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雙熒光素酶報告基因檢測數(shù)據(jù)集

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新時間:2024-12-25 14:21:05 閱讀量:197

雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒因其具有靈敏度高、無細(xì)胞內(nèi)源性表達干擾等優(yōu)勢,現(xiàn)已被廣泛用于基因表達調(diào)控的研究中。該系統(tǒng)包括螢火蟲熒光素酶(Firefly luciferase)和海腎熒光素酶(Renilla luciferase),通過和底物的相互作用檢測基因的表達。通常海腎熒光素酶相對更多地被用作轉(zhuǎn)染效率的內(nèi)參,以消除細(xì)胞數(shù)量和轉(zhuǎn)染效率的差異。該雙報告檢測系統(tǒng)的實驗結(jié)果為螢火蟲熒光素酶的熒光值和海腎熒光素酶的熒光值的比值。
雙報告檢測方法的應(yīng)用十分廣泛,如調(diào)控元件功能研究、轉(zhuǎn)錄因子研究、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、miRNA調(diào)控等。通常把靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件或5’啟動子區(qū)克隆在luciferase的上游,與海腎TK載體共轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中,以研究啟動子的強弱或轉(zhuǎn)錄因子對啟動子的作用;或把3’-UTR區(qū)克隆在luciferase的下游,以研究miRNA對目的基因的調(diào)控作用。
該試劑盒主要應(yīng)用于動物細(xì)胞中,當(dāng)然也有很多小伙伴用于植物中,小翌這邊收集到了一些原始數(shù)據(jù)與大家分享。在這里分成物細(xì)胞植物兩個part。以下案例均使用雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒完成(Yeasen,CAT:11402)。

PartⅠ 動物細(xì)胞篇
 
 
1、實驗?zāi)康?/span>:驗證cGAS150蛋白在293T里是否能激活干擾素通路。
實驗方案:構(gòu)建IFN-β-Luc質(zhì)粒,將其與Ren載體、cGAS150過表達載體共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞。使用Promega GLOMAX 20/20LUMINOMETER酶標(biāo)儀進行后續(xù)檢測。
實驗結(jié)果

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實驗結(jié)論:cGAS150蛋白可激活干擾素通路。
 
2、實驗?zāi)康?/span>:Poly(I:C)是雙鏈RNA的類似物,是一種干擾素的誘導(dǎo)劑。驗證其對干擾素X的調(diào)控作用。
實驗方案:構(gòu)建IFN-1-Luc載體,將其與Ren載體共轉(zhuǎn)染EPC細(xì)胞,給予Poly(I:C)處理24h。使用Promega;E5311酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果

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實驗結(jié)論:Poly(I:C)會誘導(dǎo)IFN-1的表達。
 
3、實驗?zāi)康?/span>:驗證小鼠miR-1與靶基因3’UTR是否發(fā)生作用并進一步確定miR-1與靶基因3’UTR的作用位點。
實驗方案:構(gòu)建Luc-3’UTR-WT載體和Luc-3’UTR-mut載體,分別將它們與mimic NC/mimic miR共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞。使用Promega酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果
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實驗結(jié)論:miR-1的作用靶點是 3’UTR。
 
4、實驗?zāi)康?/strong>驗證轉(zhuǎn)錄因子NRF1的野生型以及突變體形式對于其靶基因A的啟動子序列的調(diào)控作用,比較NRF1野生型以及突變體的轉(zhuǎn)錄活性差異。
注:PGC-1α作為核轉(zhuǎn)錄輔助因子,可輔助NRF-1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,在一定程度上增加NRF-1的活性。A則是被PGC-1α和NRF-1共同作用轉(zhuǎn)錄激活后轉(zhuǎn)運至線粒體。對mtDNA的復(fù)制與轉(zhuǎn)錄起著重要作用。研究發(fā)現(xiàn),NRF-1通過與A基因啟動區(qū)反應(yīng)原件結(jié)合,刺激A基因的轉(zhuǎn)錄。
實驗方案:構(gòu)建Luc-A載體,NRF1 WT/mut表達載體,PGC-1α表達載體,將它們共轉(zhuǎn)染至HEK293T細(xì)胞。使用Promega 9100-102(421)酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果

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實驗結(jié)論NRF1的1,2,4,5號突變體對其轉(zhuǎn)錄活性有抑制作用。
 
5、實驗?zāi)康?/strong>:驗證小分子化合物9-cis-RA(sigma)是否為RXR的激動劑。
實驗方案構(gòu)建pBind-RXR α-LBD載體, 將其與 pG5 質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,同時用不同濃度的9-cis-RA(sigma)處理細(xì)胞。使用GloMax® Discover Microplate Reader_GM3000酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果
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 實驗結(jié)論:9-Cis-RA是RXR的激動劑,與文獻報道的相一致。
 
6、實驗?zāi)康?/span>:驗證IRF3轉(zhuǎn)錄因子與IFN-β啟動子的相互作用。
實驗方案:構(gòu)建Luc-IFN-β載體,將其與IRF3表達載體、Ren載體共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞。使用SpectraMax  L酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果

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實驗結(jié)論轉(zhuǎn)錄因子IRF3對IFN-β啟動子起正調(diào)控作用。

7、實驗?zāi)康?/span>:驗證miR-375與A基因 3’UTR是否結(jié)合從而抑制A基因的表達。
實驗方案:分別構(gòu)建Luc-3’UTR-WT載體和Luc-3’UTR-mut載體。將它們與mimic NC/mimic miR共轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞。使用POLARstar Omega酶標(biāo)儀進行檢測。

實驗結(jié)果

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實驗結(jié)論:3’UTR-WT是miR-375的作用靶點。
 
8、實驗?zāi)康?/strong>驗證靶基因與基因組中的部分基因片段是否發(fā)生作用并進一步確定這些基因與靶基因的作用位點。
實驗方案:構(gòu)建pGL-3 pro-Gene載體及Target gene表達載體,將它們與Ren載體共轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中。通過BERTHOLD centro XS3 LB 900酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果
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實驗結(jié)論:Target gene對Gene 1,4具有明顯的負(fù)向調(diào)控作用。
 
PartⅡ 植物篇
 

 
1、實驗?zāi)康?/strong>:驗證在Y1H篩選后的6個不同轉(zhuǎn)錄因子,對目標(biāo)基因的調(diào)控作用。
實驗方案:構(gòu)建Luc-目標(biāo)基因啟動子載體和TF表達載體,將它們與Ren載體轉(zhuǎn)化至擬南芥的原生質(zhì)體中。通過MiKro Win2000酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果
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實驗結(jié)論:TF1-5對目標(biāo)基因上調(diào),而TF6對目標(biāo)基因起抑制作用。Luc數(shù)值偏低,可以調(diào)整質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化比例,提高原生質(zhì)體和底物的使用量。)
 
2、實驗?zāi)康?/strong>:驗證預(yù)測的3個擬轉(zhuǎn)錄因子對目標(biāo)基因的調(diào)控作用。
實驗方案:構(gòu)建Luc-目的基因啟動子載體和TF表達載體,將它們與Ren載體轉(zhuǎn)化至擬南芥的原生質(zhì)體中。通過MiKro Win2000酶標(biāo)儀進行檢測。
實驗結(jié)果
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實驗結(jié)論:GA16對目的基因起正向調(diào)控作用;DE4和TX2起負(fù)向調(diào)控作用。(Luc數(shù)值偏低,建議見上述案例。
 
3、實驗?zāi)康?/strong>:采用煙草葉片瞬時表達的方法檢測TF在體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄活性。
實驗方案:報告載體含有5× GAL4激活域,其下游連接 Luc 基因;效應(yīng)載體含有TF基因,其上游連接GAL4 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,形成融合轉(zhuǎn)錄因子。將兩種載體轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌,侵染煙草葉片。侵染24-36h后,將葉片打孔成1.5cm左右的葉盤。在2mL的EP管中放入3片左右的葉盤,加入液氮,放入預(yù)冷的小鋼珠進行研磨。加入裂解液,使用SoftMax Pro Software   (Mole cular  devices)酶標(biāo)儀進行檢測。

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實驗結(jié)果

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 實驗結(jié)論煙草雙熒光素酶檢測結(jié)果顯示,含有pBD-TF效應(yīng)載體的熒光值顯著高于陰性對照pBD和陽性對照(pBD-VP16)熒光值。結(jié)果表明TF是活性很高的轉(zhuǎn)錄激活因子。
 

4、實驗?zāi)康?/strong>驗證轉(zhuǎn)錄因子X能否結(jié)合到基因A和B的啟動子區(qū)域從而激活其表達。
實驗方案:構(gòu)建Luc-A/B和TFX表達載體。將它們共轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌中,侵染煙草葉片。2天后,將葉片打孔成1cm左右的葉盤。取3片放入2mL EP管中,加入液氮進行研磨。之后加入裂解液進行處理。用Mithras(LB940)酶標(biāo)儀進行測定。
實驗結(jié)果

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實驗結(jié)論轉(zhuǎn)錄因子X能結(jié)合到基因B的啟動子區(qū)域并激活其表達(p<0.005),但是無法結(jié)合到基因A的啟動子區(qū)域。(Luc數(shù)值偏低,要確保研磨徹底,并加大裂解液的使用量。)

 
以上就是小翌收集到的雙熒光素酶相關(guān)數(shù)據(jù)了,希望對你有所幫助。
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