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Nb!怎么純化納米抗體?

來源:Cytiva(思拓凡) 更新時間:2024-11-21 09:27:54 閱讀量:299
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重鏈抗體的可變結(jié)構(gòu)域 (VHH) 也被稱為納米抗體 (Nanobodies/Nbs) ,是來源于駱駝科動物重鏈抗體的單體抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域。


Nbs具有分子尺寸小、靶向選擇性高、高溶解性和高穩(wěn)定性等顯著特點(diǎn),這些特點(diǎn)都極大促進(jìn)了高質(zhì)量的藥物開發(fā)。同時Nbs很容易在各種表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá),例如大腸桿菌和酵母等。由于以上這些原因,Nbs成為了蛋白質(zhì)工程、診斷和疾病治療的首選抗體片段之一,截止到2023年FDA已經(jīng)批準(zhǔn)了兩款基于Nbs的治療方法。目前有許多正處于臨床前和臨床研究中的Nbs候選藥物,涵蓋了廣泛的疾病類型,包括癌癥、免疫系統(tǒng)疾病、傳染病和神經(jīng)退行性疾病。[1]


01

VHH特點(diǎn):


分子尺寸小,分子量約15 kDa;

組織穿透力強(qiáng),可以有效穿透血腦屏障 (blood-brain barrier) ;[2]

較高的穩(wěn)定性和溶解度,熱穩(wěn)定性強(qiáng);[3]

免疫原性較低;

半衰期短,易于代謝。[4]


01

MabSelect PrismA


Protein A親和層析填料長期以來一直被用于純化單克隆抗體 (mAbs) ,被各種規(guī)模的生物制藥企業(yè)廣泛應(yīng)用。Protein A和抗體的結(jié)合主要發(fā)生在單抗的Fc區(qū),位于CH2和CH3之間。與此同時,Protein A也可以結(jié)合抗體Fab區(qū)可變重鏈上的VH3序列

所開發(fā)的多款現(xiàn)代Protein A填料,例如MabSelect SuRe、MabSelect SuRe LX、MabSelect PrismA等,具有高結(jié)合載量以及高耐堿性等特點(diǎn)。


圖1:單克隆抗體上不同的結(jié)合位點(diǎn)以及現(xiàn)代Protein A填料選擇


MabSelect PrismA純化VHH



在Tricorn 5/50柱子中填充1 mL MabSelect PrismA填料,將150 mL含有0.2 g/L VHH的大腸桿菌粗提物(Load=30 g VHH/L填料)上樣到1 mL MabSelect PrismA柱子,保留時間為6分鐘。VHH樣品在50 mM pH 3.5的醋酸鈉溶液中洗脫獲得,純化結(jié)果如圖2所示。[6]


圖2:使用MabSelect PrismA捕獲大腸桿菌表達(dá)的VHH


對本次純化中Load和Eluate分別取樣進(jìn)行檢測,經(jīng)過MabSelect PrismA純化所得的VHH樣品和上柱前相比,宿主蛋白的去除率達(dá)到4.3 log,而配基脫落僅10 ppm(表1)。


表1:MabSelect PrismA純化VHH的檢測數(shù)據(jù)對比[6]

將純化過的VHH樣品分別上樣到裝有不同Protein A填料的1 mL HiTrap預(yù)裝柱中,分別是HiTrap MabSelect(rprotein A配基)、HiTrap MabSelect SuRe、HiTrap MabSelect PrismA這三種,然后進(jìn)行酸性pH值洗脫。能夠從圖3中看到,MabSelect和MabSelect PrismA表現(xiàn)出類似的層析行為,而MabSelect SuRe顯示出和VHH僅有較弱的相互作用。


圖3:VHH和 (A) MabSelect、(B) MabSelect SuRe、(C) MabSelect PrismA三種不同填料的層析結(jié)果[6]


進(jìn)一步地對VH3序列的關(guān)鍵氨基酸進(jìn)行點(diǎn)突變,并測試氨基酸點(diǎn)突變后的VHH與上述3種現(xiàn)代Protein A填料的相互作用強(qiáng)弱,表2中的數(shù)據(jù)表明:在少數(shù)特定情況下,MabSelect SuRe填料也可以與VH3區(qū)域發(fā)生相互作用,而MabSelect和MabSelect PrismA填料對VHH序列變化的敏感性較低,在多數(shù)情況下都能和VHH樣品結(jié)合。


表2:MabSelect、MabSelect SuRe和MabSelect PrismA填料與點(diǎn)突變VHH的相互作用[6]


01

MabSelect VH3


2023年11月上市了MabSelect VH3親和填料,MabSelect VH3采用經(jīng)過重組改造的protein A配基,該配基只與包含VH3序列家族的重鏈可變區(qū)的人源抗體發(fā)生相互作用,VH3配基與傳統(tǒng)的protein A配基相比,F(xiàn)c區(qū)相互作用已被敲除,而VH3區(qū)相互作用得到增強(qiáng)。VH3序列家族是商業(yè)化生物制品中抗體最常見的VH類型。利用這一特性可有效分離雙特異性抗體 (bsAb) 和抗體片段,例如抗原結(jié)合區(qū)片段 (Fab) 、單鏈可變片段 (scFv) 和重鏈可變區(qū) (VHH) 。

對包含VH3序列家族的雙特異性抗體以及抗體片段具有高結(jié)合載量;

在捕獲雙特異性抗體時,對于產(chǎn)品相關(guān)雜質(zhì)具有良好的分辨率;

耐堿穩(wěn)定性:使用0.5 M NaOH清洗時保持穩(wěn)定,可大大降低生物負(fù)荷的風(fēng)險并具有較長的填料使用壽命;

與Fab VH3區(qū)域的單一相互作用,比具有雙重相互作用(Fab及Fc區(qū))的親和配基更為有利,因?yàn)檫@種單一作用可更高效地將不需要的錯配抗體和片段從目標(biāo)bsAb中分離;

使用專為MabSelect VH3填料設(shè)計的VH3 Ligand ELISA試劑盒(貨號29737000)可輕松測量配基脫落。

經(jīng)過測試,針對VHH樣品MabSelect VH3填料的動態(tài)結(jié)合載量略高于MabSelect PrismA填料大約11%–14%。如圖4所示,MabSelect VH3填料與VHH的動態(tài)結(jié)合載量為36-39 g/L,同時MabSelect VH3填料和VHH的動態(tài)結(jié)合載量不太受保留時間長短的影響。[7]尤其是在較短的保留時間下,填料和VHH的高結(jié)合載量為生物制藥提供了強(qiáng)勁的生產(chǎn)優(yōu)勢。


圖4:不同保留時間下MabSelect VH3和MabSelect PrismA填料和VHH的動態(tài)結(jié)合載量對比[7]


高動態(tài)結(jié)合載量不僅在填料壽命的開始階段非常重要,同時填料也需要能夠承受嚴(yán)苛的清潔再生條件以降低生物污染事件發(fā)生的風(fēng)險,為了實(shí)現(xiàn)填料的高利用率,動態(tài)結(jié)合載量必須在填料整個壽命周期內(nèi)保持穩(wěn)定。

將MabSelect VH3填料的初始動態(tài)結(jié)合載量設(shè)定為100%(即第0個周期,填料未使用NaOH處理時),之后每16個CIP循環(huán)后用經(jīng)過純化的曲妥珠單抗以及VHH樣品分別測量填料的動態(tài)結(jié)合載量。測試結(jié)果表明:經(jīng)過96次循環(huán)的0.5M NaOH清潔再生后,MabSelect VH3填料對曲妥珠單抗和VHH的相對剩余結(jié)合載量均高達(dá)93%(圖5)。值得一提的是,在經(jīng)過多達(dá)200次CIP循環(huán)后,MabSelect VH3填料對于曲妥珠單抗的相對剩余結(jié)合載量仍然有84%。[7]


圖5:CIP條件為0.5 M NaOH接觸時間15分鐘,經(jīng)過96次CIP循環(huán)后MabSelect VH3填料對mAb和VHH的相對剩余結(jié)合載量高達(dá)93%[7]


小編小結(jié)


VHH即納米抗體由于其分子量小、組織穿透力強(qiáng)、穩(wěn)定性強(qiáng)、免疫原性低等諸多特點(diǎn),作為抗體藥物的潛力賽道吸引了廣泛的關(guān)注,在疾病診斷及治療方面具有廣闊的應(yīng)用前景。所開發(fā)的現(xiàn)代Protein A填料MabSelect PrismA以及MabSelect VH3在VHH純化上均有不俗表現(xiàn),同時具備了高結(jié)合載量以及耐堿穩(wěn)定性。



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相關(guān)閱讀:

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參考文獻(xiàn)

[1]. Nanobodies: Robust miniprotein binders in biomedicine, J. Yong Joon Kim, Z. Sang, Y. Xiang et al. Advanced Drug Delivery Reviews 195 (2023) 114726

[2]. Transportation of single-domain antibodies through the blood–brain barrier, Ruiz-López E, Schuhmacher AJ. Biomolecules. 2021;11(8):1131.

[3]. A structure-based engineering approach to abrogate pre-existing antibody binding to biotherapeutics. Lin J, et al. Lin J, et al. PLoS ONE. 2021;16(7):e0254944.

[4]. Nanobody conjugates for targeted cancer therapy and imaging. Kang W, et al. Technol Cancer Res Treat. 2021;20:15330338211010116.

[5]. Discovery of nanobodies: a comprehensive review of their applications and potential over the past five years, Alexander and Leong, Journal of Nanobiotechnology (2024) 22:661

[6]. Platform for purification of VHH-type antibody fragments, CY11918-10Sep20-PT

[7]. MabSelect VH3 resin Data File, CY36703-31Jul24-DF


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