35,太大或者太小都會導(dǎo)致定量的不準(zhǔn)確。

圖3:擴增曲線。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

評估qPCR反應(yīng)的效果

1、擴增效率及相關(guān)系數(shù)

為了正確地評估PCR擴增效率,至少需要做3次平行重復(fù),并至少做5個數(shù)量級倍數(shù)(5logs)連續(xù)梯度稀釋模板濃度。擴增效率E在90-110%之間時,認(rèn)為擴增接近理想情況。

R2值:評估PCR效率的另一個關(guān)鍵參數(shù),它是說明兩個數(shù)值之間相關(guān)程度的統(tǒng)計學(xué)術(shù)語。如果R2等于1,則可以用Y值(Cq)來準(zhǔn)確預(yù)測X值(初始模板量)。反之,如果R2等于0,就不能通過Y值來預(yù)測X值。一般認(rèn)為,標(biāo)準(zhǔn)曲線的R2值大于0.98時,兩個數(shù)值之間相關(guān)的可信度很好。

圖4:標(biāo)準(zhǔn)曲線。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

2、重復(fù)性

重復(fù)性即是指精確度,反映多次測量值之間的接近程度。標(biāo)準(zhǔn)偏差(standarddeviation,偏差的平方根)是最常用的精確度計量方法。如果許多數(shù)據(jù)點都靠近平均值,那么標(biāo)準(zhǔn)偏差就??;如果許多數(shù)據(jù)點都遠(yuǎn)離平均值,則標(biāo)準(zhǔn)偏差就大。例如,假設(shè)PCR反應(yīng)效率是100%,那么2倍稀釋點之間的平均Cq間隔應(yīng)該恰為1個Cq值。要以99.7%的幾率分辨2倍稀釋濃度,標(biāo)準(zhǔn)偏差就必須小于等于0.167。為了能夠在95%以上的情況下分辨出2倍稀釋,標(biāo)準(zhǔn)偏差必須小于等于0.250??偟膩碚f,重復(fù)孔之間的標(biāo)準(zhǔn)偏差不大于0.2,說明實驗的重復(fù)性較好。

圖5:8個重復(fù)孔的擴增曲線。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

3、重現(xiàn)性

指不同批次之間或不同實驗室之間qPCR結(jié)果的變化,通常表示為拷貝數(shù)或Cq值的SD或CV。

圖6:4臺獨立的Azure Cielo 儀器上檢測GAPDH,Cq =20.11,SD= 0.002。

4、靈敏度

分析靈敏度是指一個樣本中可通過實驗精確測量的最小拷貝數(shù),而臨床靈敏度是指在特定疾病患者們中,被檢測確定為陽性的百分比。靈敏度為limit of detection(LOD),即在給定的分析程序中,可以確定且合理(通常使用95%的概率)檢測得到的濃度,可通過梯度稀釋樣品來確定ZD檢測限。LOD理論上最小是3 copy/aliquot,這是由遵從泊松分布的取樣誤差導(dǎo)致的。假設(shè)符合泊松分布,那PCR有95%的可能性至少包含和檢測到1個拷貝。

圖7:5個數(shù)量級的動態(tài)范圍檢測。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

5、準(zhǔn)確度

反映測量值和真實值的接近程度,以倍數(shù)變化或拷貝數(shù)進(jìn)行估算。

6、特異性

指qPCR實驗中只可以檢測到目的基因,引物特異性擴增靶序列,而不會擴增其他基因序列??赏ㄟ^凝膠電泳檢測擴增產(chǎn)物是否為單一條帶,或通過qPCR反應(yīng),根據(jù)溶解曲線是否具有單峰來判斷。

圖8:溶解曲線。圖源:Azure Cielo qPCR系統(tǒng)。

Azure Cielo?實時熒光定量PCR系統(tǒng)

來自美國Azure Biosystems公司的Azure Cielo?實時熒光定量PCR系統(tǒng),為您提供Azure Cielo-3通道和Azure Cielo-6通道,可根據(jù)實驗需求靈活配置。該系統(tǒng)融合了高品質(zhì)Peltier溫度模塊和基于光纖傳輸?shù)墓鈱W(xué)檢測系統(tǒng),可為您的科學(xué)研究就提供高jingzhun、高靈敏可靠結(jié)果。

Azure  Cielo?性能展示

?   高重現(xiàn)性和穩(wěn)定性

連續(xù)1000次實驗后,結(jié)果高度一致
GAPDH定量,Cq值=22.4±0.01

?  高重復(fù)性

重復(fù)孔的擴增曲線高度重合

96孔重復(fù)結(jié)果(GAPDH),Cq平均值=19.1,

變異系數(shù)(Cv)=0.002。

?   高分辨率

準(zhǔn)確區(qū)分2倍濃度差異樣品

人內(nèi)參cDNA(GAPDH)進(jìn)行10個梯度,

2倍稀釋,3個重復(fù),線性擬合度

R2=0.998,擴增效率E=99.89%


2020-08-11 19:12:33 1065 0

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