PCR反應(yīng)污染源的排查
如果PCR反應(yīng)不慎發(fā)生污染,應(yīng)逐一分析排查污染源
一設(shè)立對照組:
每次擴增均應(yīng)設(shè)立PCR體系中各試劑的隨機對照組,即除模板DNA外應(yīng)包含PCR反應(yīng)所需的全部組分若擴增結(jié)果中對照組為陽性,則表明有一種或數(shù)種試劑被污染
排查方法:將PCR反應(yīng)所需各組分試劑分別置于不同的擴增反應(yīng)管進行擴增,結(jié)果陽性的試劑即為被污染試劑
二排查環(huán)境污染源:若排除試劑污染或更換試劑后,仍然發(fā)現(xiàn)污染情況,則考慮可能為環(huán)境污染應(yīng)從以下裝置儀器方面進行排查:
(1)模板提取時真空抽干裝置;
(2)凝膠電泳加樣器;
(3)電泳裝置;
(4)紫外分析儀;
(5)切膠用刀或手術(shù)刀片;
(6)離心機;
(7)冰箱門把手,冷凍架,門把手或?qū)嶒炁_面等;
(8)氣溶膠;
排查方法:
(a)用無菌水浸泡過的滅菌棉簽擦拭可疑污染源
(b)0.1ml去離子水浸泡
(c)取5ml做PCR實驗
(d)電泳檢測結(jié)果
若經(jīng)上述排查仍無法確定污染源,則懷疑污染空氣PCR產(chǎn)物氣溶膠污染造成,則應(yīng)考慮重新設(shè)計新的與原引物無相關(guān)性的引物或可更換實驗場所,以消除污染影響
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