在生物體內(nèi)，蛋白的翻譯后修飾過程是蛋白發(fā)揮各種不同生化功能的基礎(chǔ)，這些翻譯后修飾包括糖基化、氧化、甲基化和磷酸化等。作為生物藥物的蛋白在生產(chǎn)、運(yùn)輸、保存過程中會(huì)產(chǎn)生變體，從而影響到藥物的活性和穩(wěn)定性。因此蛋白的肽譜經(jīng)常被用來研究蛋白的翻譯后修飾過程以及蛋白變體的存在。同時(shí)也用于生物制藥行業(yè)蛋白產(chǎn)品初級結(jié)構(gòu)的確認(rèn) [1-3] ，從而更好地控制生化藥品的質(zhì)量和確保病人的用藥安全。本文采用胰蛋白酶酶解蛋白的方法，得到各種蛋白的肽譜，比較幾款不同的反相色譜柱在分離蛋白酶解片斷時(shí)的差異，同時(shí)借助質(zhì)譜，評價(jià)蛋白酶解產(chǎn)物 - 多肽在酸性或者堿性流動(dòng)相條件下表現(xiàn)出分離性能的差異。儀器配置 Thermo Ultimate 3000 系統(tǒng)：泵：DGP-3600RS；自動(dòng)進(jìn)樣器： WPS-3000TRS；柱溫箱：TCC-3000RS；檢測器：DAD-3000RS 質(zhì)譜：TSQ Vantage 色譜軟件：Chromeleon 6.8 測試條件 與紫外檢測器兼容的液相色譜條件 色譜柱： 1- Acclaim 120 C18, 3mm×150mm, 3μm (P/N063691, S/N001119)； 2-Acclaim 120 C8, 2.1mm×100mm, 3μm (P/N059123, S/N001337)； 3-Hypersil GOLD C4, 2.1mm×150mm, 1.9μm (S/ N1008512×7, LOT10603)； 流動(dòng)相： 95% 超純水 +5% 乙腈 +0.1%TFA：5% 超純水 +95% 乙腈 +0.08%TFA, 梯度洗脫：