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什么是直接測序

b小含 2011-02-11 04:56:02 532  瀏覽
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全部評論(2條)

  • 墩烙肇偈鶴壩 2011-02-12 00:00:00
    i don't know

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  • 墨尐顏爬 2016-12-02 02:36:56
    DNA測序的方法有很多種. 目前Z常見的是雙脫氧終止法了. 在測序用的緩沖液中含有四種dNTP及聚合酶. 測序時分成四個反應, 每個反應除上述成分外分別加入2,3-雙脫氧的A, C, G, T核苷三磷酸(稱為ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP), 然后進行聚合反應. 在diyi個反應物中, ddATP會隨機地代替dATP參加反應一旦ddATP加入了新合成的DNA鏈, 由于其3位的羥基變成了氫, 所以不能繼續(xù)延伸. 所以diyi個反應中所產(chǎn)生的DNA鏈都是到A就終止了; 同理第二個反應產(chǎn)生的都是以C結尾的; 第三個反應的都以G結尾, 第四個反應的都以T結尾, 電泳后就可以讀出序列了. 也許這樣說你不一定明白. 舉一個例子, 假如有一個DNA, 互補序列是GATCCGAT, 我們試著做一下: 在diyi個反應中由于含有dNTP+ddATP, 所以遇到G, T, C三個堿基時沒什么問題, 但遇到A時, 摻入的可能是dATP或ddATP, 比如已合成到G, 下一個如果參與反應的是ddATP則終止, 產(chǎn)生一個僅有2個核苷酸的序列: GA, 否則繼續(xù)延伸, 可以產(chǎn)生序列GATCCG, 又到了下一個A了. 同樣有兩種情況, 如果是ddATP摻入, 則產(chǎn)生的序列是GATCCGA, 延伸終止, 否則可以繼續(xù)延伸, 產(chǎn)生GATCCGAT. 所以在diyi個反應系統(tǒng)中產(chǎn)生的都是以A結尾的片段: GA, GATCCGA, 同理在第二個反應中產(chǎn)生的都是以C結尾的片段: GATC, GATCC, 在第三個反應中產(chǎn)生的都是以G結尾的片段: G, GATCCG 在第四個反應中產(chǎn)生的都是以T結尾的片段: GAT, GATCCGAT, 電泳時按分子量大小排列, A反應的片段長度為2, 7; C反應的為4, 5; G反應的為1, 6; T反應的為3, 8, 四個反應的產(chǎn)物分別電泳, 結果為 8 7 6 5 4 3 2 1 A | | C | | G | | T | | 我們可以從右向左讀, 為GATCCGAT, 至此, 測序完成(上面這個圖在百度知道中顯示不正常, 因為百度知道的網(wǎng)頁用的是比例字體, 你如果想看它, 拷貝到記事本中, 用等寬的字體來看).

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