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聚丙烯酰胺凝膠電泳與瓊脂糖凝膠電泳的區(qū)別

笟鐐q藶 2013-09-22 07:16:49 743  瀏覽
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全部評論(2條)

  • QQ477287371 2013-09-23 00:00:00
    因?yàn)榈鞍纂娪局杏袧饪s膠和分離膠的區(qū)分,為了使膠的分界線在一個起點(diǎn)上,不得不豎著跑電泳。核酸電泳是一個均勻相,就沒有必要了。

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  • wyp6203 2017-11-26 03:11:54
    DNA電泳一般使用的都是瓊脂糖凝膠電泳,電泳的驅(qū)動力靠DNA骨架本身的負(fù)電荷。 蛋白質(zhì)電泳(一般指SDS-PAGE)一般使用的都是聚丙烯酰胺凝膠電泳,電泳的驅(qū)動力靠與蛋白質(zhì)結(jié)合的SDS上所攜帶的負(fù)電荷。 所以相同點(diǎn)就是樣品都是帶負(fù)電荷的,從負(fù)極向正極移動,移動的距離都和樣品的分子量有關(guān)。而且這兩個電泳體系可以互相交換使用。進(jìn)行大分子蛋白質(zhì)電泳時,可以考慮換用瓊脂糖凝膠,因?yàn)樵擉w系孔徑大。相反,如果需要精確到各位數(shù)堿基的DNA電泳也可以使用聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng),因?yàn)槭褂迷撓到y(tǒng)可以將相差一個堿基的兩條DNA鏈分開。 不同點(diǎn)首先是樣品不同。這個就不用多說了。其次是結(jié)果的觀察方法不同。DNA電泳普遍使用EB做染料,在紫外燈下觀察;而蛋白電泳使用的考馬斯亮藍(lán)染色,還需要經(jīng)過脫色步驟,不過觀察起來比較簡單。還有就是膠體系的差別,DNA電泳通常是一膠跑到底,而蛋白質(zhì)電泳則會有分離膠和濃縮膠之區(qū)別。 電泳中樣品移動的本質(zhì)確實(shí)是樣品所攜帶的電荷。但是,區(qū)分這些條帶直接可以用分子量而無需使用電荷數(shù),是因?yàn)檫@些樣品的電荷/分子量比都是恒定的了。以DNA分子為例,它在電泳中的移動是靠其骨架中磷酸所攜帶的負(fù)電荷來實(shí)現(xiàn)的,而這個磷酸分子又是每一個核苷酸中都有的,所以DNA分子所攜帶的負(fù)電荷數(shù)是由其核苷酸總數(shù)決定的。而且,DNA分子中核苷酸的組成動輒成百上千,在如此大的分子量面前,討論單個核苷酸之間分子量的差別就顯得毫無意義。這樣,DNA分子中負(fù)電荷的量就可以用DNA的分子量來代替,反過來,DNA的分子量也就可以用DNA分子所攜帶的電荷來代替(一句話,DNA分子的電荷/分子量比是恒定的)。 這在蛋白電泳中(特別是SDS-PAGE中)是一樣的。在SDS-PAGE中,SDS將蛋白質(zhì)變性成直線分子并緊密包裹于其上,使得其所攜帶的電荷與蛋白分子量成了一定的比例,剩下的就和核酸電泳一樣了。

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瓊脂糖凝膠電泳檢測核酸的原理及產(chǎn)品優(yōu)勢

瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖作為介質(zhì)的一種電泳方法,其兼具“分子篩”和“電泳的雙重作用。

瓊脂糖(Agarose)是一種線性多糖聚合物,是從紅色海藻產(chǎn)物瓊脂中提取而來的,當(dāng)瓊脂糖溶液加熱到沸點(diǎn)后冷卻凝固便會形成良好的電泳介質(zhì),其密度是由瓊脂糖的濃度決定的。

經(jīng)過化學(xué)修飾的低熔點(diǎn)的瓊脂糖,在結(jié)構(gòu)上比較脆弱,因此在較低的溫度下便會熔化,可用于核酸片段的電泳檢測。

瓊脂糖凝膠電泳檢測的主要是核酸的完整性和大小,只要核酸不是太小或者太大(超出電泳分離范圍),該方法的可信度非常高。

核酸會根據(jù)pH不同帶有不同電荷,在電場中受力大小不同,因此跑的速度不同,瓊脂糖凝膠電泳即根據(jù)這個原理對核酸進(jìn)行區(qū)分。

核酸分子在pH高于其等電點(diǎn)的溶液中帶負(fù)電荷,在電場中向正極移動。由于核酸的戊糖-磷酸骨架在結(jié)構(gòu)上具有重復(fù)性,長度相同的核酸鏈幾乎具有等量的凈電荷,因此它們能以同樣的速率向正極方向移動。

此外,含有瓊脂糖的凝膠具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),物質(zhì)分子通過時會受到阻力,大分子物質(zhì)在涌動時受到的阻力大,因此在瓊脂糖凝膠電泳中,帶電顆粒的分離不僅取決于凈電荷的性質(zhì)和數(shù)量,而且還取決于分子大小,這就大大提高了分辨能力。

在同樣電場的強(qiáng)度下,核酸分子的遷移速度取決于核酸分子本身的大小和構(gòu)型以及瓊脂糖凝膠的濃度,簡而言之,分子量較大的核酸遷移速度較慢,分子量較小的核酸遷移速度較快,這就是應(yīng)用凝膠電泳技術(shù)分離核酸片段的基本原理。

德晟公司產(chǎn)品特點(diǎn)及優(yōu)勢:

您不用再四處采購瓊脂糖、核酸染料、電泳液和loading buffer等試劑,一個試劑盒全部解決。

本試劑盒可以給您節(jié)省一個小時左右的實(shí)驗(yàn)時間。

a. 省去了您制膠的繁瑣,并且預(yù)制膠是核酸染料預(yù)染的,無需電泳液染色或后染色。簡捷方便,即開即用。

b. 本試劑盒專門配備了高壓快速電泳液,如果您的核酸樣品片段在2000bp以下,電泳的快慢您可以隨時掌控,調(diào)整電壓即可,一般的mini膠最快可以5-10分鐘完成;如果您在實(shí)驗(yàn)中使用的Marker或者核酸樣品條帶多、片段長(核酸樣品片段大于2000bp),您就需要根據(jù)實(shí)際情況,調(diào)節(jié)到合適的低壓,或仍使用您原來的低壓電泳條件。

3. 用本產(chǎn)品電泳得到的DNA片段進(jìn)行膠回收,不影響后續(xù)的DNA連接等反應(yīng)。

運(yùn)輸及保存:4°C保存和運(yùn)輸,有效期3個月,切勿放置于0°C以下或者常溫以上,這樣試劑盒內(nèi)的預(yù)制膠就會凍裂或變形,影響您的使用。


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前提:蛋白是已知純化好的蛋白,DNA是已知的純化好的DNA片段;且在適當(dāng)結(jié)合體系里使其發(fā)生結(jié)合反應(yīng)。 問題:到底該蛋白和該DNA片段反應(yīng)了沒有,可以用瓊脂糖凝膠電泳鑒定嗎?結(jié)合蛋白質(zhì)的DNA片段會跑得慢一些,從而得出結(jié)論。還是說,結(jié)合產(chǎn)物在瓊脂糖中會分... 前提:蛋白是已知純化好的蛋白,DNA是已知的純化好的DNA片段;且在適當(dāng)結(jié)合體系里使其發(fā)生結(jié)合反應(yīng)。 問題:到底該蛋白和該DNA片段反應(yīng)了沒有,可以用瓊脂糖凝膠電泳鑒定嗎?結(jié)合蛋白質(zhì)的DNA片段會跑得慢一些,從而得出結(jié)論。還是說,結(jié)合產(chǎn)物在瓊脂糖中會分離而不能使用這種方法鑒定嗎? 實(shí)驗(yàn)室沒有條件做放射性標(biāo)記等操作,正常的DNA凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)不太可取。想問有沒有簡單可行的方法,可以鑒定蛋白質(zhì)和DNA發(fā)生了結(jié)合,用于大量篩選。 求指點(diǎn)!大謝! 展開
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