PCR技術(shù)因其快速、靈敏、特異等特性廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)的研究與檢測中,但卻對實驗環(huán)境及操作有著嚴(yán)格的要求,稍有不當(dāng)則會導(dǎo)致假陽性產(chǎn)生。污染嚴(yán)重時甚至可以持續(xù)數(shù)月,很難在短時間內(nèi)控制。換引物、換試劑、換耗材、換實驗樓,甚至有人跑到兩公里外的實驗室加樣也無濟于事,如何避免及處理假陽性問題已經(jīng)成為每一位PCR實驗人員的必修課。
01 什么是PCR假陽性

假陽性結(jié)果示例1(Q1600熒光檢測)
PCR假陽性包括兩種,即檢測陰性材料得到陽性結(jié)果,檢測空白對照(加入去離子水)出現(xiàn)陽性結(jié)果,實驗中設(shè)立的陰性對照可以提示有無假陽性結(jié)果出現(xiàn)。

假陽性結(jié)果示例2(Repure-A電泳檢測)
02 PCR假陽性的原因有哪些
PCR擴增產(chǎn)物污染是導(dǎo)致假陽性的重要因素,因其拷貝量大,微量的污染源即可導(dǎo)致陽性結(jié)果,其中以氣溶膠污染Z為常見。其次,PCR試劑及樣本的交叉污染也會導(dǎo)致假陽性。PCR試劑的污染包括加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液的核酸污染,樣本污染主要是取樣工具之間的交叉污染或加樣污染。
此外,在實驗室操作中經(jīng)常會用到陽性參考品,參考品大多數(shù)由某些克隆質(zhì)粒制作而成,克隆質(zhì)粒使用不當(dāng)也會造成污染。
03 假陽性的預(yù)防及解決措施
①規(guī)范實驗室設(shè)計:實驗室包括配液區(qū)、DNA提取區(qū)、擴增區(qū)、電泳區(qū),在連續(xù)獨立的空間完成不同實驗操作。若沒有專業(yè)的實驗室,至少需要保證配液、加樣與檢測在不同的區(qū)域;
②規(guī)范實驗室操作:實驗室定期通風(fēng)與消毒,儀器定期清潔,并使用氣溶膠清除劑。使用一次性用具,小心操作,避免交叉污染;
③規(guī)范試劑耗材管理:新買試劑需進(jìn)行實驗前驗證并進(jìn)行分裝,所用耗材需高壓消毒;
④實驗前預(yù)防:首先需保證所設(shè)計引物的特異性,防止引物自擴增,其次還可使用UNG酶及dUTP防污染體系;
⑤污染后處理:如遇污染應(yīng)立即停止實驗,采取開窗通風(fēng),紫外燈照射,噴霧裝置噴灑等操作,此后若連續(xù)三天陰性對照正常即可恢復(fù)正常實驗。
04 二維梯度PCR可有效避免多次PCR帶來的假陽性風(fēng)險
DY輪PCR的污染基本可以避免,PCR實驗越頻繁,則越容易污染,能一次做50個,不要分開5次每次做10個。而對于科研實驗而言,使用二維梯度PCR可以一次得到96個溫度組合,而不需要分開8次,每次做12個梯度,在節(jié)省人力物力的同時也大大降低了假陽性的風(fēng)險。

RePure-D 二維復(fù)合梯度基因擴增儀

RePure-C 二維梯度基因擴增儀
“上YZ未病”,對于PCR的初學(xué)者而言,做實驗之前首先需要樹立“預(yù)防”的觀念,嚴(yán)格把控樣本處理、核酸提取、擴增及檢測的每一過程。同時,在實際操作中也需要注意規(guī)范實驗步驟,避免因加樣失誤而導(dǎo)致的交叉污染,從源頭杜絕假陽性現(xiàn)象。
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