国产三级在线看完整版-内射白嫩大屁股在线播放91-欧美精品国产精品综合-国产精品视频网站一区-一二三四在线观看视频韩国-国产不卡国产不卡国产精品不卡-日本岛国一区二区三区四区-成年人免费在线看片网站-熟女少妇一区二区三区四区

儀器網(wǎng)(yiqi.com)歡迎您!

| 注冊(cè)2 登錄
網(wǎng)站首頁-資訊-話題-產(chǎn)品-評(píng)測(cè)-品牌庫(kù)-供應(yīng)商-展會(huì)-招標(biāo)-采購(gòu)-知識(shí)-技術(shù)-社區(qū)-資料-方案-產(chǎn)品庫(kù)-視頻

問答社區(qū)

基因組測(cè)序中,什么是測(cè)序深度和覆蓋度

巨Any 2018-01-28 10:34:36 854  瀏覽
  •  

參與評(píng)論

全部評(píng)論(1條)

  • 我前天訂的 2018-01-29 00:00:00
    測(cè)序深度是指測(cè)序數(shù)據(jù)對(duì)基因組覆蓋深度,如人類基因組有3G,我們測(cè)了過濾得到clean data 90G數(shù)據(jù)量,那么測(cè)序深度是90/3=30x,覆蓋度是,90G數(shù)據(jù)比對(duì)到人類參考基因組上,可以覆蓋基因組的比例,如覆蓋度80%

    贊(8)

    回復(fù)(0)

    評(píng)論

熱門問答

基因組測(cè)序中,什么是測(cè)序深度和覆蓋度
 
2018-01-28 10:34:36 854 1
高通量基因組測(cè)序中,什么是測(cè)序深度和覆蓋
 
2017-12-19 06:15:31 722 1
什么叫低覆蓋度基因組測(cè)序?
 
2018-12-07 08:57:44 610 0
基因組測(cè)序的測(cè)序深度一般是多少
 
2017-10-04 21:50:09 1639 1
簡(jiǎn)化基因組測(cè)序和基因組測(cè)序的區(qū)別
 
2017-06-28 09:49:01 551 1
測(cè)序的覆蓋度是怎樣確定的
 
2016-12-01 09:29:12 467 1
測(cè)序深度
百度百科的解釋是“測(cè)序深度(Sequencing Depth):測(cè)序得到的堿基總量(bp)與基因組大小(Genome)的比值,它是評(píng)價(jià)測(cè)序量的指標(biāo)之一?!?我的問題是:所說的“測(cè)序得到的堿基總量(bp)”,是得到的Z原始的堿基總量?還是filter、去雜之后的堿基總量?
2017-11-26 05:57:47 933 1
基因組測(cè)序和外顯子組測(cè)序有什么差異
 
2017-12-08 01:01:50 532 1
基因組測(cè)序 和簡(jiǎn)化基因組測(cè)序的區(qū)別 價(jià)格比較
 
2015-09-04 19:58:44 454 1
全基因組重測(cè)序和基因組測(cè)序有什么區(qū)別
 
2015-06-09 18:13:40 774 1
簡(jiǎn)化基因組測(cè)序和全基因組測(cè)序的區(qū)別
 
2017-08-17 04:11:06 1187 1
深度測(cè)序和普通的二代測(cè)序有什么區(qū)別?有什么應(yīng)用

有兩種體細(xì)胞突變?nèi)菀妆缓鲆昩ai,一種是局限在特定組織的突變。舉例來說,如果突變只存在于大腦,而我們檢測(cè)的是血液,那就找不到這些致病突變。另一種致病性體細(xì)胞突變雖然發(fā)生在所有組織中,但是只影響一部分細(xì)胞,因此不容易被檢測(cè)到。

  普通的二代測(cè)序,全基因組或外顯子組測(cè)序是將DNA分成小片段,然后對(duì)各個(gè)片段多次讀?。ㄒ话闶侨危H欢?,如果突變只發(fā)生在15-20%的細(xì)胞中,三十次讀取還不足以可靠地捕捉到它們,尤其是當(dāng)突變只影響一個(gè)基因拷貝時(shí)。

  Walsh和博士后Saumya Jamuar通過“定向高覆蓋度測(cè)序”技術(shù),為158名腦部疾病的患者鑒定致病突變,這些患者的癥狀包括癲癇、智力障礙、語言障礙等。

  研究人員并沒有分析整個(gè)基因組或外顯子組(所有蛋白編碼基因),而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上,并且大大提高了測(cè)序的深度。

  在一些疾病如唐氏綜合征中,嵌合突變相較于影響全身細(xì)胞的突變,產(chǎn)生的癥狀要輕一些。但是很少量的變異細(xì)胞就足以引發(fā)損害人身心健康的癥狀,在以往的研究中,為了從普通基因組中檢測(cè)到這些突變,研究人員就不得不增加測(cè)定的序列數(shù)量。而對(duì)少數(shù)候選基因區(qū)域進(jìn)行的平均300次深度測(cè)序,就可以有效辨別被誤認(rèn)為測(cè)序錯(cuò)誤的突變。


2020-10-23 15:49:28 615 0
為什么高通量測(cè)序dna是深度,rna測(cè)序是多少m
 
2017-08-04 23:16:33 711 1
“人類基因組計(jì)劃”中的基因組測(cè)序工作是指測(cè)定什么?
 
2013-04-05 05:29:42 382 1
測(cè)序深度500x什么意思
 
2018-11-17 00:05:04 463 0
RNA測(cè)序與整個(gè)基因組測(cè)序相比有什么優(yōu)勢(shì)?
 
2014-03-06 10:50:11 506 1
RNA測(cè)序與整個(gè)基因組測(cè)序相比有什么優(yōu)勢(shì)
 
2017-10-01 10:28:34 437 1
三代測(cè)序 植物基因組測(cè)序參考文獻(xiàn)有哪些?
 
2017-03-16 06:06:09 524 1
基因組測(cè)序什么物種是N,什么物種是N+1RT
 
2018-11-25 21:18:55 253 0
基因組測(cè)序 都怎么提基因組,用什么試劑盒
 
2016-10-15 08:17:55 412 1

4月突出貢獻(xiàn)榜

推薦主頁

最新話題