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天然藥物ABPP和SPR互作,大規(guī)模分子相互作用-分子對接

來源:分子互聯(lián)(北京)生物科技有限公司 更新時間:2025-04-16 20:46:40 閱讀量:131
導(dǎo)讀:天然藥物及仿生藥物ABPP和SPR互作,大規(guī)模分子相互作用研究,分子對接 對蛋白質(zhì)、核酸、小分子、天然產(chǎn)物研究相互作用進行親和力、動力學(xué)的全面分析,如:Ka、Kd、KD、ΔG等等;

可進行天然藥物及仿生藥物,大規(guī)模分子相互作用研究如:

1. 對蛋白質(zhì)、核酸、小分子、天然產(chǎn)物研究相互作用進行親和力、動力學(xué)的全面分析,如:Ka、Kd、KD、ΔG等等;

2. 篩選能和靶蛋白結(jié)合的活性分子,分子對接、虛擬篩選、AI+篩選等;

3. ABPP(Activity-Based Protein Profiling)釣靶技術(shù),藥靶篩選藥物分子;

4. 復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和組裝順序的分析。

5.天然產(chǎn)物藥物配伍、方證、循證醫(yī)學(xué)為基礎(chǔ)的藥效及醫(yī)學(xué)研究。



不同的分子互作技術(shù)各有特點,選擇合適的技術(shù)取決于研究的具體需求和條件。

SPR:基于芯片表面(PH,分子量,電荷,離子濃度,溫度)等離子共振強度表示信號高低,靈敏度較高。

BLI:和spr類似,基于光波干涉形成信號,相對適合大分子蛋白檢測。

MST:需要標記熒光分子如CY5,蛋白聚集、構(gòu)象大小影響大,適合小分子至離子。

ITC:基于互作過程吸放熱提供熱力學(xué)參數(shù)(如ΔH、ΔS、ΔG)適合構(gòu)象穩(wěn)和小分子。

互作檢測范圍包括:

蛋白-蛋白、抗體-抗原、蛋白-小分子、抗體-多肽、蛋白-DNA、DNA-DNA、蛋白-納米材料等分子間相互作用力檢測;除了蛋白、抗體外,細胞裂解液、細菌等也可結(jié)合垂釣質(zhì)譜等技術(shù)鑒定調(diào)控蛋白;也可在藥物篩選、醫(yī)療診斷、食品檢測、血液標志物檢測等領(lǐng)域有廣泛應(yīng)用。

注意:樣品溶液中如含有NaN3、咪唑、蔗糖、DTT 等物質(zhì),需提前告知;如采用氨基偶聯(lián)的方式檢測,蛋白緩沖液中不能含有伯氨基的成分,如Tris 緩沖液。

SPR 檢測服務(wù)需經(jīng)評估后確定對應(yīng)的方案和價格。

電話:13292286508(微信同號)

郵件:fzhl_net@petalmail.com

分子對接(molecular docking)是依據(jù)配體與受體作用的“鎖-鑰原理” (lock&key principle),模擬配體與受體分子相互作用的一種技術(shù)方法。分子識別的過程,主要包括靜電、氫鍵、疏水、范德華力等。分子互聯(lián)為廣大客戶提供基于AI技術(shù)的虛擬篩選、分子對接服務(wù)、分子互作濕試實驗驗證服務(wù),預(yù)測藥物分子能否結(jié)合蛋白質(zhì)分子、結(jié)合的方式、位置和穩(wěn)定性等信息。內(nèi)容涵蓋受體準備(去水、加氫、優(yōu)化結(jié)構(gòu)和能量最小化)、活性位點發(fā)現(xiàn)、蛋白柔性構(gòu)象探索、配體構(gòu)象數(shù)據(jù)庫準備、對接計算結(jié)果分析評價、小分子化合物庫制備、藥效團建模及篩選、人工經(jīng)驗篩選等等。

分子對接應(yīng)用:

1、配體和受體作用方式和結(jié)合構(gòu)象;

2、篩選與靶點結(jié)合的先導(dǎo)化合物,化合物排序;

3、作用機理拓撲網(wǎng)絡(luò)組構(gòu)建;

   

電話:13292286508(微信同號)

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我們目前可以為您提供以下交付內(nèi)容:

蛋白/抗原/抗體—分子間親和力定性報告(定性分析),親和力測定報告(定量分析);結(jié)合常數(shù)(Ka)、解離常數(shù)(Kd)和 親和常數(shù)(KD); 親和力強弱排序;方證配伍研究報告。

周期:2-3周。


標簽:   分子互作   SPR 虛擬篩選
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