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[科研前線│Cell│氧電極]硅藻蛋白核被蛋白質(zhì)外殼包裹從而高效固定CO2

來源:漢莎科技集團有限公司 更新時間:2025-01-10 15:29:44 閱讀量:404
導(dǎo)讀:[科研前線│Cell│氧電極]硅藻蛋白核被蛋白質(zhì)外殼包裹從而高效固定CO2

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Pyrenoid-蛋白核(造粉核、淀粉核),某些藻類植物載色體上的一種特殊結(jié)構(gòu),在綠藻中較常見。高等植物中除了角苔綱以外其他均沒有。一個蛋白質(zhì)的核心部分,外圍以若干淀粉小塊,這是藻類植物蛋白質(zhì)與淀粉的一種貯藏形態(tài)。之前,人們一直認(rèn)為藻類蛋白核分為2種:1、具鞘蛋白核(有淀粉鞘);2、裸蛋白核。


近日,日本關(guān)西學(xué)院大學(xué)(Kwansei Gakuin University)生物與環(huán)境科學(xué)學(xué)院生物科學(xué)系Yusuke Matsuda課題組聯(lián)合瑞士巴塞爾大學(xué)生物中心(The University of Basel’s BiozentrumBenjamin D. Engel等多家研究機構(gòu),在Cell上發(fā)表了題為Diatom pyrenoids are encased in a protein shell that enables efficient CO2 fixation的研究性論文,該研究首次發(fā)現(xiàn)了第3種藻類蛋白核類型——具鞘蛋白核PyShell),并分析了硅藻蛋白核PyShell的結(jié)構(gòu)和功能,闡述了它在Rubisco有效催化CO?固定中的貢獻(xiàn),為研究海洋生態(tài)系統(tǒng)中CO?的同化途徑提供了重要參考。 

1 硅藻細(xì)胞蛋白核PyShell蛋白示意圖
蛋白核的中心部分穿透類木質(zhì)膜,其膜腔中特異性存在碳酸酐酶(CA)。研究認(rèn)為,CA能使硅藻通過從海水中吸收并儲存在葉綠體中的HCO3-快速轉(zhuǎn)化成CO?,為聚合在蛋白核中的Rubisco提供CO?(圖1)。然而,由于蛋白核難以分離,其成分和功能并不為人所熟知。

研究團隊進行了硅藻PyShell蛋白的鑒定及定位,并解析了硅藻細(xì)胞中PyShell蛋白的分子結(jié)構(gòu)。此外,研究人員還利用冷凍電子斷層掃描技術(shù)詳細(xì)觀察了硅藻內(nèi)部的微細(xì)結(jié)構(gòu)。 

2 硅藻中PyShell蛋白的鑒定 
3 硅藻細(xì)胞中PyShell蛋白的原位冷凍電鏡斷層掃描圖像 
4 T. pseudonana PyShell蛋白體外結(jié)構(gòu)示意圖

通過基因組編輯技術(shù)破壞硅藻的PyShell基因后,這些基因被破壞的硅藻在空氣環(huán)境的生長速度顯著變慢,光合作用效率顯著降低,僅為野生菌株的1/805。在向反應(yīng)體系中逐步加入NaHCO3的過程中,通過液相氧電極(HansatechKing's Lynn,U.K.和氣相色譜火焰離子化檢測器同時測量硅藻(WT、m1m2樣品混合物中凈O?的釋放速率和DIC的總濃度。根據(jù)O?釋放速率與DIC濃度的關(guān)系曲線計算光合作用參數(shù):Pmax,最大凈O?釋放速率;K0.5,Pmax的一半時DIC濃度;[DIC]comp,無凈O?釋放時DIC濃度;APC,表觀光合傳導(dǎo)率(表1。 

5 T. pseudonana PyShell突變體的表型和光合參數(shù)

A.對細(xì)胞粗提取物進行蛋白免疫印跡,證明突變體中不存在TpPyShell12蛋白;BC. 野生型WT(灰色)、m1(橙色)和m2(黃色)在大氣CO?LC;0.04%)和高濃度CO?HC1%)中的生長狀態(tài);D. WT、m1m2的光合活性對無機碳濃度的依賴性測定;EF. WT、m1m2細(xì)胞的FIB-SEM成像,葉綠體(綠色)、蛋白核Rubisco(藍(lán)色);G-J.根據(jù)FIB-SEM數(shù)據(jù)對蛋白核進行形態(tài)定量分析;K-R. m1m2細(xì)胞的Cryo-ET成像。
1 Pmax,最大凈O2釋放速率;K0.5,Pmax的一半時DIC濃度;[DIC]comp,無凈O2釋放時DIC濃度;APC,表觀光合傳導(dǎo)率。

進一步觀察PyShell基因被破壞的硅藻二級葉綠體,發(fā)現(xiàn)正常的蛋白核結(jié)構(gòu)無法形成,蛋白核周圍的片狀結(jié)構(gòu)消失,蛋白核結(jié)構(gòu)崩解并破碎。這表明由PyShell形成的正常蛋白核結(jié)構(gòu)對RubiscoCO?供應(yīng)至關(guān)重要6 

6 PyShell在組織硅藻pyrenoid結(jié)構(gòu)中的作用 
綜上所述,研究人員首次鑒定出包裹在硅藻pyrenoid周圍的蛋白質(zhì)外殼結(jié)構(gòu)——PyShell,并從多個尺度上詳細(xì)表征了PyShell晶格的精細(xì)構(gòu)造。此外,研究人員通過對T. pseudonana PyShell缺失突變體的深入功能分析,展示了PyShell在維持pyrenoid整體結(jié)構(gòu)中的關(guān)鍵角色,使硅藻能夠在CO?濃度極低的環(huán)境中繼續(xù)生長并高效固定碳,從而支撐其在全球海洋生態(tài)系統(tǒng)中的重要地位。這一系列發(fā)現(xiàn)不僅加深了我們對硅藻碳同化機制的認(rèn)識,還為未來開發(fā)利用硅藻進行碳捕獲與生物能源生產(chǎn)提供了新的可能。

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