本期快問快答,
智薈專線將為大家繼續(xù)梳理
凝膠過濾層析的常見問題。
本篇主要關(guān)注凝膠過濾層析的
原理、過程、樣品準(zhǔn)備等通用問題。
Q1
什么是凝膠過濾層析?
體積排阻色譜(SEC),也稱為凝膠過濾(Gel Filtration Chromatography,簡稱GF)是一種基于分子大小和形狀進行分離的層析技術(shù),其原理主要依賴于分子篩效應(yīng)。
凝膠過濾層析利用多孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的球形凝膠顆粒作為固定相,當(dāng)樣品通過凝膠柱時,大小和形狀不同的分子會以不同的路徑和速度通過柱體。
凝膠過濾層析屬于非吸附式層析,不依賴于分子與固定相之間的吸附作用,而是根據(jù)分子大小的差異來實現(xiàn)分離。這種分離方式的優(yōu)點是操作簡單、溫和,對樣品的活性影響較小1。
Q2
體積排阻色譜的工作原理是什么?
凝膠過濾填料是由球狀(beads)的多孔基質(zhì)組成,基質(zhì)較為惰性且吸附性較低。樣品進入色譜柱后:
對于超過凝膠分離范圍的大分子來說,此類分子的尺寸大于微球上的所有孔徑,所以無法擴散到凝膠微球中,只能在凝膠顆粒之間的空隙中流動,行進路徑較短流速較快,先從柱中流出,因此大分子首先洗脫。
對于處于凝膠分離范圍內(nèi)的中等大小分子來說,此類分子不同程度的進入到微球內(nèi)部,它們的行進路徑是凝膠顆粒間的空隙和凝膠顆粒的部分內(nèi)孔,所以行進路徑更長需要的時間也更長,因此這類分子在中間階段洗脫出來。
對于小于凝膠分離范圍的分子,這類分子小于微球的最小孔隙,它們的行進路徑是凝膠顆粒間的空隙和凝膠顆粒的所有內(nèi)孔,也就是運行了柱子內(nèi)所有的孔隙體積。因此運行路徑最長,這類小分子將最后洗脫??蓞⒖枷路侥z過濾原理的視頻。
圖1:典型的高分辨率SEC分離示意圖
Q3
凝膠過濾層析有哪些分類?
凝膠過濾層析柱主要有三類,分別是制備型、分析型、組分分離型。
制備型的凝膠過濾層析柱使用長柱(通常為60 cm 或更長)并以低流速運行,上樣量為柱體積的0.5%-4%,填料粒徑通常>12 μm,層析柱運行時背壓很低。
分析型的凝膠過濾層析柱用于檢測樣品的質(zhì)量或研究生物分子的性質(zhì),上樣量非常少,通常為柱體積的0.3%-0.5%,使用長柱(通常為30 cm)并以低流速運行。
填料粒徑通常為4-12 μm,要求層析柱分辨率較高,預(yù)裝柱(供應(yīng)商已經(jīng)將層析填料高質(zhì)量的裝填到層析柱中,無需客戶自行裝填,到手即可使用)是確保可靠結(jié)果和便利性的絕佳選擇。
另外分析型凝膠過濾層析柱也可用于樣品純度的快速檢查和篩選。通常選用柱高為15 cm的高分辨率柱,循環(huán)時間短,上樣量小,buffer消耗低。的Increase 5/150系列,幾分鐘就可以完成一次循環(huán)。
組分分離型一般是將小分子(如鹽或游離標(biāo)記物)與一組較大的分子(如蛋白質(zhì))分離,因此對于層析柱的分辨率要求較低。
主要用來做樣品脫鹽和緩沖液置換,上樣量較大可達柱體積的30%,使用寬而短的層析柱并以高流速運行。填料粒徑相對較大,背壓較低。圖2為凝膠過濾預(yù)裝柱的幾款明星產(chǎn)品。
圖2:幾款SEC明星產(chǎn)品
Q4
凝膠過濾中的一些名詞都代表什么?
Ve為洗脫體積,Vo為外水體積,Vc為柱體積。Kav是分配系數(shù),代表分子的入孔能力。
圖3:層析術(shù)語及其示意圖
Q5
樣品和緩沖液需要注意什么?
緩沖液和樣品組成是實現(xiàn)高分辨率的重要因素。蛋白質(zhì)的性質(zhì)(如電荷基團數(shù)量、疏水性和大?。绊慡EC的分離。
因此,填料必須在多種緩沖液中保持化學(xué)穩(wěn)定,并盡可能減少由于樣品和填料之間的相互作用而導(dǎo)致的保留時間、峰面積和分離度的變化。SEC應(yīng)用中通常使用pH值在6.0-8.0之間的緩沖液,因為許多蛋白質(zhì)在該pH范圍內(nèi)是穩(wěn)定的。50 mM磷酸鹽、150 mM氯化鈉(pH值為7.0)的緩沖液適用于許多SEC分離。
此外,選擇對目標(biāo)蛋白質(zhì)有益的離子強度也很重要。離子強度過高也可能會增加填料和蛋白質(zhì)之間的疏水相互作用,從而影響保留時間以及峰面積和分離度。
一些小Tips:
使用高質(zhì)量的水和化學(xué)試劑。溶液使用前應(yīng)通過0.45 μm或0.22 μm濾膜過濾和脫氣。
緩沖液和色譜柱在使用前必須具有相同的溫度。溫度的快速變化,例如從冷藏室中取出的層析柱在室溫下使用緩沖液,會在柱床中引入氣泡,從而導(dǎo)致分離效果不佳。
樣品必須澄清且無顆粒物。對于小體積樣品,可選用醋酸纖維素,再生纖維素或聚偏二氟乙烯材質(zhì)的針頭式濾器進行過濾,微量樣品可采用高速離心的方法去除樣品中不溶物。
Q6
關(guān)于樣品和緩沖液的粘度
樣品粘度增加對于分離度的影響很小,但可能會導(dǎo)致色譜柱上的背壓增加。
對于高粘度溶液和/或低溫溶液,請使用較低的運行流速。當(dāng)運行高粘性樣品(例如含有甘油的樣品)時,如果在上樣期間背壓增加,則可能需要稀釋樣品或降低流速。粘度隨溫度而變化。如果樣品與所用緩沖液的粘度相差不超過1.5倍,通常不會影響分離。
如果樣品的粘度非常高,則可以通過增加洗脫液的粘度來補償,例如添加蔗糖或葡聚糖。
另請注意,液體的粘度隨著鹽濃度的增加而增加。混合有機溶液也會影響粘度,例如50%乙醇溶液的粘度遠(yuǎn)高于純水和100%乙醇。具體的推薦流速可參考各產(chǎn)品說明書。圖4為Superdex 30 Increase 10/300 GL層析柱推薦的最大流速。
圖4:Superdex 30 Increase 10/300GL推薦的最大運行流速
Q7
SEC 層析柱如何進行清潔?
定期清潔層析柱(例如每運行3-5次后)將延長其壽命,并有助于實現(xiàn)層析柱的最佳性能。
清潔可去除可能積聚在色譜柱上的任何沉淀蛋白質(zhì)或其他污染物。除了常規(guī)清潔外,如果您在柱床頂部看到變色或背壓大幅增加,您也應(yīng)該清洗層析柱。
SEC層析柱對高pH具有良好的耐受,可以用NaOH多次清洗。NaOH的濃度取決于填料類型:Superose和Superdex色譜柱使用0.5 M NaOH,而Sephacryl層析柱僅使用0.2 M NaOH。
不建議清潔用于脫鹽/緩沖液置換且含有Sephadex的一次性產(chǎn)品。切勿將層析柱存儲在NaOH中。相反,清洗后立即用兩倍柱體積(CV)的水沖洗層析柱,然后用兩倍柱體積的運行緩沖液平衡層析柱。詳細(xì)的清潔方案可參考各產(chǎn)品的說明書。
Q8
層析柱使用后應(yīng)該保存在什么buffer中?
當(dāng)您超過2天不使用層析柱時,請將其儲存在20%乙醇中。
此外,為防止空氣進入色譜柱,請將shipping device(如圖5所示,紅色柱頂端上方連接的形似“針筒“的小裝置,如果產(chǎn)品中已附帶)連接到色譜柱出口。
圖5:Increase層析柱頂端連入shipping device
Q9
層析柱進氣了怎么辦?
少量空氣通常不會影響層析柱的性能。
可用脫氣緩沖液低流速下沖洗層析柱來去除小氣泡。確保緩沖液、系統(tǒng)和層析柱都具有相同的溫度,尤其是緩沖液已儲存在冰箱或冷藏室中時。將層析柱連接到系統(tǒng)時,確保系統(tǒng)的所有部件(包括管路)都充滿液體,以防止空氣進入系統(tǒng)。
如果觀察到柱床內(nèi)的填料出現(xiàn)裂縫,如圖6所示,此時層析柱內(nèi)有較多氣體。請檢查層析系統(tǒng)和層析柱是否出現(xiàn)了漏液的情況2,此時層析柱可能需要重新進行裝填。
圖6:柱床出現(xiàn)裂縫
Q10
的Superdex Increase和Superose Increase系列預(yù)裝柱能否安裝在HPLC上?
的Superdex Increase和Superose Increase層析柱可以使用標(biāo)準(zhǔn)的1/16接頭接入傳統(tǒng)HPLC系統(tǒng),用于分析目的,例如質(zhì)量控制。
初次使用建議先以較低的流速運行,防止超壓,后續(xù)可根據(jù)層析柱的壓力情況調(diào)整運行流速。
關(guān)于凝膠過濾層析的更多問題歡迎直接撥打智薈專線:400-810-9118 轉(zhuǎn)2號線咨詢。
參考資料:
1.CY12707-03Dec20-HB. Principles and methods size exclusion chromatography.
2.CY18970-02Feb20-PD. Maintenance and cleaning of size exclusion chromatography columns.
相關(guān)閱讀:
凝膠過濾的幾道 “彎”
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