隨著基因組測(cè)序和數(shù)據(jù)分析方法的廣泛普及，越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)室正在探索下一代測(cè)序（Next-Generation Sequencing，NGS）作為研究工具的可行性。然而，NGS文庫(kù)的手動(dòng)制備過程單調(diào)乏味，根據(jù)所構(gòu)建文庫(kù)的類型而異，耗時(shí)從數(shù)小時(shí)到數(shù)天時(shí)間不等，并且操作過程中必須小心謹(jǐn)慎，以避免人工出錯(cuò)導(dǎo)致的制備失敗，浪費(fèi)寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統(tǒng)是一款全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)，幫助我們從第 一步即確保正確無(wú)誤。DNA樣品上機(jī)，撥動(dòng)轉(zhuǎn)盤，按下按鈕，運(yùn)行過程無(wú)需值守，每批次可支持運(yùn)行4-24任意數(shù)量的樣品，是實(shí)驗(yàn)室追求靈活性和自動(dòng)化的理想之選。

圖1 Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)

IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動(dòng)化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫(kù)制備方法，獨(dú)特的兩步連接法能夠有效抑 制接頭二聚體和模板DNA自連，因而可有效提高文庫(kù)轉(zhuǎn)換率，尤其適用于cfDNA和FFPE等低質(zhì)量樣品，有助于研究人員發(fā)現(xiàn)和表征腫瘤樣品中出現(xiàn)的低頻變異位點(diǎn)。

圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程

我們使用Biomek NGeniuS系統(tǒng)對(duì)三種不同類型的樣品，cfDNA、FFPE和gDNA，分別構(gòu)建24個(gè)、10個(gè)和4個(gè)文庫(kù)。

cfDNA 樣品所得文庫(kù)平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴(kuò)增片段平均長(zhǎng)度為362bp，長(zhǎng)度分布一致且呈正態(tài)。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)比對(duì)率為99.49%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.84%。23份樣品中reads平均重復(fù)率為0.46%。

圖3  以cfDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。

FFPE樣品構(gòu)建的文庫(kù)平均片段長(zhǎng)度為378 bp，長(zhǎng)度呈正態(tài)分布。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)比對(duì)率為99.8%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.84%。10份樣品中reads平均重復(fù)率為0.37%。

圖4  以FFPE DNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。

gDNA樣品制備的文庫(kù)平均片段長(zhǎng)度為391bp，長(zhǎng)度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預(yù)期一致。與參考基因組相比，該樣品組從 NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫(kù)的比對(duì)率為99.2%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率為99.3%。3份樣品中reads平均重復(fù)率為0.56%。

圖5  以gDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫(kù)的分析結(jié)果。

在Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構(gòu)建文庫(kù)，所得文庫(kù)片段大小分布一致，并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說(shuō)明書建議的文庫(kù)大小范圍。對(duì)三種不同濃度的樣品重復(fù)進(jìn)行測(cè)序，結(jié)果表明，平均文庫(kù)大小為362~391bp。所獲文庫(kù)比對(duì)率>99.2%，配對(duì)的reads比對(duì)到參考基因組的比對(duì)率>99.3%，重復(fù)率<0.56%。

表1 在Biomek NGeniuS文庫(kù)制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit的測(cè)序結(jié)果。

實(shí)驗(yàn)證明，Biomek NGeniuS文庫(kù)制備系統(tǒng)與IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit配套使用，可成功制備出適合在Illumina平臺(tái)上測(cè)序的高質(zhì)量全基因組測(cè)序文庫(kù)。

＊ 以上產(chǎn)品僅用于工業(yè)及科研，不用于臨床診斷，禁忌內(nèi)容或注意事項(xiàng)詳見說(shuō)明書。

IND2022感染性疾病

先進(jìn)分子診斷技術(shù)應(yīng)用論壇

2022年3月17日-3月18日 上海

IND2022感染性疾病先進(jìn)分子診斷技術(shù)應(yīng)用論壇將于2022年3月17日 -18日在上海盛大召開，本次論壇聚集40+來(lái)自醫(yī)院、檢驗(yàn)中心、企業(yè)專家共同討 論在感染性疾病領(lǐng)域眾多棘手問題。本次大會(huì)主要圍繞感染性疾病的創(chuàng)新診斷技 術(shù)展開討論，例如：NGS/mNGS/單分子/納米孔/多重PCR技術(shù)/四代測(cè)序技術(shù)/ 數(shù)字PCR/CRISPR/POCT/多重檢測(cè)技術(shù)等技術(shù)，涉及濕實(shí)驗(yàn)過程問題探討、背 景菌、臨床病原體檢測(cè)、耐藥基因檢測(cè)等。深度剖析病原微生物檢測(cè)各流程難點(diǎn) 以體外診斷行業(yè)發(fā)展，縱覽整體行業(yè)大格局。

會(huì)議期間，敬請(qǐng)光臨9號(hào)貝克曼庫(kù)爾特，精彩講座“高通量mNGS檢測(cè)自動(dòng)化平臺(tái)搭建策略”，讓您了解一站式NGS自動(dòng)化整體解決方案，期待您的參與！

講座時(shí)間：

3月17日 13:50-14:20

BIT第五屆求實(shí)抗體藥物

深度聚焦峰會(huì)

2022年3月30日-3月31日 上海

長(zhǎng)路漫漫，志當(dāng)高遠(yuǎn)，希望研制出更能多高品質(zhì)的新藥、好藥，成為每個(gè)抗體藥逐夢(mèng)人共同的命題！BIT 2022 第五屆求實(shí)抗體藥物深度聚焦峰會(huì)將于2022年3月30-31日上海逐夢(mèng)起航！

100+生物藥行業(yè)專家與1000+行業(yè)同仁邀您把握當(dāng)下生物藥研發(fā)新動(dòng)向，共同逐夢(mèng)未來(lái)！

會(huì)議期間，敬請(qǐng)光臨A6貝克曼庫(kù)爾特展臺(tái)，精彩講座“自動(dòng)化時(shí)代下的抗體藥物研發(fā)方案”，帶您了解自動(dòng)化解決方案如何來(lái)滿足現(xiàn)今生物藥企業(yè)對(duì)于自動(dòng)化的需求，期待您的參與！

講座時(shí)間：

3月30日 11:20-11:50

離心技術(shù)起源于1864年，作為經(jīng)典的分離純化方法至今已經(jīng)發(fā)展出眾多分支，而2023年是貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)問世的第76年，為增強(qiáng)與商業(yè)伙伴間的聯(lián)系，2023年第 一季度貝克曼庫(kù)爾特開展了4期離心機(jī)全國(guó)巡演，幫助市場(chǎng)快速認(rèn)識(shí)貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)產(chǎn)品，近距離觀摩和操作新款貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)。

跟隨時(shí)間的腳步，讓我們一起來(lái)回顧2023年一季度貝克曼庫(kù)爾特離心大師招商會(huì)的精彩盛況。

2月10日 鄭州希爾頓酒店

貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-鄭州站

2月17日 西安皇冠假日酒店   

貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-西安站

3月3日 北京長(zhǎng)富宮酒店

貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-北京站

3月31日 廣州生物島

貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-廣州站

以上僅僅是2023年招商活動(dòng)的開篇，接下來(lái)我們將在中部，南部城市持續(xù)舉辦離心大師招商活動(dòng)，歡迎各地有志之士前來(lái)參與，共同推進(jìn)離心技術(shù)的發(fā)展！

更多巡演地點(diǎn)

4月杭州 貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-杭州站

4月重慶 貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-重慶站

5月武漢 貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-武漢站

6月福州 貝克曼庫(kù)爾特離心機(jī)招商會(huì)-福州站

（如需參會(huì)，請(qǐng)留意貝克曼庫(kù)爾特地區(qū)銷售及渠道部門通知）

你知道嗎？相對(duì)離心力（RCF）是指在離心力場(chǎng)的作用下，顆粒所受離心力相當(dāng)于地球重力的倍數(shù)，單位是重力加速度（9.8m/s2）。在 1,000,000 xg相對(duì)離心力下，1g的樣品相當(dāng)于1,000kg，也就是一輛小轎車在重力場(chǎng)下的重量。

因此，在超速離心過程中，保持機(jī)器、轉(zhuǎn)頭、耗材的安全運(yùn)行非常重要。在離心機(jī)75周年之際，貝克曼庫(kù)爾特的工程師們?cè)谟脩魧?shí)驗(yàn)室進(jìn)行了多次巡檢，因此也總結(jié)出一份超速離心機(jī)轉(zhuǎn)頭的維護(hù)與保養(yǎng)指南，幫助大家保持正確的操作，在保障安全性的前提下提高實(shí)驗(yàn)效率！

維護(hù)保養(yǎng)

主機(jī)的維護(hù)保養(yǎng)

經(jīng)常用軟布或薄紙清潔離心腔體，以保持離心腔的清潔干燥。離心機(jī)表面和離心腔可以用軟布浸濕中性清潔劑（如Solution 555以10倍稀釋）清潔。為保證儀器正常運(yùn)轉(zhuǎn)，離心完畢應(yīng)擦干離心腔冷凝水，保持離心腔干凈和干燥。離心腔門上的密封圈可以用薄紙或軟布每3個(gè)月清潔一次；若發(fā)現(xiàn)腔門O圈磨損，需立即更換。

轉(zhuǎn)頭的檢查

定期的轉(zhuǎn)頭檢查是轉(zhuǎn)頭安全運(yùn)行的保障。經(jīng)常檢查轉(zhuǎn)頭表面有無(wú)損傷；轉(zhuǎn)頭孔內(nèi)、水平吊桶底部有無(wú)損傷或腐蝕；轉(zhuǎn)頭蓋螺紋有無(wú)磨損，如發(fā)現(xiàn)上述情況立即與維修工程師聯(lián)系進(jìn)行檢測(cè)。定期檢查轉(zhuǎn)頭的“O”型密封圈是否老化、斷裂或缺損，如有上述現(xiàn)象請(qǐng)及時(shí)更換同型號(hào)“O”型密封圈。檢查所有的密封表面光滑無(wú)損傷，以確保轉(zhuǎn)頭的密封。

轉(zhuǎn)頭的清洗

在轉(zhuǎn)頭使用中，需定期清洗轉(zhuǎn)頭以防止腐蝕。若出現(xiàn)樣品外溢，應(yīng)立即清洗轉(zhuǎn)頭和附件。

• 使用塑料或木質(zhì)工具將“O”型密封圈或墊片取出清洗，不能使用金屬工具以防止出現(xiàn)劃痕。

• 使用中性的清潔劑（如 Solution 555）和軟刷清洗轉(zhuǎn)頭及附件。

• 轉(zhuǎn)頭用水清洗后，轉(zhuǎn)頭體或吊桶倒置晾干。

• 定期清洗“O”型密封圈，“O”型密封圈建議一年更換兩次（或根據(jù)具體需要）。

轉(zhuǎn)頭的滅菌和消毒

轉(zhuǎn)頭和大部分轉(zhuǎn)頭附件（除Noryl材質(zhì)）可以在121℃下高壓滅菌1h。滅菌時(shí)，取下轉(zhuǎn)頭蓋、吊桶蓋或轉(zhuǎn)頭塞，將轉(zhuǎn)頭/吊桶倒置滅菌。70%酒精可以用于所有的轉(zhuǎn)頭附件，也可以使用次氯酸鈉（Bleach），但可能會(huì)引起轉(zhuǎn)頭表面涂層褪色。

轉(zhuǎn)頭的存放及保養(yǎng)

所有的定角轉(zhuǎn)頭、垂直及近垂直轉(zhuǎn)頭應(yīng)將轉(zhuǎn)頭蓋或塞子取下后，倒置存放。水平轉(zhuǎn)頭存放時(shí)應(yīng)將吊桶取下。轉(zhuǎn)頭應(yīng)存放于干燥通風(fēng)的環(huán)境中，不能放在離心機(jī)內(nèi)。定期在密封圈上涂抹真空脂（VacuumGrease ），在轉(zhuǎn)頭蓋及吊桶蓋的金屬螺紋處上涂潤(rùn)滑油（Spinkote Lubricant）。

測(cè)速盤的檢查及更換（超速離心機(jī)）

轉(zhuǎn)頭使用前必須檢查測(cè)速盤是否干凈和破損，如不干凈，需用酒精清潔并等干燥后使用；如有破損，需及時(shí)更換測(cè)速盤。首先用鑷子或刀片取下舊的測(cè)速盤，用丙酮清洗黏附物，然后插入工具，將新的測(cè)速盤沿著工具放置到轉(zhuǎn)頭的底部，并按壓。取下工具，將測(cè)速盤朝下放置轉(zhuǎn)頭，至少壓2h后再使用轉(zhuǎn)頭（過夜為佳）。

現(xiàn)場(chǎng)轉(zhuǎn)頭檢查程序（FRIP）

我們?yōu)樗胸惪寺鼛?kù)爾特超高效離心機(jī)和高效離心機(jī)用戶提供現(xiàn)場(chǎng)轉(zhuǎn)頭檢查程序（FRIP），創(chuàng)建該程序的目的是幫助實(shí)驗(yàn)室：

1. 通過檢測(cè)轉(zhuǎn)頭應(yīng)力腐蝕、金屬疲勞、磨損或陽(yáng)極氧化涂層損壞，防止過早失效

2. 為實(shí)驗(yàn)室人員傳授正確的轉(zhuǎn)頭保養(yǎng)知識(shí)

   
   

通過FRIP，經(jīng)專業(yè)訓(xùn)練的貝克曼庫(kù)爾特工程師應(yīng)邀來(lái)到您的實(shí)驗(yàn)室?guī)椭鷻z查所有轉(zhuǎn)頭。工程師采用諸如光纖管道鏡等非破壞性方法檢查轉(zhuǎn)頭是否出現(xiàn)腐蝕等損壞跡象。如果發(fā)現(xiàn)問題，將建議修復(fù)或更換，幫助您避免轉(zhuǎn)頭失效的昂貴代價(jià)。

在FRIP訪問期間，貝克曼庫(kù)爾特工程師還向您的員工詳細(xì)介紹維護(hù)程序、轉(zhuǎn)頭損壞以及轉(zhuǎn)頭受損時(shí)可能發(fā)生的情況。這些信息有助于加強(qiáng)實(shí)驗(yàn)室良好規(guī)范，減少應(yīng)力腐蝕，特別是使用鋁轉(zhuǎn)頭的實(shí)驗(yàn)室。請(qǐng)聯(lián)系您當(dāng)?shù)刎惪寺鼛?kù)爾特現(xiàn)場(chǎng)服務(wù)辦事處安排FRIP事宜。

不確定轉(zhuǎn)頭是否損壞？

有時(shí)候轉(zhuǎn)頭腐蝕肉眼清晰可見，但有時(shí)候卻不那么明顯。如果您對(duì)任何貝克曼庫(kù)爾特轉(zhuǎn)頭的狀況存有疑問，請(qǐng)聯(lián)系最近的貝克曼庫(kù)爾特辦事處了解具體步驟。

轉(zhuǎn)頭退役

轉(zhuǎn)頭的檢查

即使設(shè)計(jì)最精良、得到最妥善維護(hù)的轉(zhuǎn)頭，也難以避免失效的一天。腐蝕、應(yīng)力腐蝕和金屬疲勞?這些肉眼看不見的東西最 終會(huì)造成損害。請(qǐng)考慮淘汰任何保修期已結(jié)束的轉(zhuǎn)頭。

貝克曼庫(kù)爾特轉(zhuǎn)頭內(nèi)置一些重要的疲勞壽命預(yù)防措施。比如，貝克曼庫(kù)爾特超速離心機(jī)的設(shè)計(jì)可以控制轉(zhuǎn)頭故障造成的物理破壞；我們的高效離心機(jī)經(jīng)設(shè)計(jì)和測(cè)試，確保正常疲勞壽命長(zhǎng)于七年保修期內(nèi)可以運(yùn)行的周期數(shù)。但這些額外的安全措施不能取代謹(jǐn)慎的退役實(shí)踐。即便損壞得到控制，但轉(zhuǎn)頭失效意味著損失寶貴的樣品并嚴(yán)重?fù)p壞儀器?孤注一擲將會(huì)付出昂貴的代價(jià)。

防止腐蝕

今天的超速離心機(jī)轉(zhuǎn)頭維護(hù)與保養(yǎng)指南就介紹到這里，希望大家的每一次離心實(shí)驗(yàn)都能夠安全又高效！

你的自動(dòng)化NGS文庫(kù)構(gòu)建真的全自動(dòng)簡(jiǎn)單易用嗎？

高通量測(cè)序技術(shù)廣泛應(yīng)用到產(chǎn)前診斷、腫瘤臨床診斷、遺傳學(xué)疾病檢測(cè)、藥物基因組學(xué)檢測(cè)等各個(gè)領(lǐng)域。其中濕實(shí)驗(yàn)NGS建庫(kù)因?yàn)榱鞒虖?fù)雜、步驟繁瑣、耗時(shí)長(zhǎng)等因素，自動(dòng)化移液工作站代替人工已經(jīng)被測(cè)序行業(yè)廣泛采用。搭建成熟穩(wěn)定的自動(dòng)化建庫(kù)平臺(tái)需要經(jīng)過編輯、測(cè)試、優(yōu)化，方能投入使用，還可能面臨處理樣本數(shù)量不夠靈活和以8為倍數(shù)制樣的試劑浪費(fèi)，有時(shí)還伴有手工半自動(dòng)操作，需要培養(yǎng)熟練的設(shè)備管理人員等問題。

貝克曼庫(kù)爾特生命科學(xué)特推出的Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)，具備簡(jiǎn)單易用的防錯(cuò)設(shè)置、無(wú)人值守的自動(dòng)化處理、以全新的方式開啟“一鍵式自動(dòng)化”NGS。今天小貝將為你揭秘Biomek NGeniuS是如何實(shí)踐極簡(jiǎn)主義，用一個(gè)按鈕進(jìn)行自動(dòng)化建庫(kù)。

圖1. Biomek NGeniuS 全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)

一鍵開啟NGS自動(dòng)化建庫(kù)

Step.1

免編應(yīng)用程序 輕松設(shè)置方法

在Biomek NGeniuS Portal，支持您從NGeniuS電子應(yīng)用程序庫(kù)中直接選擇需要使用的方法，無(wú)需方法編輯調(diào)試優(yōu)化。您可以輸入今日運(yùn)行的批次名稱、樣本數(shù)量，靈活地調(diào)整建庫(kù)投入量， PCR循環(huán)數(shù)，磁珠晾干時(shí)間等細(xì)節(jié)參數(shù)，并選擇建庫(kù)實(shí)驗(yàn)的安全起始點(diǎn)。

Step. 2

工作輔助材料 幫助試劑準(zhǔn)備

完成實(shí)驗(yàn)設(shè)置后，可下載打印工作輔助表，根據(jù)表單提示準(zhǔn)備所需試劑。

Step.3 撥動(dòng)導(dǎo)航轉(zhuǎn)盤  一鍵運(yùn)行你的實(shí)驗(yàn)

Biomek NGeniuS主機(jī)的實(shí)驗(yàn)運(yùn)行僅需控制一個(gè)唯 一的導(dǎo)航轉(zhuǎn)盤。實(shí)驗(yàn)批次的信息和選擇菜單將顯示在背部的24英寸平視顯示界面中，視圖清晰簡(jiǎn)潔，內(nèi)容一目了然。

圖2. Biomek NGeniuS導(dǎo)航轉(zhuǎn)盤與平視顯示界面

首先，平視顯示器所示的信息將指引您完成建庫(kù)實(shí)驗(yàn)的試劑、耗材擺放。Dynamic DeckOptix光學(xué)分析技術(shù)將自動(dòng)實(shí)時(shí)識(shí)別耗材種類與擺放位置是否正確，避免耗材擺放錯(cuò)誤的發(fā)生。OCR（光學(xué)字符識(shí)別技術(shù)識(shí)別）技術(shù)，則幫助識(shí)別試劑盒標(biāo)簽，判斷試劑使用是否正確。

隨即Biomek NGeniuS通過液面探測(cè)技術(shù)，自動(dòng)判斷試劑管內(nèi)試劑量是否足夠并進(jìn)行試劑分裝。分裝完成的試劑盒可收回冰箱存儲(chǔ)。NGeniuS即可開始建庫(kù)實(shí)驗(yàn)，平視顯示器將同步顯示建庫(kù)完成時(shí)間。配合內(nèi)置熱循環(huán)儀，機(jī)械手搬運(yùn)系統(tǒng)以及溫控模塊，NGeniuS 支持全流程無(wú)人值守。您可以通過Biomek NGeniuS Portal軟件遠(yuǎn)程實(shí)時(shí)查看，隨時(shí)隨地掌握實(shí)驗(yàn)動(dòng)態(tài)，合理安排實(shí)驗(yàn)室工作進(jìn)度。

不斷豐富的應(yīng)用程序庫(kù)

Biomek NGeniuS不需要進(jìn)行建庫(kù)試劑盒方法的編輯，直接從應(yīng)用程序庫(kù)里面下載開發(fā)完成的應(yīng)用程序即可使用。同時(shí)，貝克曼庫(kù)爾特生命科學(xué)旨在不斷豐富應(yīng)用程序，相繼與IDT, Illumina, AmoyDx，Pillar Biosciences等基因測(cè)序和分析解決方案公司簽訂應(yīng)用開發(fā)協(xié)議，在 Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫(kù)制備系統(tǒng)上開發(fā)應(yīng)用程序，持續(xù)擴(kuò)展電子應(yīng)用程序庫(kù)列表，滿足科研端及臨床轉(zhuǎn)化不斷迭代變化的試劑盒方法需求。