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QPix:合成生物學(xué)自動化流程關(guān)鍵一環(huán)

來源:美谷分子儀器(上海)有限公司 更新時間:2025-07-11 10:45:20 閱讀量:180
導(dǎo)讀:QPix:合成生物學(xué)自動化流程關(guān)鍵一環(huán)


合成生物學(xué)

無疑是當(dāng)今生物行業(yè)最熱門的研究方向之一!


隨著基因測序/合成和組裝的成本降低、基因編輯技術(shù)的迭代等因素影響,合成生物學(xué)被認(rèn)為具有非常多未知的可能性,這也讓生物制造成為了當(dāng)今全球各國爭相布局的領(lǐng)域。微生物作為經(jīng)濟(jì)型制造工廠,已被應(yīng)用于醫(yī)藥、工業(yè)化學(xué)品、食品、農(nóng)業(yè)、生物能源、環(huán)保等多個領(lǐng)域,擁有相對成熟的技術(shù)并投入已生產(chǎn),獲得經(jīng)濟(jì)效益。


隨著對源自重組生物學(xué)合成產(chǎn)品需求的增加,勞動密集型、耗時且容易出現(xiàn)人為錯誤的人工合成生物學(xué)工作流程已經(jīng)不再被青睞,快速、準(zhǔn)確的合成生物學(xué)上下游流程和高通量微生物菌株工程變得更受歡迎。



愛丁堡大學(xué) EGF 自動化平臺



英國愛丁堡大學(xué)擁有一個高度自動化的基因組平臺——EGF (The Edinburgh Genome Foundry) ,可以產(chǎn)生和修飾長達(dá) 1 兆堿基對的 DNA 鏈,以使細(xì)胞或整個生物具有新的或改進(jìn)的功能,例如重編輯干細(xì)胞可用于進(jìn)行個體化醫(yī)療,生產(chǎn)疾病檢測細(xì)菌或提高生物燃料作物的產(chǎn)量。


他們的挑戰(zhàn)

為了通過準(zhǔn)確的樣品和數(shù)據(jù)追蹤來實(shí)現(xiàn)更高的樣品通量,EGF 需要一個自動菌落挑選系統(tǒng),該系統(tǒng)需具備以下兩個功能,其一是可將多個樣品加樣至自動兼容 SBS 格式的瓊脂板上,并進(jìn)行劃線涂布。其二是該系統(tǒng)還需能夠完全整合至它們現(xiàn)有的自動工作流程中,這需要對硬件和軟件進(jìn)行改進(jìn),以允許第三方機(jī)械臂進(jìn)行樣品處理,并將其輸送至工作流程中的其它儀器。


我們的解決方案

為了滿足 EGF 的需求,MD 高級工作流工程解決方案(AWES)團(tuán)隊(duì)改進(jìn)了經(jīng)典的 QPix 420 微生物克隆篩選系統(tǒng),以提供用于進(jìn)行液體處理的硬件,同時改進(jìn)了結(jié)構(gòu)設(shè)計以實(shí)現(xiàn)機(jī)械臂進(jìn)入和孔板轉(zhuǎn)移。我們將這種定制配置命名為 QPix Select HT 系統(tǒng)。此外,還開發(fā)了一種定制的 QPix 涂布頭,以便將 8 個樣品涂布到分格的 SBS 尺寸瓊脂板上。還針對每個獨(dú)特定制的流程提供開放的 API 和軟件支持。


EGF 將 QPix Select-HT 系統(tǒng)完全集成至其自動化平臺中,該平臺包括三個機(jī)械臂、兩個液體處理站、培養(yǎng)箱、PCR 儀(標(biāo)準(zhǔn)和實(shí)時)、聲波分液系統(tǒng)、離心機(jī)、封膜機(jī)和撕膜機(jī)、封蓋系統(tǒng)和去蓋系統(tǒng)。



結(jié)果

由于具備每小時挑選 3,000 個菌落克隆的能力,QPix Select-HT 系統(tǒng)可提供及時將產(chǎn)品交付給客戶所需的必要高通量取樣功能。每個過程還具備可靠的樣本追蹤和數(shù)據(jù)管理功能,從而讓 EGF 可在整個自動化工作流程中有效管理樣本數(shù)據(jù)。將系統(tǒng)集成到一個全自動工作流程還可以減少運(yùn)行系統(tǒng)所需的員工工作時間,從而降低每個 EGF 項(xiàng)目的財務(wù)成本。Molecular Devices AWES 團(tuán)隊(duì)和 Edinburgh Genome Foundry 的密切合作為其特定的工作流程需求提供了有效的解決方案,從而讓 EGF 能夠?qū)崿F(xiàn)通過全自動平臺進(jìn)行 DNA 組裝的目標(biāo)。



QPix? 400 系列微生物克隆篩選系統(tǒng)



QPix 400 系列微生物克隆篩選系統(tǒng)可以識別克隆并定量熒光信號強(qiáng)度,從而實(shí)現(xiàn)挑取前的預(yù)篩選。我們的 QPix 系統(tǒng)全球裝機(jī)量已經(jīng)超過 1000 套,其中國內(nèi)裝機(jī)量已經(jīng)超過 100 套。QPix 系列廣泛用于世界各地的研究機(jī)構(gòu)、測序服務(wù)單位、生物科技和制藥公司。在人類基因組項(xiàng)目中,QPix 系統(tǒng)的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性獲得了測序中心的贊譽(yù)。


QPix 系統(tǒng)不僅僅是克隆挑取儀,它們使科學(xué)家能夠:

1

自動化實(shí)現(xiàn)從加樣、涂布到挑取的工作流程;

2

通過成像、軟件識別、參數(shù)設(shè)置以及高精度位移,每次選擇正確的克??;

3

有效管理大型、多樣化的文庫:合成生物學(xué)的底盤細(xì)胞和元件篩選,酶進(jìn)化,噬菌體展示,蛋白表達(dá),生物燃料研究,工業(yè)微生物改造, DNA 測序,基因合成,文庫制備和管理等。



相關(guān)產(chǎn)品鏈接:

QPix FLEX 微生物克隆篩選系統(tǒng)



關(guān)于美谷分子儀器

Molecular Devices 始創(chuàng)于上世紀(jì) 80 年代美國硅谷,并在全球設(shè)有多個代表處和子公司。2005 年,Molecular Devices 在上海設(shè)立了中國代表處,2010 年加入全球科學(xué)與技術(shù)的創(chuàng)新者丹納赫集團(tuán),2011 年正式成立商務(wù)公司: 美谷分子儀器(上海) 有限公司。Molecular Devices 以持續(xù)創(chuàng)新、快速高效、高性能的產(chǎn)品及完善的售后服務(wù)著稱業(yè)內(nèi),我們一直致力于為客戶提供在生命科學(xué)研究、制藥及生物治療開發(fā)等領(lǐng)域蛋白和細(xì)胞生物學(xué)的創(chuàng)新性生物分析解決方案。

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我們的產(chǎn)品線覆蓋微孔板讀板機(jī)、GxP合規(guī)軟件、洗板機(jī)、高內(nèi)涵細(xì)胞成像系統(tǒng)、克隆篩選系統(tǒng)、高通量實(shí)時熒光檢測分析系統(tǒng)、微陣列掃描儀、膜片鉗及檢測試劑盒等。

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