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問(wèn)答社區(qū)

如何研究磷酸化在蛋白質(zhì)功能發(fā)揮中的意義

qf310724941 2016-01-21 14:47:45 425  瀏覽
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  • 一只小鳥(niǎo)5711 2016-01-22 00:00:00
      蛋白磷酸激酶是能催化磷酸基團(tuán)從磷酸供體轉(zhuǎn)移到受體蛋白的酶,通常ATP的γ位磷酸(或其它三磷酸核苷)為供體。國(guó)際生物化學(xué)聯(lián)合會(huì)根據(jù)受體氨基酸的特異性,將蛋白激酶分為以下幾類:   ①以蛋白乙醇基作為受體的磷酸轉(zhuǎn)移酶稱為蛋白絲氨酸或蘇氨酸激酶;  ?、谝员交鶠榱姿崾荏w的磷酸轉(zhuǎn)移酶稱為蛋白酪氨酸激酶;  ?、垡訦is,Arg或Lys為受體的磷酸轉(zhuǎn)移酶稱蛋白His激酶;  ?、芤訡ys殘基作為受體的磷酸轉(zhuǎn)移酶稱蛋白Cys激酶;   ⑤以乙?;鳛槭荏w的磷酸轉(zhuǎn)移酶稱天冬或谷氨酰胺激酶。 前兩類酶Z常見(jiàn),許多蛋白絲/蘇氨酸或酪氨酸激酶已被純化。利用分子生物學(xué)技術(shù),已克隆出100多個(gè)蛋白激酶的基因。有些已通過(guò)測(cè)定其核苷酸序列而推出其相應(yīng)的氨基酸序列。在很多情況下,克隆的酶基因產(chǎn)物氨基酸受體特異性不能被直接測(cè)定,一般是通過(guò)序列分析與已知特異性的蛋白激酶比較而得出。所有已知的絲/蘇和酪氨酸蛋白激酶都有一個(gè)共同的催化結(jié)構(gòu)域(約270個(gè)氨基酸),通過(guò)催化結(jié)構(gòu)域的序列同源性比較,可將蛋白酪氨酸激酶家族分成若干亞家族。蛋白絲/蘇氨酸激酶家族較酪氨酸激酶家族大。此外,還有許多有關(guān)His,Lys和Arg特異性磷酸化酶活性的報(bào)道,但這些酶未被純化,其分子結(jié)構(gòu)也不清楚。   (一)蛋白磷酸激酶的純化 蛋白激酶的純化分微量純化和大量純化兩種,前者通常應(yīng)用在特殊條件下培養(yǎng)的細(xì)胞,后者一般應(yīng)用于特殊的組織器官。微量純化的優(yōu)點(diǎn)是克隆化的細(xì)胞株具有均一的細(xì)胞類型并處于同步的細(xì)胞周期,細(xì)胞內(nèi)成分可被放射性同位素特異標(biāo)記,在細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)加特殊因素可研究細(xì)胞內(nèi)某些感興趣的途徑。缺點(diǎn)是原料少,純化出的蛋白量有限。 對(duì)某種新的蛋白激酶的物理特性一般并不清楚 ,因此對(duì)未知蛋白激酶的純化沒(méi)有一個(gè)固定的程序。為了從有限的原材料中純化蛋白激酶,通常采用的策略是:  ?、僭谶M(jìn)行GX的親和純化以前采用傳統(tǒng)的色譜方法去除含量Z多的雜蛋白;  ?、谠诩兓缙谌コ齓Z劑和失活劑;  ?、厶幚眢w積應(yīng)盡快減小并避免透析;  ?、芗兓襟E盡量快并避免冷凍。   用于去除大量雜蛋白的傳統(tǒng)色譜技術(shù)包括陽(yáng)離子和陰離子交換、疏水和凝膠排阻色譜。這些技術(shù)在許多有關(guān)蛋白質(zhì)純化的書(shū)籍中都有詳細(xì)介紹,酶純化的理想方案應(yīng)在各步驟間不經(jīng)透析即能進(jìn)行順利過(guò)渡。如離子交換步驟以后進(jìn)行疏水色譜;凝膠排阻色譜放在Z后使蛋白質(zhì)和鹽分子分開(kāi),但要注意在凝膠排阻介質(zhì)中加入0.2~0.5mol/L鹽以防酶非特異地與介質(zhì)結(jié)合或聚合。檢查酶在離子交換和疏水柱上的結(jié)合和洗脫行為的Z簡(jiǎn)單方法是根據(jù)酶的理化特性將少量介質(zhì)與少部分蛋白激酶在合適的pH下混合,然后變化離子強(qiáng)度后分析上清中酶的活性。完成以上純化步驟后,可以進(jìn)行親和純化(常用的親和配基為三磷酸核苷、底物或效應(yīng)物分子)。通過(guò)GX親和純化手段使蛋白磷酸激酶達(dá)到104~106倍數(shù)的純化,才能使產(chǎn)物達(dá)到均一。 為了自培養(yǎng)細(xì)胞或組織器官中純化蛋白激酶 ,通常選用惰性系統(tǒng),如Pharmacia的FPLC系統(tǒng)。該系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn)是具有很大的內(nèi)在惰性,并具有保持大分子生物活性的特點(diǎn)。該系統(tǒng)在一個(gè)單元內(nèi)含有單一的硬件,可在冷室和室溫操作。此外,可采用快速的梯度(40~45分鐘)形式和較廣適用范圍的GX凝膠和柱系統(tǒng)。這是因?yàn)樵诖藯l件下多數(shù)蛋白質(zhì)不與樹(shù)脂結(jié)合,包括能使激酶失活的磷酸酶。然而,許多激酶盡管其表現(xiàn)等電點(diǎn)≤5.5,但在中性條件下仍可與MonoS結(jié)合,這可能是由于其磺酸基與ATP或底物分子結(jié)構(gòu)有些類似。大體積抽提物可用泵直接進(jìn)樣,并進(jìn)行連續(xù)兩次的離子交換分離。FPLC預(yù)裝的凝膠排阻柱可在30分鐘內(nèi)完成分離,較傳統(tǒng)凝膠快得多。但由于柱填料粒度小,上樣體積不超過(guò)200μl,樣品量不超過(guò)5~10mg,純化量較小有些性質(zhì)難以鑒定,因而需多次純化。Pharmacia引入一種新的介質(zhì)(Sephacryl HR)較傳統(tǒng)的超細(xì)膠流速快5倍,這些凝膠在很大程度上減小了凝膠過(guò)濾色譜的時(shí)間。在完成親和純化后,酶的純度可用SDS-PAGE檢測(cè)并定量測(cè)定其比活性。   (二)蛋白磷酸激酶的活性分析    蛋白激酶活性分析分為兩步:  ?、倌┒藰?biāo)記的三磷酸核苷核供體(通常是ATP,有時(shí)用GTP)中的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)或肽底物上;  ?、趯⒘姿峄牡孜锓蛛x出并進(jìn)行定量分析。   前者通常在溶液中進(jìn)行,酶和底物均在液相中。后者為了去除游離的標(biāo)記核苷酸,通常需要用三氯醋酸沉淀、SDS-PAGE分離或使標(biāo)記底物結(jié)合于纖維素膜上。   有時(shí)可將酶或底物固定于固相載體上,如蛋白質(zhì)混合物經(jīng)SDS-PAGE后轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,然后封閉,放入含有酶和標(biāo)記ATP的溶液中?;蛘吒M(jìn)一步,設(shè)計(jì)一個(gè)蛋白激酶分析系統(tǒng)(酶活性的原位分析),將蛋白激酶和它的底物均固定于硝酸纖維素膜上,這一方法可與標(biāo)準(zhǔn)的液相分析方法達(dá)到相等的靈敏度和線性范圍。其分析原理是含有蛋白激酶活性的樣品先固定于硝酸纖維素膜上(點(diǎn)滴或真空抽吸),然后將濾膜浸入合適的蛋白底物溶液中,底物蛋白質(zhì)與剩余的膜結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合,然后加入同位素標(biāo)記的ATP,作用一定時(shí)間后洗去膜上未反應(yīng)的ATP并終止反應(yīng),參入物經(jīng)放射自顯影或液閃計(jì)數(shù)定量,與膜結(jié)合的酶和底物均具有一定的運(yùn)動(dòng)性,兩者反應(yīng)的定量值代表磷酸化的程度。   以酪蛋白激酶Ⅱ的活性測(cè)定方法為例:   試劑:緩沖液A25mmol/L Tris,1mmol/L EDTA,100mmol/LNaCl,pH8.0   緩沖液B25mmol/L Tris,1mmol/LEDTA,200mmol/L NaCl,10%甘油   (V/V),1mmol/L DTT,pH8.0   酪蛋白激酶Ⅱ底物 水解或部分脫磷酸的酪蛋白10mg/ml溶解于緩沖液A中。   酪蛋白激酶Ⅱ反應(yīng)混合物 25mmol/L Tris,pH8.5,100mmol/L NaCl,10mmol/LMgCl2,1mmol/L DTT,0.1μmol/L〔V-32P〕ATP(100Ci/mmol)   操作步驟: 1.剪一適當(dāng)大小的硝酸纖維素膜并劃成25px大小的方格;   2.用緩沖液A浸濕膜并放于一用同樣緩沖液浸濕的濾紙上,使膜平坦;   3.用緩沖液B(含1mg/ml牛血清白蛋白)將樣品稀釋到合適的濃度,膜上每個(gè)點(diǎn)所加的樣品其激酶活性在0.5~50pmol單位(1pmol單位代表每分鐘轉(zhuǎn)移1pmol 32P的酶量),當(dāng)酶比活性在1μmol/min·mg-1時(shí)則每個(gè)點(diǎn)應(yīng)加純酶0.5~50ng; 用微量加樣器加1~5μl樣品于膜上方格ZY ,待液滴消失后將膜面對(duì)含有緩沖液A(包括1~10mg/ml的底物)的Parafilm封口膜(貼于玻璃平板上),在濕潤(rùn)環(huán)境中23℃作用30分鐘。大片膜可密封于塑料袋中;   5.在100ml緩沖液A中洗膜并置于一新的Parafilm膜上(加有反應(yīng)混合物溶液25   μl/cm2),23℃作用5~30分鐘;   6.用緩沖液A 100ml洗膜4次,空氣干燥后進(jìn)行放射自顯影?;蚯谐煞綁K進(jìn)行液閃計(jì)數(shù)定量。 該方法在應(yīng)用時(shí)Z常見(jiàn)的問(wèn)題是硝酸纖維素膜過(guò)載(指總蛋白或酶活力單位)。硝酸纖維素膜結(jié)合BSA的線性范圍可達(dá)50μg/cm2(相當(dāng)于每斑點(diǎn)5μg),而結(jié)合容量可達(dá)500μg/cm2,如果樣品本身造成蛋白質(zhì)超載,則應(yīng)降低稀釋液中的BSA濃度。同時(shí)應(yīng)注意不要加過(guò)量的酶,因?yàn)槌^(guò)50pM單位即超過(guò)了該方法的線性范圍,并可能影響硝酸纖維素膜鄰近斑點(diǎn)的檢測(cè)。該方法用于其它蛋白激酶檢測(cè)時(shí)應(yīng)適當(dāng)變換測(cè)定條件。因蛋白激酶活性的斑點(diǎn)印跡方法與標(biāo)準(zhǔn)的液相方法在靈敏度、檢測(cè)范圍、線性等方面相當(dāng),所以可以代替后者進(jìn)行常規(guī)檢測(cè)。也在天然凝膠電泳和轉(zhuǎn)移電泳后分析蛋白激酶活性的分布,可用于分析酶在不同發(fā)育階段各組織表達(dá)的變化、cDNA克隆分析和突變體分析。

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顯微鏡|Echo Revolve顯微鏡在血腦屏障功能研究中的

血腦屏障 (BBB) 是哺乳動(dòng)物的一種特殊結(jié)構(gòu),通過(guò)調(diào)節(jié)血液和血液之間離子、氧氣和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的流入和流出,將大腦與血液分開(kāi),并維持zhongshu神經(jīng)系統(tǒng) (CNS) 的穩(wěn)態(tài)。該屏障主要由腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞 (BMEC)、星形膠質(zhì)細(xì)胞和周細(xì)胞組成。

轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1 (TGFβ1) 是轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β (TGFβ) 家族成員之一,是一種多效性細(xì)胞因子,在多種病理和生理過(guò)程中發(fā)揮重要作用。

Hedgehog信號(hào)通路是重要的信號(hào)傳導(dǎo)通路,在多個(gè)物種中是保守的,并且在生理和病理過(guò)程的許多方面發(fā)揮著重要作用。典型Hedgehog信號(hào)由三種分泌配體Shh、Ihh和Dhh激活,細(xì)胞間信號(hào)由轉(zhuǎn)錄因子Gli1、Gli2和Gli3轉(zhuǎn)導(dǎo)。在zhongshu神經(jīng)系統(tǒng)中,Hedgehog信號(hào)通路決定了神經(jīng)管的形成和發(fā)育。

目前,已有研究表明Hedgehog信號(hào)與TGFβ1級(jí)聯(lián)反應(yīng)在癌癥發(fā)展和轉(zhuǎn)移中的相互作用。那么Hedgehog信號(hào)和TGFβ1級(jí)聯(lián)反應(yīng)之間的串?dāng)_是否會(huì)影響血腦屏障的功能呢,目前還尚不清晰。

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和湖北省預(yù)防獸醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合在Brain Sciences雜志上發(fā)表了一篇名為《Astrocyte-Derived TGFβ1 Facilitates Blood–Brain Barrier Function via Non-Canonical Hedgehog Signaling in Brain Microvascular Endothelial Cells》,該文闡明了TGFβ1 介導(dǎo)的星形膠質(zhì)細(xì)胞和大腦內(nèi)皮細(xì)胞之間的細(xì)胞間交流,這一發(fā)現(xiàn)將拓寬關(guān)于血腦屏障內(nèi)穩(wěn)態(tài)的現(xiàn)有知識(shí),也可能有助于進(jìn)一步改善血腦屏障功能障礙的治療策略。

作者通過(guò)構(gòu)建人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞 (hBMECs) 與U251的單培養(yǎng)和共培養(yǎng)模型,證實(shí)了星形膠質(zhì)細(xì)胞衍生的TGFβ1增強(qiáng)了BMECs的屏障功能。實(shí)時(shí)熒光定量PCR、免疫印跡和酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)等多種實(shí)驗(yàn)表明TGFβ1在BMECs中觸發(fā)Smad2/3的激活增加了Gli2的表達(dá),Gli2是Hedgehog信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。Gli2與ZO-1啟動(dòng)子結(jié)合,增強(qiáng)ZO-1的表達(dá),從而維持血腦屏障。星形膠質(zhì)細(xì)胞來(lái)源的TGFβ1觸發(fā)BMECs中的TGFβ1-TGFBRII-Smad2/3-Gli1/2-ZO-1軸并維持正常的BBB功能。

文中作者通過(guò)免疫熒光技術(shù),利用Echo Revolve正倒置一體顯微鏡進(jìn)行免疫熒光觀察。使用50ng/mL的重組TGFβ1 (rTGFβ1) 來(lái)刺激單層hBMECs,BMECs用綠色CD31標(biāo)記,結(jié)果表明與對(duì)照組相比,ZO-1表達(dá)顯著增加。

用4mg/kg的TGFβ/Smads信號(hào)抑制劑SD208處理小鼠,圖中虛線環(huán)表示BMECs中的Gli1或Gli2的表達(dá)量,結(jié)果表明與對(duì)照組相比,ZO-1、 Gli1和Gli2表達(dá)量均減少。

內(nèi)皮屏障功能方面發(fā)揮重要作用,提高了對(duì)血腦屏障功能的研究。這一發(fā)現(xiàn)也可能表明未來(lái)有可能使用TGFβ1和Hedgehog信號(hào)級(jí)聯(lián)來(lái)輔助治療血腦屏障功能障礙。


參考文獻(xiàn):

Fu J, Li L, Huo D, et al. Astrocyte-Derived TGFβ1 Facilitates Blood-Brain Barrier Function via Non-Canonical Hedgehog Signaling in Brain Microvascular Endothelial Cells. Brain Sci. 2021;11(1):77. Published 2021 Jan 8. doi:10.3390/brainsci11010077


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無(wú)人機(jī)在大氣環(huán)境巡查中發(fā)揮的作用

無(wú)人機(jī)是一種以無(wú)線電遙控或由自身程序控制為主的不載人飛機(jī)。按照系統(tǒng)組成和飛行特點(diǎn),無(wú)人機(jī)可分為固定翼型無(wú)人機(jī)、無(wú)人駕駛直升機(jī)兩大類。固定翼型無(wú)人機(jī)通過(guò)動(dòng)力系統(tǒng)和機(jī)翼的滑行實(shí)現(xiàn)起降和飛行,遙控飛行和程控飛行均容易實(shí)現(xiàn),抗風(fēng)能力也比較強(qiáng),類型較多,能同時(shí)搭載多種遙感傳感器。

 

 無(wú)人機(jī)用于環(huán)境監(jiān)測(cè)主要是以遙感(UAVRS)技術(shù)作為hk遙感手段,具有續(xù)航時(shí)間長(zhǎng)、影像實(shí)時(shí)傳輸、高危地區(qū)探測(cè)、成本低、高分辨率、機(jī)動(dòng)靈活等優(yōu)點(diǎn),是衛(wèi)星遙感與有人機(jī)hk遙感的有力補(bǔ)充。

 

 其利用高分辨CCD相機(jī)系統(tǒng)獲取遙感影像,利用空中和地面控制系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)影像的自動(dòng)拍攝和獲取,同時(shí)實(shí)現(xiàn)航跡的規(guī)劃和監(jiān)控、信息數(shù)據(jù)的壓縮和自動(dòng)傳輸、影像預(yù)處理等功能,可為各級(jí)環(huán)境監(jiān)測(cè)部門(mén)及環(huán)境信息化建設(shè)提供一體化的解決方案,并可滿足環(huán)境應(yīng)急響應(yīng)的需求。

 

 無(wú)人機(jī)監(jiān)測(cè)有哪些優(yōu)勢(shì)?

  快速、GX

  針對(duì)應(yīng)急事件,無(wú)人機(jī)可立刻對(duì)監(jiān)測(cè)區(qū)進(jìn)行大范圍監(jiān)測(cè),單臺(tái)無(wú)人機(jī)日監(jiān)測(cè)能力達(dá)到200~320平方公里。監(jiān)測(cè)結(jié)果能在短時(shí)間內(nèi)生成高清晰圖像數(shù)據(jù)和水體透明度、富營(yíng)養(yǎng)化等多種ZT數(shù)據(jù)。污染事故發(fā)生后可快速提供三維水體污染狀況變化預(yù)估并發(fā)布,用于決策。

  直觀、全面

  無(wú)人機(jī)拍攝生成的高清晰圖像可直觀辨別污染源、污染口、可見(jiàn)漂浮物等,并生成分布圖,為環(huán)境評(píng)價(jià)、環(huán)境監(jiān)察提供依據(jù)。其生成的多光譜圖像可直觀、全面地監(jiān)測(cè)地表水環(huán)境質(zhì)量狀況,水質(zhì)富營(yíng)養(yǎng)化、水華、有機(jī)污染程度及清澈透明程度、排污口排水污染程度等信息的ZT圖,從而達(dá)到對(duì)水質(zhì)特征污染物監(jiān)視性監(jiān)測(cè)的目的。

  大尺度、宏觀性

  無(wú)人機(jī)通過(guò)不同航高可實(shí)現(xiàn)高空間、大面積監(jiān)測(cè),也可實(shí)現(xiàn)低空間較小范圍精確監(jiān)測(cè),也可多架、多次同時(shí)對(duì)上萬(wàn)平方公里測(cè)區(qū)進(jìn)行監(jiān)測(cè)。通過(guò)多光譜分析,得到大面積測(cè)區(qū)的各項(xiàng)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù).

  高分辨率、處理速度快

  無(wú)人機(jī)上搭載的攝像裝備其影像分辨率可以達(dá)到0.1~0.5米,分辨率優(yōu)于目前國(guó)內(nèi)外一些高分辨率衛(wèi)星影像數(shù)據(jù);數(shù)據(jù)采集和處理速度快,其采集能力能達(dá)到每天采集和處理近4000平方公里。

  成本低、集成性強(qiáng)

  兼具衛(wèi)星影像的價(jià)格和hk影像的快速采集優(yōu)勢(shì),采用高性能自動(dòng)處理技術(shù),可完成數(shù)據(jù)的預(yù)處理、精加工及鑲嵌及高程數(shù)據(jù)生成,整體數(shù)據(jù)費(fèi)用低。

配有進(jìn)口的電化學(xué)傳感器,采用擴(kuò)散式氣體監(jiān)測(cè)方法,測(cè)量準(zhǔn)確、操作簡(jiǎn)單、利用專用支架安裝到無(wú)人機(jī)上,從而實(shí)現(xiàn)空中軌跡的氣體監(jiān)測(cè),利用軟件平臺(tái)、集成顯示經(jīng)緯度、高度、溫濕度、PM2.5、PM10、CO、O3、SO2、NO2、VOC、等參數(shù)的監(jiān)測(cè)與三維立體空間的空氣質(zhì)量分析。


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