- 不同類型的細(xì)胞如何在其原生組織環(huán)境中相互作用？

- 細(xì)胞之間的空間關(guān)系是什么，這些關(guān)系如何影響細(xì)胞行為和功能？

- 腫瘤內(nèi)異質(zhì)性在空間上是如何組織的？

- 腫瘤內(nèi)的不同克隆如何隨著時(shí)間的推移而相互作用和演化？

- 疾病進(jìn)展在分子水平上的空間模式是什么？

- 分子標(biāo)記的空間分布如何與疾病的階段相關(guān)？

- 組織內(nèi)不同空間環(huán)境中的細(xì)胞如何對治療方案作出反應(yīng)？

- 哪些基因表達(dá)或蛋白水平的空間模式與耐藥性有關(guān)？

- 特定基因表達(dá)和蛋白功能與組織的解剖學(xué)特征的關(guān)系是什么？

- 組織內(nèi)分子活動(dòng)的空間梯度是什么？它們?nèi)绾斡绊懻w組織功能？

- 基因表達(dá)的空間模式如何指導(dǎo)不同組織類型和結(jié)構(gòu)的發(fā)育？

- 發(fā)育組織內(nèi)細(xì)胞分化和譜系追蹤的空間軌跡是什么？

- 免疫細(xì)胞在組織內(nèi)的空間分布，尤其是在感染或癌癥中？

- 免疫細(xì)胞的空間排列如何影響其功能和與其他細(xì)胞的相互作用？

- 不同神經(jīng)元群體在大腦中的空間組織方式？

- 與各種腦功能和病理狀態(tài)相關(guān)的基因表達(dá)的空間模式是什么？

- 原位雜交 (ISH) ：RNA ISH（例如 viewRNA）和熒光原位雜交 (FISH) 等技術(shù)可檢測組織切片內(nèi)的特定 RNA 分子。

-  空間分辨轉(zhuǎn)錄組學(xué) ：可檢測組織切片中的基因表達(dá)空間信息。

-  免疫組織化學(xué) (IHC) ：使用抗體檢測組織切片內(nèi)的特定蛋白，通常使用比色或熒光標(biāo)記。

-  免疫熒光 (IF) ：與 IHC 類似，但使用熒光標(biāo)記抗體以提高檢測參數(shù)數(shù)量。

-  質(zhì)譜成像 (MSI) ：提供空間分辨的蛋白和代謝物數(shù)據(jù)。

-  DNA FISH ：在組織或細(xì)胞的空間環(huán)境中檢測特定 DNA 序列。

-  帶空間條形碼的單細(xì)胞測序 ：將單細(xì)胞DNA測序與空間條形碼相結(jié)合，可得到細(xì)胞在組織中的位置信息。

-  質(zhì)譜成像 : 與空間蛋白組學(xué)類似，MSI 技術(shù)可用于繪制組織切片內(nèi)代謝物的分布圖。

-  同時(shí)檢測蛋白和核酸：比如結(jié)合viewRNA和免疫熒光方法，可在組織切片內(nèi)同時(shí)檢測蛋白和核酸。

-  光片顯微鏡 : 可進(jìn)行大體積組織的高分辨率 3D 成像，用于空間分辨的組學(xué)研究。

-  共聚焦和超高分辨率顯微鏡 ：STORM（隨機(jī)光學(xué)重建顯微術(shù)）和 PALM（光激活定位顯微術(shù)）等技術(shù)可提高空間組學(xué)成像的分辨率。

表1. 基于抗體的空間組學(xué)成像分析方法對比

空間組學(xué)利器推薦

表2. Invitrogen? 空間蛋白組學(xué)利器一覽

【組織低豐度蛋白檢測】Aluora? 空間組學(xué)信號擴(kuò)增試劑盒

表3. Aluora? 空間組學(xué)信號擴(kuò)增試劑選擇指南

【中高豐度靶點(diǎn)檢測】經(jīng)過組織染色驗(yàn)證的直標(biāo)一抗

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