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深藍(lán)云直播課堂 | 單重PCR到多重PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

艾普拜生物科技(蘇州)有限公司 2021-05-08 09:36:15 423  瀏覽
  • PCR技術(shù)以特異性的寡核苷酸引物放大擴(kuò)增特定的DNA片段,一對引物在單次反應(yīng)擴(kuò)增單個(gè)基因。通常每個(gè)靶標(biāo)分別進(jìn)行檢測,即單重PCR反應(yīng),但當(dāng)我們需要檢測多個(gè)靶標(biāo)基因時(shí),單重PCR費(fèi)時(shí)費(fèi)力同時(shí)無法排除不同樣品孔間的加樣差異,如內(nèi)參基因的歸一化檢測,需要在同一反應(yīng)管中檢測內(nèi)參基因和目標(biāo)基因,多重PCR實(shí)驗(yàn)無疑是最簡單直接的解決方案。

    多重PCR也稱復(fù)合PCR,是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上改進(jìn)并發(fā)展起來的一種PCR擴(kuò)增技術(shù),即可在一個(gè)反應(yīng)體系中加入兩對以上引物,同時(shí)擴(kuò)增出多個(gè)核酸片段。在熒光定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(digital PCR)技術(shù)中,多重PCR設(shè)計(jì)配合多熒光通道可以進(jìn)行更多靶標(biāo)的相對于標(biāo)準(zhǔn)品的檢測和直接的JD定量檢測,既具有單重PCR的敏感性和特異性,同時(shí)又比單重PCR更加GX、快捷和經(jīng)濟(jì)。

    多重PCR實(shí)驗(yàn)具體如何進(jìn)行?又有哪些注意事項(xiàng)?實(shí)時(shí)熒光定量PCR和數(shù)字PCR如何和多重PCR結(jié)合?北京深藍(lán)云生物科技有限公司云課堂將為您答疑解惑。

    想要了解更多關(guān)于單重PCR和多重PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的相關(guān)信息,快來參加5月13號的直播課堂吧!


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深藍(lán)云直播課堂 | 單重PCR到多重PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

PCR技術(shù)以特異性的寡核苷酸引物放大擴(kuò)增特定的DNA片段,一對引物在單次反應(yīng)擴(kuò)增單個(gè)基因。通常每個(gè)靶標(biāo)分別進(jìn)行檢測,即單重PCR反應(yīng),但當(dāng)我們需要檢測多個(gè)靶標(biāo)基因時(shí),單重PCR費(fèi)時(shí)費(fèi)力同時(shí)無法排除不同樣品孔間的加樣差異,如內(nèi)參基因的歸一化檢測,需要在同一反應(yīng)管中檢測內(nèi)參基因和目標(biāo)基因,多重PCR實(shí)驗(yàn)無疑是最簡單直接的解決方案。

多重PCR也稱復(fù)合PCR,是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上改進(jìn)并發(fā)展起來的一種PCR擴(kuò)增技術(shù),即可在一個(gè)反應(yīng)體系中加入兩對以上引物,同時(shí)擴(kuò)增出多個(gè)核酸片段。在熒光定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(digital PCR)技術(shù)中,多重PCR設(shè)計(jì)配合多熒光通道可以進(jìn)行更多靶標(biāo)的相對于標(biāo)準(zhǔn)品的檢測和直接的JD定量檢測,既具有單重PCR的敏感性和特異性,同時(shí)又比單重PCR更加GX、快捷和經(jīng)濟(jì)。

多重PCR實(shí)驗(yàn)具體如何進(jìn)行?又有哪些注意事項(xiàng)?實(shí)時(shí)熒光定量PCR和數(shù)字PCR如何和多重PCR結(jié)合?北京深藍(lán)云生物科技有限公司云課堂將為您答疑解惑。

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2021-05-08 09:36:15 423 0
深藍(lán)云直播課堂: MIQE指南下數(shù)字PCR技術(shù)文章發(fā)表

目前,越來越多的領(lǐng)域都會用到數(shù)字PCR(dPCR)技術(shù),但關(guān)于實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)和結(jié)果評估缺少一個(gè)共識。在很多發(fā)表的文章中都缺乏足夠的dPCR實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié),這樣不利于評審文章,甚至難以根據(jù)文章重復(fù)實(shí)驗(yàn)。

為了讓大家更好地遵循MIQE進(jìn)行實(shí)驗(yàn),科學(xué)家依托于法國Stilla Technologies的Naica數(shù)字PCR平臺發(fā)布了一篇文章Reproducible and Sensitive Assays using 3-and 6-colour Crystal Digital PCR? for Detecting Point Mutations in Human Breast Cancer,通過6色熒光數(shù)字PCR技術(shù)檢測了乳腺癌相關(guān)靶點(diǎn),并借此闡述了整個(gè)數(shù)字PCR操作流程以及如何運(yùn)用MIQE。


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2020-07-17 16:51:12 870 0
深藍(lán)云直播課堂視頻新聞回放上線啦

你想從Western Blot小白進(jìn)階到實(shí)驗(yàn)高手嗎?想了解Z先進(jìn)的數(shù)字PCR定量技術(shù)嗎?想了解新冠病毒數(shù)字PCR檢測方案嗎?想知道不一樣的正倒置一體熒光顯微鏡嗎?想了解實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理與分析方法嗎?你想知道的問題都在深藍(lán)云直播課堂。

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2020-04-29 16:56:59 445 0
【深藍(lán)云直播課堂】Naica數(shù)字PCR技術(shù)用于基因編輯和多重突變檢測

基因編輯技術(shù)指能夠讓人類對目標(biāo)基因進(jìn)行“編輯”,實(shí)現(xiàn)對特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技術(shù)自問世以來,就有著其它基因編輯技術(shù)無可比擬的優(yōu)勢,技術(shù)不斷改進(jìn)后,更被認(rèn)為能夠在活細(xì)胞中最有效、最便捷地“編輯”任何基因。



但是在CRISPR基因編輯之后,工作并沒有結(jié)束,你需要驗(yàn)證感興趣的基因是否成功突變。想知道如何利用高靈敏度、高jingzhun度的數(shù)字PCR技術(shù)來檢測基因編輯嗎?快來參加本次深藍(lán)云直播課堂吧!



2020-08-17 12:22:13 462 0
深藍(lán)云網(wǎng)絡(luò)直播講座預(yù)告 | 實(shí)時(shí)熒光定量PCR原理與分析方法

2020-03-23 10:04:57 342 0
深藍(lán)云直播課:實(shí)時(shí)熒光定量PCR的關(guān)鍵數(shù)據(jù)及常見問題分析

實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)已成為分子生物學(xué)研究不可或缺的一種技術(shù)手段,常見應(yīng)用于基因表達(dá)分析、腫瘤疾病診斷、病原微生物檢測、食品安全分析和動(dòng)植物育種等。qPCR檢測技術(shù)由于具有高靈敏度的特性,應(yīng)盡量避免操作中的實(shí)驗(yàn)誤差,確保獲得可靠真實(shí)的數(shù)據(jù)。那么如何確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的可靠性和真實(shí)性,則需要通過對qPCR關(guān)鍵數(shù)據(jù)的評估來進(jìn)行判斷。除此之外,如何分析qPCR異常數(shù)據(jù),也是每一位qPCR實(shí)驗(yàn)者需要經(jīng)歷的必要環(huán)節(jié)。


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直 播 課 

 


2020-07-31 09:20:34 519 0
深藍(lán)云直播課堂-如何獲得高質(zhì)量的引物和探針?

對于做分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的科研人員來說,引物探針是一個(gè)無比熟悉的詞語。不管是普通的PCR、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)還是靈敏度及jing準(zhǔn)度更高的數(shù)字PCR(dPCR),高質(zhì)量的引物和探針都是實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵。

然而想要獲得的引物探針,得到一個(gè)好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果也并非那么容易。好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果千篇一律,不好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果各不相同,可能一不小心就有了非特異性產(chǎn)物或者擴(kuò)增不出產(chǎn)物等等。從實(shí)驗(yàn)小白到大神,不斷地學(xué)習(xí)和摸索是少不了的。針對不同的PCR在引物和探針設(shè)計(jì)上又有哪些不同呢?如何評估設(shè)計(jì)的引物和探針的質(zhì)量呢?為了讓您少走彎路,深藍(lán)云直播間與您在線交流如何獲得更優(yōu)的qPCR、dPCR引物及探針,為您的實(shí)驗(yàn)助一份力!



2020-04-20 09:18:15 417 0
多重PCR的應(yīng)用
 
2018-12-01 08:23:05 622 0
深藍(lán)云生物數(shù)字PCR打卡送書活動(dòng)開啟啦!

第三代PCR技術(shù)即數(shù)字PCR(digtal PCR)技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)對起始樣品核酸的定量。在反應(yīng)體系中加入熒光染料的同時(shí)將反應(yīng)體系進(jìn)行分區(qū),實(shí)現(xiàn)單分子模板擴(kuò)增,Z后通過陽性反應(yīng)器數(shù)直接讀出目標(biāo)序列的拷貝數(shù),可以對低拷貝基因進(jìn)行檢測,彌補(bǔ)了熒光PCR的不足。因其出色的靈敏度和精確度,數(shù)字PCR在檢測微量核酸樣本,稀有突變,拷貝數(shù)變異,復(fù)雜樣品檢測等方面均有廣泛的應(yīng)用前景。


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數(shù)字PCR課堂


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2020-04-13 17:11:09 412 0
深藍(lán)云qPCR知識小課堂---TaqMan探針法

在之前發(fā)表的文章《實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測方法,你選對了嗎?》中提到,實(shí)時(shí)熒光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探針法、分子信標(biāo)、熒光共振能量傳遞(FRET)和LUX Primers等。那么應(yīng)用最為廣泛的則是SYBR Green染料法和TaqMan探針法,兩者各有所長。今天,先給大家介紹TaqMan探針法,它優(yōu)秀在哪里?

TaqMan 探針法

最關(guān)鍵的Taqman探針,是一條與靶序列特異性結(jié)合的寡核苷酸序列,其能夠結(jié)合到正反向引物結(jié)合區(qū)域的中間部位,隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,DNA聚合酶在延伸到探針位置時(shí)會將其水解,從而釋放熒光基團(tuán),擴(kuò)增產(chǎn)物產(chǎn)生信號。

TaqMan探針法的優(yōu)勢

?  高特異性,只有在探針和靶標(biāo)基因之間發(fā)生特異性的水解,才會生成熒光信號。

?  多重分析,可選擇不同的報(bào)告基因染料標(biāo)記探針,在一個(gè)反應(yīng)管內(nèi)擴(kuò)增并檢測多個(gè)不同的序列。

?  無需PCR后處理,減少分析工作量并節(jié)省材料成本。

探針序列的設(shè)計(jì)原則

1. TaqMan探針的長度zuihao不超過30bp。理想情況下,有15bp可獲得ZJ特異性;

2. Tm值在67℃-72℃之間,確保探針的Tm值比引物的高5-10℃,在退火過程中優(yōu)先結(jié)合到模板上;

3. 探針序列的GC含量在20%至80%之間,避免多個(gè)重復(fù)的堿基出現(xiàn),尤其要避免4個(gè)或超過4個(gè)的G堿基;

4. 探針盡量避免出現(xiàn)二聚體或者發(fā)夾結(jié)構(gòu),以保證足夠高的模板結(jié)合效率;

5. 探針5’端不能為G,因?yàn)榧词箚蝹€(gè)G堿基與FAM熒光報(bào)告基團(tuán)相連時(shí),G也可以淬滅FAM基團(tuán)所發(fā)出的熒光信號,從而導(dǎo)致假陰性的出現(xiàn)。

引物探針設(shè)計(jì)不再犯愁

深藍(lán)云生物為您提供Gene-π網(wǎng)站在線設(shè)計(jì)引物探針,可為您快速設(shè)計(jì)引物探針并進(jìn)行評估,復(fù)制鏈接可進(jìn)行查詢:https://www.gene-pi.com/item/primers-and-probes-2/

如何選擇熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)

修飾基團(tuán)的選擇是探針法的重要環(huán)節(jié),那么我們需要注意以下幾項(xiàng):

1. 根據(jù)熒光定量PCR儀熒光通道,選擇適配的熒光基團(tuán),優(yōu)先選擇常用的熒光基團(tuán),如FAM、VIC或CY5等;

2. 根據(jù)熒光基團(tuán)類型選擇淬滅基團(tuán)。早期的淬滅基團(tuán)TAMRA,自身會發(fā)出熒光信號,干擾檢測結(jié)果,后續(xù)慢慢地被其他淬滅基團(tuán)替代。目前淬滅基團(tuán)最常用的就是BHQ、NFQ-MGB或QSY等;

3. 進(jìn)行多重qPCR檢測時(shí),每個(gè)通道要選擇不同的熒光基團(tuán),且避免各標(biāo)記基團(tuán)的激發(fā)和發(fā)射波長重疊,出現(xiàn)熒光干擾的情況。

Azure Cielo?實(shí)時(shí)熒光定量PCR

來自美國Azure Biosystems公司的Azure Cielo?實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng),為您提供Azure Cielo-3通道和Azure Cielo-6通道,可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求靈活配置。


除此之外,Azure Cielo?實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)融合了高品質(zhì)Peltier溫度模塊和基于光纖傳輸?shù)墓鈱W(xué)檢測系統(tǒng),可為您的科學(xué)研究就提供高jingzhun、高靈敏可靠結(jié)果。



?   數(shù)據(jù)可靠性

連續(xù)1000次實(shí)驗(yàn)后,結(jié)果高度一致,溫控jingzhun,性能穩(wěn)定可靠。

?  應(yīng)用靈活性

提供多種qPCR應(yīng)用分析,定制化報(bào)告。

?   流程智能化

中英文用戶界面,觸控操作,可多機(jī)聯(lián)用。

?   交互靈活性

主機(jī)可獨(dú)立運(yùn)行qPCR程序,電腦、Wi-Fi、網(wǎng)絡(luò)交互。


2020-07-24 16:53:08 1398 0
好消息,熱烈祝賀深藍(lán)云數(shù)字PCR獲得“2020生命科學(xué)十大創(chuàng)新產(chǎn)品”大獎(jiǎng)!

生物通“2020生命科學(xué)十大創(chuàng)新產(chǎn)品評選”活動(dòng)自啟動(dòng)以來,受到了各界廣泛的關(guān)注。經(jīng)過一個(gè)月的投票和專家評鑒,2020生命科學(xué)十大創(chuàng)新產(chǎn)品現(xiàn)已揭曉。這些產(chǎn)品或助力新冠病毒的檢測,或從新的角度揭開生物學(xué)的復(fù)雜機(jī)制,有望推動(dòng)基礎(chǔ)研究和臨床轉(zhuǎn)化。

在同類型的產(chǎn)品中,經(jīng)過層層篩選,深藍(lán)云生物的新品:naica?微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng),在同類產(chǎn)品中脫穎而出,獲得2020生命科學(xué)十大創(chuàng)新產(chǎn)品大獎(jiǎng)。


naica?微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)

法國Stilla Technologies公司naica?微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),源于Crystal微滴芯片數(shù)字PCR技術(shù),自動(dòng)化微滴生成和擴(kuò)增,每個(gè)樣本孔可實(shí)現(xiàn)6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時(shí)內(nèi)即可獲得至少6個(gè)靶標(biāo)基因的拷貝數(shù)濃度,融合傳統(tǒng)微滴式和芯片式優(yōu)勢,被稱為下一代數(shù)字PCR技術(shù)。


2021-03-22 16:37:06 277 0
深藍(lán)云Gene-π數(shù)字PCR學(xué)堂: 數(shù)字PCR病毒載量JZ檢測的可靠工具(北京站)圓滿落幕!

2021年4月13日,深藍(lán)云Gene-π數(shù)字PCR學(xué)堂——數(shù)字PCR病毒載量檢測工具(北京站)在國家疾控ZX成功舉辦。為更好的服務(wù)于用戶,本次培訓(xùn)班以理論結(jié)合實(shí)踐的形式,聚焦數(shù)字PCR原理系統(tǒng)、實(shí)驗(yàn)操作、結(jié)果分析,病毒載量檢測等核心內(nèi)容,受到了用戶的一致好評。

數(shù)字PCR技術(shù)的誕生和發(fā)展為核酸定量和核酸檢測提供了全新的思路。無需標(biāo)準(zhǔn)品和標(biāo)準(zhǔn)曲線,可提供比qPCR的核酸定量,直接讀取陽性信號,通過泊松分布校正得到目標(biāo)基因的JD拷貝數(shù),并具有高靈敏度等特點(diǎn)。

本次訓(xùn)練營對第三代數(shù)字PCR技術(shù)及naica??微滴芯片式數(shù)字PCR技術(shù)介紹、naica??數(shù)字PCR核酸JD定量技術(shù)中的病原體檢測應(yīng)用、病毒載體JD拷貝濃度數(shù)字PCR檢測實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、特別是一步法數(shù)字PCR新冠病毒檢測試劑盒的使用和結(jié)果判讀等方面進(jìn)行了詳細(xì)介紹,同時(shí)進(jìn)行實(shí)操。

▲ 專家在進(jìn)行精彩的分享


▲ 實(shí)驗(yàn)操作



作為數(shù)字PCR頭部企業(yè)技術(shù)開創(chuàng)者的法國Stilla Technologies公司于2019年提出數(shù)字PCR在線學(xué)習(xí)資源ZXgene-π學(xué)堂,為使用和即將使用數(shù)字PCR技術(shù)的專家學(xué)者提供有效的途徑,同時(shí)開展Gene-π數(shù)字PCR線下實(shí)操培訓(xùn)課堂,為用戶提供完善的服務(wù)以及優(yōu)化的應(yīng)用解決方案。


naica?微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)

naica?微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng),以Sapphire芯片(全自動(dòng))或Opal(高通量)芯片為耗材,形成25,000-30,000個(gè)微滴的2D陣列,以單層平鋪方式進(jìn)行PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。反應(yīng)完成后對微滴進(jìn)行三色通道或六色通道檢測,從而對起始核酸濃度進(jìn)行JD定量。2.5小時(shí)內(nèi),可快速獲得結(jié)果。



2021-04-15 09:49:06 564 0
核酸提取耗材/PCR管/PCR板系列/PCR單管

     核酸提取耗材/PCR管/PCR板系列/PCR單管本生(天津)健康科技有限公司供應(yīng):移液器吸嘴,ELISA試劑盒,動(dòng)物血清,全系熒光定量PCR耗材,產(chǎn)品包括:PCR單管、八聯(lián)管、96孔板、384孔板。

  PCR耗材容量有0.1ml和0.2ml兩種,顏色有透明和白色兩種,型號有單管、8聯(lián)管、12聯(lián)管,適用普通PCR和qPCR反應(yīng)

  【產(chǎn)品特點(diǎn)】

  無DNA酶和RNA酶,無DNA和RNA

  精度模具充分管壁超薄均勻及產(chǎn)品的均一性,并具備的熱傳導(dǎo)效應(yīng),使管內(nèi)反應(yīng)液以最快的速度達(dá)到目標(biāo)溫度,促進(jìn)樣品擴(kuò)增

  15.4mm矮管設(shè)計(jì)降低由冷凝液造成的污染,錐形管的凸邊設(shè)計(jì)有效地密封性,預(yù)防交叉污染

  材料和處理工藝制造,平蓋光損極低,適用于熒光定量PCR

  無熱解析出物,無內(nèi)毒素

  適用于大多數(shù)自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)儀器

  有方向孔,易于辨別方向

產(chǎn)品編號顏色尺寸產(chǎn)品名稱包裝規(guī)格適配機(jī)型
203001透明15.7+0.80.1mlPCR8聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱ABI 7500 Fast/Stepone, Bio-Rad CFX96 Roche 480,Roche Nano
203011白色15.7+0.80.1mlPCR8聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱ABI 7500 Fast/Stepone, Bio-Rad CFX96 Roche 480,Roche Nano
204001透明20.7+0.80.2mlPCR8聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱ABI 7500/7900,Bio-Rad iQ5, Stratagene Mx3000PTM/ Mx3005PTM
204011白色20.7+0.80.2mlPCR8聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱ABI 7500/7900,Bio-Rad iQ5, Stratagene Mx3000PTM/ Mx3005PTM
CP4000透明15.8+0.80.1mlPCR12聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱
CP4001白色15.8+0.80.1mlPCR12聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱
CP4010透明20.7+0.80.2mlPCR12聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱
CP4011白色20.7+0.80.2mlPCR12聯(lián)管&光學(xué)平蓋125條/盒,10盒/箱,1250條/箱

  核酸提取耗材/PCR管/PCR板系列/PCR單管本生一直視質(zhì)量控制為企業(yè)的生命,追求企業(yè)競爭力的不斷提升。公司在經(jīng)營中始終秉承:遵紀(jì)守法,嚴(yán)于律己,寬仁以待,敢于承擔(dān)的企業(yè)精神作為標(biāo)準(zhǔn),以過硬的質(zhì)量和優(yōu)良的服務(wù)來維護(hù)和拓展市場,較大限度的滿足客戶的需求。與客戶的共贏,是我們的發(fā)展目標(biāo)。本生!您信任的合作伙伴。我們愿與您真誠合作,共創(chuàng)美好的未來。

2021-08-31 10:54:54 364 0
【深藍(lán)云直播課】Echo顯微鏡使用技巧—Rebel

顯微鏡是由一個(gè)透鏡或幾個(gè)透鏡的組合構(gòu)成的一種光學(xué)儀器,是人類進(jìn)入原子時(shí)代的標(biāo)志。顯微鏡是人類最偉大的發(fā)明物之一,那么該如何使用顯微鏡呢?長期使用顯微鏡的小伙伴們,長期觀察目鏡筒是否會感到眼睛酸澀?想要分享視野中的發(fā)現(xiàn)時(shí)是否會困擾如何去跟別人描述新發(fā)現(xiàn)的位置?想要記錄視野圖像時(shí)是否需要反復(fù)的找合適角度拍照?


想要知道上面問題的解決辦法嗎?那就趕緊快來參加8月25日的深藍(lán)云直播課堂吧!您想知道的答案都在本次課程里,come on!


直播課



2020-08-24 15:00:55 607 0

4月突出貢獻(xiàn)榜

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