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亞硫酸鹽處理的dna可以直接測序嗎

b小含 2017-03-15 04:39:41 563  瀏覽
  •  

參與評(píng)論

全部評(píng)論(1條)

  • 憶飽商 2017-03-16 00:00:00
    普通的測序不能找到甲基化位點(diǎn)。 這里有幾種常用的找甲基化位點(diǎn)的測序方法: diyi種是重亞硫酸鹽測序。重亞硫酸鹽使DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,行PCR擴(kuò)增(引物設(shè)計(jì)時(shí)盡量避免有CpG,以免受甲基化因素的影響)所需片段,則尿嘧啶全部轉(zhuǎn)化成胸腺嘧啶。Z后,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序,并且與未經(jīng)處理的序列比較,判斷是否CpG位點(diǎn)發(fā)生甲基化。

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    評(píng)論

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