怎樣選擇(設(shè)計測序用引物?

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2019-09-12 10:24:58

<span style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;color: rgb(51, 51, 51);Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_18">測序用引物要求非常嚴格,不同于PR用引物。<span style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;color: rgb(51, 51, 51);Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_19">(1)長度在15~25個堿基左右,一般選擇20個堿基(根據(jù)GC含量作適當調(diào)整)<span style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;color: rgb(51, 51, 51);Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_19"><span style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;color: rgb(51, 51, 51);Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_19">(2)3'端盡量選擇G或C堿基<span class="result-text" style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;display: inline-block; vertical-align: top; color: rgb(51, 51, 51); width: 238px;Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_20">(3)Tm溫度應(yīng)選擇50℃~70℃左右(4)GC含量應(yīng)選擇在50%左右,盡量避開A、T、G、C的連續(xù)結(jié)構(gòu)(5）避開引物自身形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)或引物二聚體結(jié)構(gòu)等復雜結(jié)構(gòu)(6）保證引物和模板匹配,特別是3端的幾個堿基一定要匹配。同時必須嚴格保證引物和模板之間只能有一個結(jié)合位點<span class="result-text" style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;display: inline-block; vertical-align: top; color: rgb(51, 51, 51); width: 238px;Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_20"><span style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;color: rgb(51, 51, 51);Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_21"> <span style="position:relative;line-height:2em;font-size:16px;font-family:Microsoft YaHei;color: rgb(51, 51, 51);Helvetica Neue", Helvetica, PingFangSC-Regular, "Hiragino Sans GB", "Microsoft YaHei", SimSun, sans-serif; background-color: rgb(250, 250, 250);" data-x-flag="10_19"> 

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