疫苗研發(fā)、基因治療、生物制藥、細胞治療、抗病毒藥物與診斷試劑——EVOS M7000智能成像系統(tǒng)為病毒滴度檢測精準護航,加速創(chuàng)新轉(zhuǎn)化!
近日由芬蘭赫爾辛基大學科研人員采用了一步法創(chuàng)新方法來優(yōu)化腺病毒定量分析,該方法使用單一抗體與自動化、高通量圖像采集以及后續(xù)批量分析相結(jié)合。首先,將目標腺病毒感染細胞,并使用六聚體蛋白對其進行染色。然后通過 Invitrogen EVOS M7000 成像系統(tǒng)實現(xiàn)了多通道自動圖像采集。最后,通過 EVOS Celleste6.0分析軟件對采集到的圖像進行了自動大規(guī)模分析,這一過程是通過對軟件的精確訓練來完成的,能夠?qū)崿F(xiàn)病毒感染量的量化以及諸多其他參數(shù)(計數(shù)、圓度、面積和靶標信號強度)的測定。研究發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)方法相比,該一步法能夠在時間和資源上更高效地實現(xiàn)對腫瘤溶瘤病毒疫苗和基因治療載體的精確量化分析。
當前首選方法(病毒滴度測定法)的成本效益分析:
當前的病毒滴度測定是通過將探針與針對病毒六聚體蛋白的抗體進行偶聯(lián)來實現(xiàn)的。六聚體是病毒感染后表達的晚期基因,在宿主細胞破裂前起著至關(guān)重要的包裝所需蛋白質(zhì)的作用。這種蛋白質(zhì)的表達與任何給定病毒制劑或后續(xù)實驗中完全功能的病毒量呈直接正相關(guān)。通常檢測六聚體蛋白需要一個雙抗體系統(tǒng),包括一種鼠源性抗六聚體抗體,隨后由帶有生物素 SP 連接探針的抗鼠次級抗體識別(圖 1)。這一過程最終會生成一種有色沉淀物,這種沉淀物可以通過分光光度法進行定量分析,從而能夠確定六聚體蛋白的含量,進而得出載體或疫苗制劑中功能性病毒的含量。
圖 1.優(yōu)化后的 ICC 方案及其優(yōu)勢
優(yōu)點包括減少資源消耗(時間、資金和材料方面),實現(xiàn)自動化和高通量分析,以及提高精度和準確性。圖示部分展示了傳統(tǒng)的 ICC 方法,包含一個雙結(jié)合抗體系統(tǒng),需要依次進行給藥并手動獲取圖像和分析,這是一種低效率的方法,圖像采集和分析所需的時間會隨著數(shù)據(jù)點數(shù)量的增加而呈指數(shù)級增長。
一步法方案涵蓋了所提出的優(yōu)化方法,包括單抗系統(tǒng)、自動化圖像采集以及大規(guī)模批量分析。這是一種高通量的方法,能夠及時獲取并分析大量數(shù)據(jù),從而實現(xiàn)更精確和可重復的病毒定量。需要指出的是,每個箭頭代表了重復進行的洗滌步驟,這也極大地增加了執(zhí)行病毒定量過程所需的時間。該圖像由 BioRender 創(chuàng)建。
盡管 ICC 方法適用于病毒滴度測定,但該方法本身在準確性、資源消耗等方面仍有許多需要改進的地方。通過這種傳統(tǒng)方法進行病毒滴度測定對用戶所需的時間要求較高,而且其能否成功完成還需要耗費較大成本以及相關(guān)試劑的投入。本研究探討了一種采用自動圖像采集和分析的一步法方案,旨在確保數(shù)據(jù)精確性的條件下改進傳統(tǒng)的滴度測定方法。
快速且自動化的高通量病毒檢測方法
在這項研究中,研究人員提出了一種高通量的方法,其實施有望顯著提高病毒生產(chǎn)過程中病毒滴度測定的效率、精度和準確性,無論是在學術(shù)領(lǐng)域還是工業(yè)應用中都是如此。這包括對單抗系統(tǒng)的深入分析(FITC標記)、直接熒光報告基因定量驗證的實施,以及通過使用EVOS M7000 成像系統(tǒng)實現(xiàn)的最新自動化圖像采集和分析技術(shù)。這種優(yōu)化的方法能夠極大減少資源消耗,同時通過減輕傳統(tǒng)ICC中多種偏差(包括用戶偏差和采樣偏差)來提高精度和準確性。在本研究中,通過對腫瘤溶解疫苗和基因治療載體的定量分析,強調(diào)了該方法對不同病毒載體和疫苗的準確度、精度和適用性的優(yōu)勢。
建立優(yōu)化的病毒滴度測定方法
在本研究中,對兩種可能對常規(guī)病毒滴度測定方法進行的優(yōu)化方法進行了協(xié)同效果的比較研究:(1)采用一步抗六聚體抗體系統(tǒng);(2)采用先進的顯微鏡和分析技術(shù)。作為概念驗證評估,將 70%貼壁的人肺癌細胞系 A549 細胞感染內(nèi)部克隆的 Ad5D4RFP,并進行染色;在感染后 48 小時對所得細胞進行成像。研究人員提及:該病毒的實施作用在于能夠直接與用于檢測和定量病毒感染的 Hexon 蛋白染色進行對比,以檢測轉(zhuǎn)基因的表達情況。圖像是在多個通道上同時獲取的,并經(jīng)過去卷積處理以分離為不同的文件,每個文件對應一個通道以便進行單獨分析(圖 2A)。單獨分析每個通道或?qū)⑵浣M合起來進行分析,能夠?qū)崿F(xiàn)多種應用類別的分析。通過將 Hoechst 染色作為細胞總數(shù)的基準, FITC 或RFP檢測到的細胞數(shù)量除以細胞總數(shù),可以準確評估感染過程。通過使用公式對這些值進行直接計算,并在圖 2A 中可見,可以得出感染百分比。將該數(shù)據(jù)與滴度一起使用能更準確地衡量病毒的效力,并可指導更準確的實驗設計。基于圖 2B 中的總感染計數(shù)、感染率和滴度,這種分析形式中還可以獲得大量的其他測量值,從而提供了更豐富且有價值的信息。
圖 2.特定染色后的多通道自動圖像采集
將 A549 細胞以 100 倍感染量感染 Ad5D24 細菌 48 小時后進行成像。采用核染色方法結(jié)合 FITC 單體系統(tǒng),以實現(xiàn)更精確的滴度測定過程,并通過核染色劑 Hoechst(作為總細胞數(shù)的估計值)和 FITC(作為總感染數(shù)的估計值)來確定感染率。 (A)基于顯微鏡通道的采集數(shù)據(jù)解析,將多通道整管圖像分離到各自的通道中。通過 EVOS 分析軟件,可以對每種熒光染色劑的計數(shù)進行獲取。(B)單通道分析涉及通過公式 2(方法說明)對目標計數(shù)進行操作,并與總體細胞計數(shù)進行比較,從而創(chuàng)建感染百分比指標。從整個孔圖像中,通過公式 2 可以確定高度準確的感染滴度。(C)該儀器的其他可量化指標包括每個斑點的強度、圓度和面積,所有這些都提供了有關(guān)這些目標的感染狀態(tài)的重要信息。圖像通過 EVOS M7000 成像系統(tǒng)在手動采集操作規(guī)程下獲取(每孔 40 張圖像,每種條件 3 個重復孔)。統(tǒng)計學分析為常規(guī)的一元方差分析,各孔之間的標準差已給出。所示的是平均值±標準誤,顯著性水平設定為 *p < 0.05、**p < 0.01、***p < 0.001 和 ****p < 0.0001(95%置信區(qū)間)。
全孔圖像采集與滴度測定
除了采樣之外,全孔成像還是一種強大的病毒滴度測定方法。它使用戶能夠在分析時考慮孔的整個表面,并避免分布和采樣偏差。EVOS M7000 成像系統(tǒng)能夠以精確且高效的方式獲取高分辨率圖像,并進行自動拼接以生成全孔圖像(圖 3)。
圖 3. 整井成像技術(shù)用于準確測定病毒滴度
使用 M7000 成像系統(tǒng)在 10 倍放大倍數(shù)下,對整個標準的 24 孔板(每種條件 3 個重復孔)進行同時成像,采用自動采集操作規(guī)程。每個通道生成的拼接圖像分別進行處理,并在單個通道級別上進行分析。從孔邊緣(細胞融合度低于 50%)捕獲的圖像被排除在分析之外。通過 EVOS 分析和 Celleste 6.0軟件 的聯(lián)合應用,對圖像進行分析,包括病毒滴度的測定。進行的統(tǒng)計分析為普通的一元方差分析,并報告了標準差。所示的是平均值±標準誤以及在孔之間設定的顯著性水平:*p < 0.05,**p < 0.01,***p < 0.001,****p < 0.0001(置信區(qū)間 95%)。
同時進行的多通道采集提供了豐富的數(shù)據(jù),包括常規(guī)有色沉淀物(透射)、轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物(紅色熒光蛋白)以及六聚體產(chǎn)物(綠色熒光蛋白)的數(shù)據(jù)。這使得能夠直接計算并比較不同方法的滴度,總體上是以單個樣本為基礎進行的(圖 3)。通過優(yōu)化的一步法獲得的滴度最高,為 1.56 乘以 10 的 10 次方,并且與同類方法相比具有更顯著的統(tǒng)計學意義,表明這種方法在信號檢測的靈敏度和最終滴度的準確性方面具有更高的準確性。另外兩種方法的滴度值與已報道的值(分別為 1.37 乘以 10 的 10 次方和 1.24 乘以 10 的 10 次方)具有較高的相似性(圖 3)??偟膩碚f,在根據(jù)四步法的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物來測定病毒滴度時,未發(fā)現(xiàn)有已報道的差異,而優(yōu)化的一步法則在統(tǒng)計學上更高。
通過溶瘤腺病毒追蹤癌細胞的殺傷情況
基于多通道獲取圖像的高效方法,可按時間順序可視化分析其在病毒感染后的擴散情況。在腺病毒中,監(jiān)測感染后的前 72 小時對于了解感染的關(guān)鍵時間點具有重要意義,這對所有后續(xù)應用和實驗非常有益。將優(yōu)化的方案與 EVOS M7000 成像系統(tǒng)相結(jié)合,使這項任務變得非常簡單。病毒感染的首次出現(xiàn)跡象在 24 小時后明顯顯現(xiàn),所有標記通道的信號顯著增加,分別記錄的平均計數(shù)為 RFP 38.06、FITC 38.15 和抗 Hexon 傳輸 40.12(圖 4B)。所得的熒光強度在不同時間點上呈現(xiàn)出穩(wěn)定的增加趨勢,在 48 小時時分別達到 RFP 和 FITC 熒光指示劑的平均最大值 1762.58 和 497.73L/mm(圖 4A 和 4C)。在 72 小時時間點,由于細胞從板上脫落和細胞溶解,出現(xiàn)了顯著的下降。隨后的圖像分析顯示了感染細胞計數(shù)、強度的相同趨勢。并且目標的循環(huán)性表現(xiàn)為首次出現(xiàn)的時間為 24 小時,在 48 小時時觀察到最大效果,隨后在 72 小時出現(xiàn)顯著下降(圖 4B 和 4C)。在進一步計算的值中,包括目標的面積、滴度和總體感染率(圖 4B),總體趨勢保持不變。綜合來看,這種新的一步法方法能夠與以前的方法相比,為腺病毒感染后的最初 72 小時提供了更深入和準確的數(shù)據(jù)。
在 96 孔板上重復進行了相同的實驗,以充分利用該容器的固有優(yōu)勢(所需試劑量較少,可分配更多孔位以設置更多時間點,經(jīng)濟上更劃算),從而能夠獲得更多的時間點,以便更清晰地闡明病毒復制周期的各個階段。
為了具體說明這種方法在正常細胞中對傳染性的適用性,我們使用了 Ad5ddTomato 對 Hek293 細胞進行感染的實驗。在 96 孔板上重復實驗獲得了相似的數(shù)據(jù)和趨勢,能夠準確地在整個復制周期內(nèi)定量非腫瘤溶解型病毒(圖 S1B)。這一點通過轉(zhuǎn)基因得到了體現(xiàn)。在 24 小時時達到生產(chǎn)峰值,第 4 天達到最大信號強度,而到第 5 天(即病毒復制周期結(jié)束時)信號強度則顯著下降(圖 7)。
病毒滴度測定容器比較
通過對感染后 72 小時內(nèi)各種病毒的跟蹤觀察,發(fā)現(xiàn)采用更高容量的容器來同時評估更多的變量是有利的。為了全面了解這將對所獲得數(shù)據(jù)的準確性(即感染細胞的百分比)產(chǎn)生的影響,我們對 24 孔板和其 96 孔對照板進行了完整的容器比較。
圖 4. 在標準容量培養(yǎng)皿(24 孔)中追蹤感染后 72 小時內(nèi)溶瘤病毒的感染進展情況
根據(jù)文獻中的標準間隔獲取多通道圖像,以追蹤 Ad5D24 病毒感染(100 MOI)在 A549 細胞中的擴散情況。(A)在標準 24 孔培養(yǎng)皿中獲得的完整圖像集,報告了 DAPI、GFP、RFP 和透射(Trans)通道的圖像,并展示了所有這些通道的代表性疊加圖像。這些圖像使用 EVOS M7000 成像系統(tǒng)在自動采集中獲?。靠?40 張圖像,每個條件 3 個重復孔)。(B)通過顯微鏡成像分析獲得的指標,展示了病毒的進展情況。使用 EVOS 分析軟件對每種熒光染色物進行計數(shù)(C)通過使用(B)中先前獲取的指標以及材料與方法部分所討論的后續(xù)方程進行計算,獲得了更多有關(guān)病毒感染的測量數(shù)據(jù)。章節(jié)。所進行的統(tǒng)計分析為常規(guī)的雙因素方差分析,各孔之間的標準差予以報告。所示內(nèi)容為平均值±標準誤,顯著性水平設定為*p < 0.05、**p < 0.01、***p < 0.001 和 ****p < 0.0001(置信區(qū)間 95%)。
圖 5. 病毒殺瘤感染 72 小時后的感染情況追蹤(在容量更大的容器(96 孔板)上進行)
通過與圖 4 中所描述的相同方法獲取了多通道圖像,并針對該容器的較大容量增設了額外的時間點。(A)在 96 孔容器中獲得的完整圖像集,報告了在 DAPI、GFP、RFP 和透射通道中獲取的圖像,并配有相應的疊加圖。這些圖像使用 EVOS M7000 成像系統(tǒng)在自動采集程序下獲?。靠?10 張圖像,每個條件 5 個重復孔)。
圖 6. 在標準容量培養(yǎng)皿(24 孔)上追蹤感染后前 5 天非腫瘤病毒感染的進展情況(24 個孔)
根據(jù)文獻中的規(guī)定,在關(guān)鍵時間點獲取多通道圖像,以追蹤 Ad5ddTomato 這種非腫瘤病毒的感染擴散情況。 (A)在標準 24 孔培養(yǎng)皿中獲得的完整圖像集,報告了 DAPI、GFP、RFP 和透射通道所獲取的圖像,以及所有這些通道的代表性疊加圖像。這些圖像使用 EVOS M7000 成像系統(tǒng)在自動采集程序下獲取(每孔 40 張圖像,每個條件 3 個重復孔)。
圖 8. 不同容量容器中百分比感染率計算準確性的比較
使用低容量和高容量容器評估 Ad5D24 病毒對 A549 細胞的感染能力(100 MOI,持續(xù) 48 小時)時所獲得的準確度測量值。
(A)低容量和高容量容器中培養(yǎng)皿相對表面積的示意圖,該示意圖在五張圖像中呈現(xiàn),分別記錄了低容量和高容量容器的數(shù)據(jù)。通過容器制造商的規(guī)格(24 孔,1.93 平方厘米;96 孔,0.33 平方厘米)計算出的培養(yǎng)皿表面積百分比,并通過 EVOS 分析標尺進行標準像素轉(zhuǎn)換。圖像改編輯自 BioRendera2024。(B)每個培養(yǎng)皿的五張多通道圖像所得到的感染率百分比。圖像采集使用 EVOS M7000 成像系統(tǒng),在自動采集操作程序下進行。在 EVOS 分析軟件上進行了熒光染色分析,并通過 Celleste6.0 軟件進行了常規(guī)的四步 ICC 方法來源的數(shù)據(jù)分析。
優(yōu)化后的病毒滴度測定
MOI(感染強度)和病毒定量也是在優(yōu)化方案中用于確定病毒滴度的主要方法,也是本研究的主要內(nèi)容。優(yōu)化方案由一步法及單抗系統(tǒng)組成,旨在病毒感染后再次針對新合成的六聚體蛋白進行檢測。細胞固定的操作方式與上述常規(guī)病毒滴度測定方案相同。使用了腺病毒六聚體單克隆抗體、FITC(MA1-7329,Thermo Fisher Scientific,1:100,在室溫下作用 1 小時)并按照指導進行操作。所有其他方案,包括細胞接種、感染后數(shù)小時的檢測以及 Hoechst 染色,都與常規(guī)方案保持一致。通過顯微鏡直接觀察到 FITC 的生成,從而省去了酶和底物系統(tǒng)的使用。對于在不同時間點進行了感染、固定和染色的操作,其步驟與上述常規(guī)病毒滴度測定方法完全相同。
顯微鏡觀察與定量分析
在 EVOS M7000 成像系統(tǒng)(Thermo Fisher Scientific)上對病毒感染進行了顯微鏡觀察,該系統(tǒng)能夠獲取顯示有彩色沉淀(或 FITC)的感染細胞的圖像,這些圖像分別在透射光和綠色熒光蛋白(GFP)通道中獲取。亮度、聚焦和每張圖像的計數(shù)等設置是手動設定的,每張圖像的目標數(shù)量(感染細胞)被設定在 10 到 100 之間,并通過之前的感染時間和 MOI 進行優(yōu)化。經(jīng)過手動校準后,進行了自動圖像采集,以獲得每個孔的 n 張圖像,跨越多個通道。本研究的自動圖像采集包括透射光(用于常規(guī)的彩色沉淀產(chǎn)物)、紅色熒光蛋白(轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物)、綠色熒光蛋白(FITC)和 DAPI(Hoechst),每張孔中有 40 張圖像用于采樣,整個孔有 192 張圖像。圖像以隨機順序獲取,并在所有孔的相同位置隨機選擇以供所有實驗使用。所得的圖像通過圖像拼接技術(shù)將各個部分組合在一起,以生成不同狀況下的整孔圖像。感染率指標是通過將熒光陽性細胞的總計數(shù)(來自顯微鏡觀察,以 RFP 作為轉(zhuǎn)導單位或以 GFP 作為抗六聚體)除以細胞總數(shù)(通過核染色(Hoechst 染色)來表示。
綜合來看,該項研究中將熒光滴度檢測與全自動高通量采集與分析相結(jié)合的方法,相較于傳統(tǒng)的滴度檢測方法具有諸多優(yōu)勢。其中最顯著的優(yōu)勢包括能夠提供更全面和準確的病毒滴度測定,同時還能節(jié)省資源消耗以實現(xiàn)精準病毒定量。該一步法歸功于方法設計中的諸多改進,包括其具有高通量數(shù)據(jù)采集和分析能力,能夠以更快的速度進行更多的數(shù)據(jù)分析,并在培養(yǎng)皿的整個表面獲得更全面、更完整的數(shù)據(jù)信息。這避免了傳統(tǒng)病毒定量方法中存在的顯著的采樣偏差影響,進而獲得更精確的計算和分析結(jié)果。另外也兼容更多的容器類別,而無需其他額外的投入,這也體現(xiàn)了該方案的高通量特性以及它所帶來的經(jīng)濟性和可操作性。
EVOS M7000配置全面升級:智能活細胞成像分析系統(tǒng)
全新升級4K 超高清顯示屏及高配計算機系統(tǒng)
光源:全系統(tǒng)可靈活配置多款2.0版本高性能光立方
更多物鏡選擇:新增多款Semi-APO高性能物鏡
活細胞環(huán)控裝置:可配置全新第二代Onstage Incubator活細胞環(huán)境控制裝置,可實時提供潔凈壓縮空氣。
高維數(shù)據(jù)分析:可選配Celleste6.0版本高維數(shù)據(jù)分析軟件,如大圖無縫拼接,延時成像分析,2D/3D反卷積分析,3D圖像分割(3D可視化分析)等諸多高維圖像分析模塊
全部評論(0條)
美國Invitrogen iBright 智能成像系統(tǒng) CL1000
報價:面議 已咨詢 708次
美國賽默飛 QuantStudio 3 D芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)
報價:面議 已咨詢 892次
美國賽默飛 iBlot? 2 干式轉(zhuǎn)印系統(tǒng)
報價:面議 已咨詢 576次
美國賽默飛 基因測序儀3500系列
報價:面議 已咨詢 1077次
美國賽默飛 Ion Proton? 系統(tǒng)
報價:面議 已咨詢 457次
MicroRNA 提取試劑盒
報價:面議 已咨詢 489次
Invitrogen Qubit 4 核酸/蛋白質(zhì)定量熒光計
報價:面議 已咨詢 796次
美國賽默飛CellInsight CX7 LZR激光共聚焦高內(nèi)涵
報價:面議 已咨詢 554次
①本文由儀器網(wǎng)入駐的作者或注冊的會員撰寫并發(fā)布,觀點僅代表作者本人,不代表儀器網(wǎng)立場。若內(nèi)容侵犯到您的合法權(quán)益,請及時告訴,我們立即通知作者,并馬上刪除。
②凡本網(wǎng)注明"來源:儀器網(wǎng)"的所有作品,版權(quán)均屬于儀器網(wǎng),轉(zhuǎn)載時須經(jīng)本網(wǎng)同意,并請注明儀器網(wǎng)(m.sdczts.cn)。
③本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明來源的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點或證實其內(nèi)容的真實性,不承擔此類作品侵權(quán)行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品來源,并自負版權(quán)等法律責任。
④若本站內(nèi)容侵犯到您的合法權(quán)益,請及時告訴,我們馬上修改或刪除。郵箱:hezou_yiqi
紫外線消毒失效的隱形殺手:劑量不足
參與評論
登錄后參與評論