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2025-05-16 03:30:35多肽文庫(kù)構(gòu)建
多肽文庫(kù)構(gòu)建是一種合成大量具有序列多樣性的多肽集合的技術(shù)。它通過(guò)在固定位置上引入不同的氨基酸殘基,生成一系列具有不同序列的多肽。這些多肽可以用于藥物篩選、疫苗開(kāi)發(fā)、疾病診斷等領(lǐng)域。通過(guò)高通量合成與篩選,可以快速鑒定出具有特定生物活性的多肽分子,加速新藥研發(fā)進(jìn)程。多肽文庫(kù)構(gòu)建技術(shù)具有高度的靈活性和可定制性,能夠滿足不同研究需求,是現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)研究中的重要工具。

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2025-10-15 17:04:30數(shù)字化轉(zhuǎn)型下,各類(lèi)實(shí)驗(yàn)室軟件如何構(gòu)建高效合規(guī)的智能生態(tài)?
在數(shù)字化轉(zhuǎn)型浪潮下,實(shí)驗(yàn)室軟件已成為現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室提升運(yùn)營(yíng)效率、規(guī)范作業(yè)流程、挖掘數(shù)據(jù)深層價(jià)值的核心支撐,不同類(lèi)型的軟件聚焦特定環(huán)節(jié)痛點(diǎn),協(xié)同構(gòu)建起覆蓋實(shí)驗(yàn)室全場(chǎng)景的數(shù)字化生態(tài)體系。以下為幾種主流實(shí)驗(yàn)室軟件及其核心功能詳解:?1. King's LIMS(實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng))?嚴(yán)格遵循 ISO 17025 等國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)與行業(yè)規(guī)范,構(gòu)建樣品全生命周期的閉環(huán)管理體系。核心功能包括檢驗(yàn)流程標(biāo)準(zhǔn)化管控、人機(jī)料法環(huán)全要素資源管理、合規(guī)性校驗(yàn)與質(zhì)量風(fēng)險(xiǎn)防控,以及檢測(cè)報(bào)告的自動(dòng)生成。且系統(tǒng)配備多級(jí)數(shù)據(jù)審核機(jī)制與深度統(tǒng)計(jì)分析能力,確保實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營(yíng)合規(guī)、高效且數(shù)據(jù)全程可追溯。2. King's ELN(電子實(shí)驗(yàn)記錄本)?以結(jié)構(gòu)化數(shù)字化形式全面替代傳統(tǒng)紙質(zhì)記錄,支持實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)直接錄入、公式自動(dòng)計(jì)算、實(shí)驗(yàn)步驟與結(jié)果電子化追溯,有效避免紙質(zhì)記錄易丟失、難檢索、易篡改等問(wèn)題。該系統(tǒng)可與 King's LIMS 無(wú)縫集成,實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與檢驗(yàn)流程數(shù)據(jù)的互聯(lián)互通,進(jìn)一步提升實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)效率。?3. King's SDMS(科學(xué)數(shù)據(jù)管理系統(tǒng))?專(zhuān)注于實(shí)驗(yàn)室原始數(shù)據(jù)的高效管理,能夠自動(dòng)采集、精準(zhǔn)存儲(chǔ)各類(lèi)儀器生成的原始數(shù)據(jù),支持對(duì)結(jié)果數(shù)據(jù)與文件進(jìn)行分類(lèi)管理,打破數(shù)據(jù)孤島,為后續(xù)數(shù)據(jù)復(fù)用、深度分析與合規(guī)審計(jì)奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。?4. King's Bl 高性能敏捷分析系統(tǒng)?聚焦實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)價(jià)值挖掘,可滿足用戶在報(bào)表、數(shù)據(jù)可視化、自助探索分析、數(shù)據(jù)挖掘建模、智能分析等方面的多樣化需求,幫助用戶打破信息孤島有效整合數(shù)據(jù),提供敏捷開(kāi)發(fā)能力同時(shí)快速響應(yīng)業(yè)務(wù)和管理層的數(shù)據(jù)需求,幫助實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)數(shù)字化運(yùn)營(yíng),并全流程支持。?5. King's IOT 實(shí)驗(yàn)室設(shè)備及環(huán)境物聯(lián)監(jiān)控預(yù)警系統(tǒng)?依托物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)構(gòu)建實(shí)驗(yàn)室安全與環(huán)境智能管控體系,可實(shí)時(shí)采集實(shí)驗(yàn)室關(guān)鍵環(huán)境參數(shù)與設(shè)備運(yùn)行狀態(tài)數(shù)據(jù),通過(guò)穩(wěn)定的無(wú)線傳輸硬件將數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)上傳至監(jiān)控平臺(tái)。平臺(tái)具備數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)顯示、存儲(chǔ)與分析功能,當(dāng)監(jiān)控參數(shù)超出預(yù)設(shè)安全范圍時(shí),可自動(dòng)觸短信通知等預(yù)警機(jī)制,為科研與檢測(cè)活動(dòng)提供穩(wěn)定、安全的環(huán)境保障。 數(shù)字化生態(tài)系統(tǒng)的成功運(yùn)行,依賴于各模塊之間的深度互聯(lián)與數(shù)據(jù)流的閉環(huán)整合。實(shí)驗(yàn)室藉此構(gòu)建出“可視、可控、可預(yù)測(cè)”的數(shù)字孿生體,在合規(guī)、效率與創(chuàng)新之間達(dá)成最優(yōu)平衡。上述系統(tǒng)各司其職又緊密協(xié)同,共同構(gòu)建起高效、合規(guī)、智能的數(shù)字化實(shí)驗(yàn)室新生態(tài),推動(dòng)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營(yíng)邁向智能化與高效化的新階段。
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2023-06-16 14:28:25構(gòu)建表達(dá)載體想降本增效?看這一篇就夠了
想要開(kāi)發(fā)有穩(wěn)定生產(chǎn)能力的細(xì)胞株,除了在細(xì)胞開(kāi)發(fā)中對(duì)于細(xì)胞表達(dá)能力的評(píng)估篩選以外,前期的表達(dá)載體的構(gòu)建過(guò)程也非常重要。使用納升移液技術(shù)可以顯著提高細(xì)胞株過(guò)程基因合成,表達(dá)載體構(gòu)建以及轉(zhuǎn)染篩選等實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)效率,降低實(shí)驗(yàn)成本。聲波移液展示Echo?移液系統(tǒng)依靠專(zhuān) 利技術(shù)(U.S. Patent 6938995)和創(chuàng)新方法改變移液操作在整個(gè)生命科學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用。它采用動(dòng)態(tài)液體分析(Dynamic Fluid Analysis?, DFA)技術(shù)和聲波移液(Acoustic Droplet Ejection,ADE)技術(shù),讓研究人員能夠移取多種不同類(lèi)型的液體,完成微量小體積(2.5/25nL)的移液工作。全流程無(wú)需槍頭耗材,無(wú)交叉風(fēng)險(xiǎn)。納升移液技術(shù)讓細(xì)胞株構(gòu)建更快、更準(zhǔn)、更經(jīng)濟(jì)更快—— Echo快速任意孔到任意孔移液,極速基因組裝在質(zhì)粒構(gòu)建前期,需要非常多的準(zhǔn)備實(shí)驗(yàn),如基因組裝中將不同的DNA片段混合,在檢測(cè)反應(yīng)中將不同的樣本組合,在NGS文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中將多個(gè)文庫(kù)pooling到一起,在CRISPr基因編輯中構(gòu)建sgRNA文庫(kù)等等,這些實(shí)驗(yàn)都需要進(jìn)行快速、靈活的加樣移液,就算使用高通量的移液工作站,往往也要好幾小時(shí)才能完成。納升移液技術(shù)Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點(diǎn)則讓此類(lèi)應(yīng)用簡(jiǎn)單、快速化,每次轉(zhuǎn)移花費(fèi)更少時(shí)間更短。這為基因組裝節(jié)省了高達(dá)82%的時(shí)間。從母板任意孔轉(zhuǎn)移任意體積樣品到目標(biāo)板任意孔中,實(shí)現(xiàn)快速挑選、樣品混合和組合。有效縮短實(shí)驗(yàn)周期更準(zhǔn)—— Echo加樣精 準(zhǔn),提高克隆效率利用質(zhì)粒上含有的抗性選擇進(jìn)行篩選,需要對(duì)篩選結(jié)果進(jìn)行鑒定, 而qPCR也是常用的鑒定方法之一。使用Echo納升移液技術(shù)進(jìn)行微量化克隆篩選鑒定,可以以更少的實(shí)際成本精 準(zhǔn)完成實(shí)驗(yàn)。使用Echo完成 qPCR的反應(yīng)體系構(gòu)建,通過(guò)減少每個(gè)組件的體積,并使用不使用tips的Echo,將反應(yīng)體積縮小10倍,從10 μL減少到1 μL,成本降低了8倍。精 準(zhǔn)減小實(shí)驗(yàn)體積更經(jīng)濟(jì)—— Echo微量化,縮小反應(yīng)體系,讓新技術(shù)更經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)化的設(shè)計(jì)必然會(huì)帶來(lái)更大的樣本量,從而導(dǎo)致更高的費(fèi)用, Echo采用聲波的能量進(jìn)行無(wú)接觸式移液,且每滴液滴僅為2.5nL或25nL,因此可以直接省去吸頭耗材的消耗,也可以將檢測(cè)反應(yīng)體系降低4-100倍,使成本急劇下降。有效縮減試劑成本Gibson and Golden Gate Assembly實(shí)驗(yàn):不同反應(yīng)體積的成本效益和組裝效率比較產(chǎn)品信息“僅用于科研,不用于臨床診斷”
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2023-01-10 12:42:52貝克曼庫(kù)爾特Biomek NGeniuS與IDT文庫(kù)制備自動(dòng)化解決方案
隨著基因組測(cè)序和數(shù)據(jù)分析方法的廣泛普及,越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)室正在探索下一代測(cè)序(Next-Generation Sequencing,NGS)作為研究工具的可行性。然而,NGS文庫(kù)的手動(dòng)制備過(guò)程單調(diào)乏味,根據(jù)所構(gòu)建文庫(kù)的類(lèi)型而異,耗時(shí)從數(shù)小時(shí)到數(shù)天時(shí)間不等,并且操作過(guò)程中必須小心謹(jǐn)慎,以避免人工出錯(cuò)導(dǎo)致的制備失敗,浪費(fèi)寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統(tǒng)是一款全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng),幫助我們從第 一步即確保正確無(wú)誤。DNA樣品上機(jī),撥動(dòng)轉(zhuǎn)盤(pán),按下按鈕,運(yùn)行過(guò)程無(wú)需值守,每批次可支持運(yùn)行4-24任意數(shù)量的樣品,是實(shí)驗(yàn)室追求靈活性和自動(dòng)化的理想之選。圖1 Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動(dòng)化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫(kù)制備方法,獨(dú)特的兩步連接法能夠有效抑 制接頭二聚體和模板DNA自連,因而可有效提高文庫(kù)轉(zhuǎn)換率,尤其適用于cfDNA和FFPE等低質(zhì)量樣品,有助于研究人員發(fā)現(xiàn)和表征腫瘤樣品中出現(xiàn)的低頻變異位點(diǎn)。圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我們使用Biomek NGeniuS系統(tǒng)對(duì)三種不同類(lèi)型的樣品,cfDNA、FFPE和gDNA,分別構(gòu)建24個(gè)、10個(gè)和4個(gè)文庫(kù)。cfDNA 樣品所得文庫(kù)平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴(kuò)增片段平均長(zhǎng)度為362bp,長(zhǎng)度分布一致且呈正態(tài)。與參考基因組相比,該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)比對(duì)率為99.49%,配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.84%。23份樣品中reads平均重復(fù)率為0.46%。圖3  以cfDNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。FFPE樣品構(gòu)建的文庫(kù)平均片段長(zhǎng)度為378 bp,長(zhǎng)度呈正態(tài)分布。與參考基因組相比,該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)比對(duì)率為99.8%,配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.84%。10份樣品中reads平均重復(fù)率為0.37%。圖4  以FFPE DNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。gDNA樣品制備的文庫(kù)平均片段長(zhǎng)度為391bp,長(zhǎng)度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預(yù)期一致。與參考基因組相比,該樣品組從 NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)的比對(duì)率為99.2%,配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.3%。3份樣品中reads平均重復(fù)率為0.56%。圖5  以gDNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。在Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構(gòu)建文庫(kù),所得文庫(kù)片段大小分布一致,并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說(shuō)明書(shū)建議的文庫(kù)大小范圍。對(duì)三種不同濃度的樣品重復(fù)進(jìn)行測(cè)序,結(jié)果表明,平均文庫(kù)大小為362~391bp。所獲文庫(kù)比對(duì)率>99.2%,配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率>99.3%,重復(fù)率
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2022-11-21 10:19:06“沃”的實(shí)驗(yàn) | 13份動(dòng)物模型構(gòu)建方法系列資料上新,造模不再難!
在做基礎(chǔ)研究時(shí)加入動(dòng)物實(shí)驗(yàn)不僅會(huì)使研究工作更完善,也會(huì)提高投稿的命中率,但是想把實(shí)驗(yàn)做成功卻不是件容易的事兒,因?yàn)樵趧?dòng)物造模中總遇到各種難題:搞不清動(dòng)物建模標(biāo)準(zhǔn)化的流程,做起實(shí)驗(yàn)磕磕絆絆造模需要注意的細(xì)節(jié)多,反復(fù)摸索十幾遍才造模成功明明按照文獻(xiàn)中的實(shí)驗(yàn)方法造模,卻還老是不成功“沃”的實(shí)驗(yàn)全網(wǎng)最全的生命科學(xué)研究線上學(xué)習(xí)平臺(tái)第二期內(nèi)容:常見(jiàn)疾病動(dòng)物模型——構(gòu)建方法系列2幫助大家解決造模中遇到的難題第二期內(nèi)容有什么?“沃”的實(shí)驗(yàn)——全網(wǎng)最全的生命科學(xué)研究線上學(xué)習(xí)平臺(tái)第二期內(nèi)容,為大家分享常見(jiàn)疾病動(dòng)物模型構(gòu)建方法,涵蓋8大視頻課程+2大實(shí)驗(yàn)手冊(cè)+3大建模的標(biāo)準(zhǔn)操作流程。5位老師線上為你講解不同動(dòng)物模型的背景、造模方法等內(nèi)容,理論結(jié)合實(shí)踐,希望能給大家的動(dòng)物建模帶來(lái)更多新思路和新靈感。點(diǎn)擊鏈接,即可進(jìn)入學(xué)習(xí)  8大視頻課程  2大實(shí)驗(yàn)手冊(cè)  3大建模的標(biāo)準(zhǔn)操作流程歡迎大家收藏「“沃”的實(shí)驗(yàn)」線上學(xué)習(xí)平臺(tái)學(xué)習(xí)平臺(tái),內(nèi)容將持續(xù)更新下期內(nèi)容預(yù)告: 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物手術(shù)操作-手術(shù)方法 
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2022-05-06 09:04:16多肽芯片能用在哪里?
多肽芯片能用在哪里?多肽芯片是一種新型的生物芯片,是研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)或其他物質(zhì)(如核酸、多糖、化合物)之間相互作用最直觀的研究技術(shù)。多肽芯片在諸多領(lǐng)域中具有廣泛的應(yīng)用前景,如疫苗開(kāi)發(fā)、藥物研發(fā)和篩選、臨床檢測(cè)以及蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)功能研究。 多肽芯片可用在抗原表位篩選、藥物開(kāi)發(fā)及篩選、臨床檢測(cè)等。l  多肽芯片在抗原表位篩選方面體現(xiàn)出巨大的優(yōu)勢(shì),可大量縮短開(kāi)發(fā)時(shí)間,為前期的抗體篩選提供準(zhǔn)確的指標(biāo)和快速的反饋;l  多肽芯片為藥物開(kāi)發(fā)及篩選提供有效的解決平臺(tái),可有效提高新藥研發(fā)的成功功率,降低研發(fā)失敗的可能性,加快藥物研發(fā)進(jìn)程;l  現(xiàn)代醫(yī)療技術(shù)顯示,大多數(shù)疾病與蛋白質(zhì)表達(dá)異常有關(guān),通過(guò)檢測(cè)患者樣本中的蛋白活性即可找到其發(fā)病機(jī)理,多肽芯片技為該難題提供了快捷的方法,使得對(duì)癥下藥成為可能。 Aurora提供多肽芯片的制備用到的微陣列點(diǎn)樣設(shè)備——多肽芯片點(diǎn)樣儀Aurora多肽芯片點(diǎn)樣儀采用化學(xué)固相合成法,可按需制備穩(wěn)定的多肽微陣列芯片,如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片,更多產(chǎn)品詳情可進(jìn)一步了解產(chǎn)品價(jià)格或技術(shù)參數(shù)等信息,直接聯(lián)系A(chǔ)urora員?!緝?nèi)容源自Aurorabiomed公眾號(hào)《多肽芯片為什么那么火?》,轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明】Aurora集團(tuán)30年來(lái)致力于制造生物醫(yī)藥領(lǐng)域自動(dòng)化高通量設(shè)備。
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