在我們探索EV功能的時候,最基礎的3個參數(shù)就是EV樣品的濃度,粒徑和分型。
濃度:EV的濃度信息對于發(fā)現(xiàn)新的生物標志物(即疾病相關的分子標志)以及診斷疾病都非常關鍵。同時,通過精準地測量EV的濃度,研究人員能夠更好地追蹤病人的疾病進展,并評估治療是否有效。
粒徑:通過EV粒徑檢測,可有效區(qū)分不同EV亞型,更深入地了解其起源或功能。EV粒徑檢測對于EV樣品制備的標準化和質(zhì)量控制同樣至關重要。
分型:研究人員還需對EV進行表征并識別其蛋白表達。對EV進行表征分析,有助于研究人員了解EV的生物學功能,破譯EV在細胞間攜帶的特定信息/信號,發(fā)現(xiàn)內(nèi)含物中的疾病特異性分子(DNA、RNA、microRNA等)。
采用流式細胞術可以同步獲取這些重要參數(shù),特別是可以通過測定EV中或膜表面的蛋白表達,檢測顆粒的物理和化學特性。隨著對EV研究的不斷深入,研究者們的關注點已經(jīng)從整體EV群體逐步轉(zhuǎn)向更為細致的EV亞群分析,這種轉(zhuǎn)變有助于更精確地揭示EV在生理和病理過程中的具體功能。
我們以從健康供體中分離的PPP(去血小板血漿)EV分群為例。3mL全血在200xg下離心5分鐘。從頂部取出1mL血漿,并通過200nm注射器過濾。使用70nm尺寸排阻柱(SEC)純化PPP。篩選出的組分用于單色染色和多色染色進行免疫分型。然后用以下抗體對選定的PPP組分進行染色:CD81 PB、CD9 FITC、CD63 APC、CD61 PC7和CD235a PE。在CytoFLEX納米流式細胞儀上采集樣本,并在CytExpert nano中進行分析。
檢測EV樣本時,樣品清潔度至關重要,因此在檢測前需要確保儀器的背景噪聲足夠低。CytoFLEX nano自帶Baseline檢測功能,可以自動檢查鞘液并基于滿足QC要求的預設閾值,自動監(jiān)測并分析背景信號,快速評估儀器清潔度。在運行實驗的同時,Baseline檢測功能也可以即時檢查儀器和緩沖液清潔度,保證樣品間攜帶污染率小于1%。
在上樣前,選擇合適的樣品濃度至關重要,以避免出現(xiàn)swarm現(xiàn)象。我們通過EPS(<6000 eps)、100%事件處理和避免粘連體,MdFI等維度,選擇適合的樣品稀釋比例。
在獲取檢測數(shù)據(jù)后,我們按照以下設門策略進行數(shù)據(jù)分析:
1. Gate on Singlets
2. Gate out CD235+ (possible aggregates)
3. From CD235-, identify CD61+ (Platelet-originated EVs) and CD61-
4. Further identify CD9+ and CD9- The last plots help to identify CD81+ and CD63+ from these subpopulation
CytoFLEX nano 納米流式分析儀使研究人員能夠清晰檢測血漿來源的EV。該分析儀可準確檢測和區(qū)分單個PPP EV顆粒(包括PB、FITC、PE、APC和PC7) 上的多個熒光通道中的信號,便于用戶監(jiān)測低表達的稀有陽性亞群(如CD63和標記紅細胞污染的CD235a)。
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