近日,英國(guó)愛丁堡大學(xué)Dónal O’Carroll研究組利用Bigfoot全光譜超高速流式細(xì)胞分選儀,在《Nature》上發(fā)表了題為“Two-factor authentication underpins the precision of the piRNA pathway”的重磅文章,揭示了SPOCD1 精確控制 DNA 甲基化的潛在機(jī)制。
在雄性小鼠種系發(fā)育過(guò)程中,PIWI-interacting RNA(piRNA)通路引導(dǎo)著年輕、活躍的轉(zhuǎn)座子的 DNA 甲基化【1】。piRNA 將 PIWI 蛋白 MIWI2(PIWIL4)系在新生轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄本上,通過(guò) SPOCD1 精確地控制 DNA 甲基化【2-5】。然而,確保這種精確性的潛在機(jī)制仍然未知。
2024年9月18日,英國(guó)愛丁堡大學(xué)Dónal O’Carroll團(tuán)隊(duì)在《Nature》上發(fā)表題為“Two-factor authentication underpins the precision of the piRNA pathway”的研究論文。作者發(fā)現(xiàn) SPOCD1 直接與 SPIN1(SPINDLIN1)相互作用,SPIN1 是一種染色質(zhì)閱讀器,主要與 H3K4me3-K9me3 結(jié)合【6 】,且SPIN1 的表達(dá)早于 SPOCD1 和 MIWI2 的表達(dá),而之前普遍認(rèn)為piRNA 引導(dǎo)的 DNA 甲基化所需的所有分子事件都發(fā)生在 MIWI2 參與之后。
此外,在piRNA引導(dǎo)的DNA甲基化開始之前,年輕的LINE1拷貝(而不是老的LINE1拷貝)會(huì)被H3K4me3、H3K9me3和SPIN1標(biāo)記。作者通過(guò)突變基因小鼠,利用不與SPIN1相互作用SPOCD1變體,發(fā)現(xiàn)SPOCD1和SPIN1之間的相互作用對(duì)于精子發(fā)生和piRNA引導(dǎo)的年輕LINE1元件的DNA甲基化至關(guān)重要。這證明了piRNA引導(dǎo)的LINE1 DNA甲基化需要一個(gè)發(fā)育定時(shí)的雙因素認(rèn)證過(guò)程。第一個(gè)認(rèn)證過(guò)程是將 SPIN1-SPOCD1 招募到年輕的 LINE1 啟動(dòng)子,第二個(gè)認(rèn)證過(guò)程是 MIWI2 與新生轉(zhuǎn)錄本的接觸。獨(dú)立的認(rèn)證事件是 piRNA 引導(dǎo)的 LINE1 DNA 甲基化精確性的基礎(chǔ)。
本實(shí)驗(yàn)中,為了純化胎兒生殖細(xì)胞,研究者從攜帶 Oct4-eGFP 等位基因的胚胎中分離出 E14.5 睪丸,解離得到單細(xì)胞懸浮液。之后在Bigfoot 全光譜超高速流式細(xì)胞分選儀上使用 100 μm 噴嘴進(jìn)行分選,將 DAPI 陰性(活細(xì)胞)、OCT4-eGFP 陽(yáng)性(生殖細(xì)胞)的細(xì)胞群分選出來(lái)用于后續(xù)CUT&Tag 測(cè)序分析。
圖-H3K4me3、H3K9me3和SPIN1在新基因組甲基化之前標(biāo)記年輕的LINE1。其中e-i,來(lái)自Bigfoot全光譜流式細(xì)胞分選儀分選得到的 E14.5 胎兒生殖細(xì)胞的 H3K4me3、H3K9me3 和 SPIN1 的 CUT&Tag 數(shù)據(jù)。
下面是此文中用到的Bigfoot全光譜超高速流式細(xì)胞分選儀的簡(jiǎn)介
Bigfoot是全球第一臺(tái)全光譜、超高速、高性能的流式細(xì)胞分選儀,具有強(qiáng)大的光譜解析和分選能力,是免疫學(xué)研究和生物醫(yī)藥開發(fā)領(lǐng)域的強(qiáng)有力工具。其主要技術(shù)優(yōu)勢(shì)如下:
高配置:高達(dá)9激光60參數(shù)
高性能:實(shí)時(shí)全光譜拆分及傳統(tǒng)補(bǔ)償模式可選
高速度:分選速度高達(dá)7萬(wàn)個(gè)事件/秒
高通量:六路分選;96孔-1536孔板適用;單細(xì)胞分選
自動(dòng)化:智能型全自動(dòng)儀器校準(zhǔn)及質(zhì)控
安全性:整合式生物安全柜設(shè)計(jì)及氣溶膠管理系統(tǒng)
掃描下面二維碼,了解更多儀器信息
1. 祝賀:國(guó)內(nèi)第一篇Bigfoot文獻(xiàn)發(fā)表啦!
2. 產(chǎn)品應(yīng)用 | Bigfoot分選流式用于iPSC單克隆分選,助力高質(zhì)量細(xì)胞突變模型方法建立
3. Bigfoot高光系列之——高通量孔板分選功能
全部評(píng)論(0條)
登錄或新用戶注冊(cè)
請(qǐng)用手機(jī)微信掃描下方二維碼
快速登錄或注冊(cè)新賬號(hào)
微信掃碼,手機(jī)電腦聯(lián)動(dòng)
TRIzol? Plus RNA 純化系統(tǒng)
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 478次
美國(guó)賽默飛 基因測(cè)序儀3730系列
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 974次
Applied Biosystems ProFlex? PCR儀
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 449次
Applied Biosystems 自動(dòng)化PCR儀(ATC)
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 644次
美國(guó)賽默飛 Applied Biosystems ProFlex? PCR儀
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 677次
美國(guó)賽默飛 COUNTESS? II FL自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 680次
SuperScript? III 逆轉(zhuǎn)錄酶
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 407次
美國(guó)賽默飛 iBlot? 2 干式轉(zhuǎn)印系統(tǒng)
報(bào)價(jià):面議 已咨詢 576次
①本文由儀器網(wǎng)入駐的作者或注冊(cè)的會(huì)員撰寫并發(fā)布,觀點(diǎn)僅代表作者本人,不代表儀器網(wǎng)立場(chǎng)。若內(nèi)容侵犯到您的合法權(quán)益,請(qǐng)及時(shí)告訴,我們立即通知作者,并馬上刪除。
②凡本網(wǎng)注明"來(lái)源:儀器網(wǎng)"的所有作品,版權(quán)均屬于儀器網(wǎng),轉(zhuǎn)載時(shí)須經(jīng)本網(wǎng)同意,并請(qǐng)注明儀器網(wǎng)(m.sdczts.cn)。
③本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明來(lái)源的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)或證實(shí)其內(nèi)容的真實(shí)性,不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),必須保留本網(wǎng)注明的作品來(lái)源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
④若本站內(nèi)容侵犯到您的合法權(quán)益,請(qǐng)及時(shí)告訴,我們馬上修改或刪除。郵箱:hezou_yiqi
參與評(píng)論
登錄后參與評(píng)論