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基因擴(kuò)增儀

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PCR假陽性的原因和對策

更新時間:2025-10-19 19:49:20 類型:維修保養(yǎng) 閱讀量:7001
導(dǎo)讀:對特定的DNA片段起到放大擴(kuò)增作用的一種分子生物學(xué)技術(shù),被稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。其可以被當(dāng)作生物體外的特殊DNA復(fù)制,能夠大幅增加微量的DNA。下面就讓小編帶你了解一下PCR反應(yīng)假陽性的原因和對策。

對特定的DNA片段起到放大擴(kuò)增作用的一種分子生物學(xué)技術(shù),被稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。其可以被當(dāng)作生物體外的特殊DNA復(fù)制,能夠大幅增加微量的DNA。1971年Khorana首先提出設(shè)想,1985年Mullis發(fā)明了聚合酶鏈反應(yīng)。下面就讓小編帶你了解一下PCR反應(yīng)假陽性的原因和對策。


出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶和目的靶序列條帶相同,甚至有更高的亮點(diǎn),也更加的整齊。


引物設(shè)計不合適:

選擇的擴(kuò)增序列和非目的擴(kuò)增序列有同源性,,所以當(dāng)進(jìn)行PCR擴(kuò)增時,擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。容易出現(xiàn)假陽性很有可能是因?yàn)橐锾袒蛘甙行蛄刑?,需要對引物重新設(shè)計。


17.jpg


靶序列或擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染:

有兩種導(dǎo)致這種污染的原因

1.原因:整個基因組或大片段的交叉污染,導(dǎo)致假陽性。

解決方案:在操作的時候應(yīng)該小心輕柔,避免靶序列從離心管

濺出或者被加樣槍吸入其中。對除了不能耐高溫的物質(zhì)以及酶以外,對于任何試劑或器材都應(yīng)該高壓消毒,所用所用離心管及樣進(jìn)槍頭等都只能夠使用一次。如果有必要,在對標(biāo)本進(jìn)行添加之前,需用紫外線對反應(yīng)管和試劑進(jìn)行照射,從而對存在的核酸進(jìn)行破壞。


2.原因:空氣中的小片段核酸污染,和靶序列相比較,這些小片段更加的短,然而具有一定的同源性。,能夠互相拼接,與引物互補(bǔ)后,可擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物,從而造成產(chǎn)生假陽性。

解決方案:可用巢式PCR方法來減輕或消除。


出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶

和預(yù)計的不相同,PCR擴(kuò)增后出現(xiàn)的條帶不是更大就是更小,或者非特異性擴(kuò)增帶和特異性擴(kuò)增帶同時出現(xiàn)。

原因:

1.引物與靶序列不完全互補(bǔ)或者物聚合形成二聚體。

2.出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶因素很多,PCR循環(huán)次數(shù)過多有、Mg2+離子濃度過高以及退火溫度過低都有可能導(dǎo)致出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶不會出現(xiàn)非特異條帶,而另外一來源的酶則則很容易出現(xiàn)。當(dāng)酶量過多的時候,也有可能會有非特異性擴(kuò)增

對策:

有必要對引物進(jìn)行重新的設(shè)計。對酶的來源進(jìn)行調(diào)換或者對酶量進(jìn)行降低。對引物量進(jìn)行降低,對模板量進(jìn)行適當(dāng)增加,對循環(huán)次數(shù)進(jìn)行減少。對二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)進(jìn)行使用或者對退火溫度進(jìn)行提高。


出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶

PCR擴(kuò)增的時候,有時也會有涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶出現(xiàn)。

原因:

導(dǎo)致這種現(xiàn)象的原因有很多,比如過多的循環(huán)次數(shù),過低的退火溫度,過高的Mg2+濃度,過高的dNTP濃度,退火時酶量過多或酶的質(zhì)量差,過高的g2+或者dNTP濃度。

對策:

1.使用其他來源的酶或者對酶的量進(jìn)行減少。

2.對循環(huán)次數(shù)減少,對模板量增加,對Mg2+濃 度和dNTP的濃度適當(dāng)?shù)慕档汀?/span>


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