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如何設計基因cds序列的pcr引物

一棉天行健 2017-11-21 08:28:52 610  瀏覽
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全部評論(1條)

  • 幻雪夜57 2017-11-21 19:42:41
    提取細胞總RNA然后用試劑盒反轉錄成cDNA,用cDNA作為模板擴增基因的CDS區(qū),然后想要轉染進細胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部復制下來,在primer 5.0 中。正向引物直接從CDS的diyi個核酸開始(比如18bp),反向引物從CDSZ后一個核酸開始,向前選擇序列(比如17bp),調節(jié)2個引物的長度(不一定要一致),盡量避免錯配,二聚體,產生錯的產物即可。Z后在引物的5‘端添加酶切位點以及保護堿基。

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老師,你好,我想問克隆基因CDS區(qū)的時候,要設引物,設引物的時候,怎么設比較好
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麻煩哪位高手?。?!設計擴增以下基因的引物,并給出PCR反應的參數(shù)。
基因序列如下: 5'-GTAGATGGACTTATGCCGTCCCGGTGACTCCTGGAATAATCGTCCATCCACTCTAAATCAGTTACGGCCTTATCCGCAGGAGTTGAAGTACAAAGGATGTATGATTCGAGGCTTACGGAGTAGAGATGTTCATTTTTCCAGCTTTCAATGGTCTCATGACACATGAGGGACTCGATGGGAAACTCAGGTGTGTAAGTGCTAACTGGGTCTGGGAATAGATG... 基因序列如下: 5'-GTAGATGGACTTATGCCGTCCCGGTGACTCCTGGAATAATCGTCCATCCACTCTAAATCAGTTACGGCCTTATCCGCAGGAGTTGAAGTACAAAGGATGTATGATTCGAGGCTTACGGAGTAGAGATGTTCATTTTTCCAGCTTTCAATGGTCTCATGACACATGAGGGACTCGATGGGAAACTCAGGTGTGTAAGTGCTAACTGGGTCTGGGAATAGATGGCGTGCAGTGTAGTCGAAGTC-3’ 展開
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