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生物拉曼光譜檢測技術(shù)方案(三)丨拉曼光譜在微生物代謝研究中應(yīng)用

來源：長春長光辰英生物科學(xué)儀器有限公司 更新時(shí)間：2024-03-21 16:15:11 閱讀量：162
導(dǎo)讀：辰英的微生物代謝檢測平臺將熒光原位雜交（FISH）技術(shù)與單細(xì)胞拉曼光譜技術(shù)相結(jié)合，可以實(shí)現(xiàn)對已知基因信息的目標(biāo)微生物的代謝表型及功能分析，為深入理解功能菌的作用機(jī)制提供一種有力的新工具。

環(huán)境中存在大量尚無法培養(yǎng)獲得的功能微生物，通過宏基因測序我們可知這些有目標(biāo)菌的基因序列，但難以對其功能進(jìn)行驗(yàn)證。

辰英的微生物代謝檢測平臺將熒光原位雜交（FISH）技術(shù)與單細(xì)胞拉曼光譜技術(shù)相結(jié)合，可以實(shí)現(xiàn)對已知基因信息的目標(biāo)微生物的代謝表型及功能分析，為深入理解功能菌的作用機(jī)制提供一種有力的新工具。


應(yīng)用案例


· 基于FISH-Raman的聚磷菌代謝分析

本研究利用熒光原位雜交技術(shù)（FISH）在污泥樣品中，通過不同熒光探針指示各種屬的菌；同時(shí)結(jié)合單細(xì)胞拉曼光譜技術(shù)（Raman），對聚磷菌Tetrasphaera中多聚磷、糖原和PHA等胞內(nèi)代謝物進(jìn)行原位分析，為深入了解的碳來源依賴的代謝及其對全球廢水除磷的貢獻(xiàn)提供洞察。

【文章鏈接：《ACS ES&T Water》丨聚磷菌Tetrasphaera在不同碳源下的除磷和聚合物的合成 (qq.com)】


· 基于FISH-Raman的未培養(yǎng)古菌研究

本研究應(yīng)用基于線性支持向量機(jī)的機(jī)器學(xué)習(xí)分類模型對9種古菌進(jìn)行分類，準(zhǔn)確率為88-100%，并通過單細(xì)胞分選及DNA測序分析驗(yàn)證了分類結(jié)果。此外，采用熒光原位雜交結(jié)合拉曼光譜技術(shù)(Fish-Raman)，直接從海水中獲取未培養(yǎng)古菌(MGⅡ)和細(xì)菌的拉曼光譜，表明MGⅡ可能具有不同于其他古菌的產(chǎn)生脂肪酸的能力。本研究為未培養(yǎng)微生物研究提供了一個(gè)新方法。

【文章鏈接：客戶文章  | 《Analytical Chemistry》：基于單細(xì)胞拉曼分選的古菌研究新策略 (qq.com)】


核心設(shè)備


· 激光共聚焦拉曼光譜儀P300

【產(chǎn)品介紹：P300 共聚焦拉曼光譜儀 (qq.com)】

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