高覆蓋靶向脂質(zhì)組學(xué)助力科學(xué)家繪制胚胎脂代謝重塑全景圖
近期,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院、中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所、中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院、中科脂典等單位的相關(guān)研究人員在《Nature Cell Biology》(IF: 21.3)上發(fā)表了題為“Low input lipidomics reveals lipid metabolism remodeling during early mammalian embryo development”的研究論文,系統(tǒng)描繪了小鼠和人早期胚胎發(fā)育過程中動(dòng)態(tài)變化的脂質(zhì)圖譜,并闡明了脂質(zhì)不飽和度調(diào)控胚胎發(fā)育的功能與機(jī)制。
亮點(diǎn)概述:
基于超高靈敏度三重四極桿質(zhì)譜QTRAP 7500的靶向脂質(zhì)組學(xué)實(shí)現(xiàn)少量樣本(120個(gè)不同發(fā)育階段胚胎)的脂質(zhì)組分析。
描繪了小鼠早期胚胎發(fā)育過程不同階段的脂質(zhì)組特征。
隨著胚胎發(fā)育進(jìn)程,脂質(zhì)的不飽和度增加,且在人類胚胎中有類似的發(fā)現(xiàn)。
硬脂酰輔酶A去飽和酶1(SCD1) 有助于建立早期胚胎的頂端-基底極性,是體外囊胚發(fā)育和子宮內(nèi)囊胚植入所必需的。
研究背景:
哺乳動(dòng)物的生命起始于卵子和精子通過受精作用形成全能性的受精卵,經(jīng)過一系列的細(xì)胞分裂、八細(xì)胞期的極化、以及隨后的桑葚胚開始的譜系分化,形成包含有內(nèi)細(xì)胞團(tuán)(ICM)、原始內(nèi)胚層(PE)和滋養(yǎng)外胚層(TE)的囊胚。細(xì)胞中存在種類繁多的脂質(zhì)分子,然而,這一過程脂質(zhì)代謝對(duì)哺乳動(dòng)物早期胚胎發(fā)育的調(diào)控作用還不清楚。
為了研究小鼠早期胚胎發(fā)育中的脂質(zhì)重塑過程,研究人員開發(fā)了一種可同時(shí)滿足低樣本量和高覆蓋率的靶向脂質(zhì)組學(xué)方法,采用 QTRAP 7500高靈敏度質(zhì)譜儀實(shí)現(xiàn)了在少量胚胎(120個(gè)植入前胚胎)水平上進(jìn)行代謝物的檢測(cè),可以鑒定到23大類脂質(zhì)共300余種脂質(zhì)分子,包括甘油磷脂、鞘脂和中性脂。
小鼠植入前胚胎發(fā)育的階段特異性脂質(zhì)組學(xué)特征
為了解植入前發(fā)育過程中每個(gè)脂質(zhì)類別的動(dòng)態(tài)變化和功能,研究人員將檢測(cè)到的脂類分為三大類。第一類是鞘氨醇脂質(zhì),主要由神經(jīng)酰胺、鞘磷脂(SMs)和鞘糖脂(GSLs)組成;第二類是磷脂,磷脂是細(xì)胞膜的主要成分,以磷脂酰膽堿(PCs)的含量在每一個(gè)時(shí)期中Z為豐富;第三類是中性脂,甘油三酯(TAG)的含量在四細(xì)胞開始至囊胚期有明顯的增加,TAG是脂滴的主要成分,主要功能之一是提供能量,提示TAG可以為后期氧化活動(dòng)的增強(qiáng)提供原材料。
而在人類早期胚胎發(fā)育過程中,由于實(shí)驗(yàn)材料的稀缺,內(nèi)源的代謝物和脂質(zhì)分子的動(dòng)態(tài)變化及其對(duì)胚胎發(fā)育的影響還鮮有研究。在上述以小鼠為模式生物研究的基礎(chǔ)上,借助高靈敏度質(zhì)譜儀,研究人員對(duì)人的八細(xì)胞胚胎和囊胚期胚胎進(jìn)行了高覆蓋的靶向脂質(zhì)組學(xué)檢測(cè),發(fā)現(xiàn)從脂質(zhì)種類到發(fā)育過程中脂質(zhì)變化趨勢(shì)(如TAGs,CLs增高,PEs,PIs下降)以及不飽和度增高方面均存在物種之間的保守性。研究人員進(jìn)一步在轉(zhuǎn)錄組層面上探索了通過脂質(zhì)不飽和度如何調(diào)控囊胚形成的分子機(jī)制,進(jìn)一步驗(yàn)證了脂質(zhì)不飽和度上調(diào)對(duì)囊胚形成的必要性。
該研究系統(tǒng)地描繪了小鼠和人早期胚胎脂質(zhì)全景圖,為研究哺乳動(dòng)物植入前胚胎發(fā)育中內(nèi)源性脂質(zhì)的重塑提供了寶貴的資源,并為脂質(zhì)不飽和度調(diào)節(jié)胚胎發(fā)育和植入提供了機(jī)制上的開創(chuàng)性的新見解。
浙江大學(xué)張進(jìn)教授、中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所稅光厚研究員、中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心李達(dá)教授為本文的通訊作者。浙江大學(xué)良渚實(shí)驗(yàn)室特聘副研究員張玲、浙江大學(xué)良渚實(shí)驗(yàn)室特聘副研究員趙靜、中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所Sin Man Lam博士、浙江大學(xué)博士生陳浪、中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心助理研究員高應(yīng)卓、浙江大學(xué)博士生王文杰為本文的共同第一作者。浙江大學(xué)葉存奇研究員、李炫臻研究員、周全研究員、沈?qū)幯芯繂T為本研究提供了重要幫助。該研究受到了國(guó)家自然科學(xué)基金委、浙江省自然科學(xué)基金委的支持。
QTRAP 7500
重新定義定量質(zhì)譜新高度:
QTRAP 7500
質(zhì)譜技術(shù)特點(diǎn)
采用創(chuàng)新OptiFlow Pro離子源,延續(xù)經(jīng)典Turbo V離子源穩(wěn)定性和耐用性好優(yōu)點(diǎn)。
新增E Lens技術(shù),進(jìn)一步提高化合物離子化和離子導(dǎo)入的效率,顯著提升靈敏度。
離子源兼容流速1 μL/min到3000 μL/min范圍,兼容不同液相前端,滿足不同應(yīng)用要求。
離子源采用通用幾何學(xué)設(shè)計(jì),噴針即插即用,無需調(diào)整優(yōu)化位置。
離子透鏡和檢測(cè)器延續(xù)高端定量質(zhì)譜的經(jīng)典設(shè)計(jì),保證高靈敏度的同時(shí),兼顧寬線性動(dòng)態(tài)范圍、高離子對(duì)通量等優(yōu)點(diǎn)。
可升級(jí)到經(jīng)典的QTRAP功能,在定量的基礎(chǔ)上實(shí)現(xiàn)定性的功能。
開發(fā)高覆蓋靶向代謝組學(xué)和脂質(zhì)組學(xué)方法,提供完整的靶向組學(xué)解決方案。
延伸閱讀
Large scale targeted metabolomics assay for quantitative plasma profiling, TN, RUO-MKT-02-13259-A
高通量靶向脂質(zhì)組學(xué)方法實(shí)現(xiàn)廣泛的脂質(zhì)定量, TN, RUO-MKT-02-8482-ZH-B.
基于激光顯微切割-液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)的微量細(xì)胞廣靶脂質(zhì)組學(xué)分析, TN, RUO-MKT-02-14573-ZH-A .
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