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2025-02-28 18:17:42抗體噬菌體文庫構(gòu)建
抗體噬菌體文庫構(gòu)建是一種生物技術(shù)方法，通過將抗體基因片段克隆到噬菌體載體中，并導(dǎo)入噬菌體宿主細(xì)胞，使每個(gè)噬菌體展示一種特定的抗體片段。這種方法能高效篩選和富集具有特定抗原結(jié)合活性的抗體，適用于抗體藥物研發(fā)、疾病診斷等領(lǐng)域。通過構(gòu)建大規(guī)模的抗體噬菌體文庫，可以快速鑒定出高親和力、高特異性的抗體候選分子。

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2023-12-25 17:14:18重組抗體的類型有哪些？
重組抗體，也被稱為重組免疫球蛋白，是通過基因工程技術(shù)將抗體的基因在合適的宿主細(xì)胞中表達(dá)并生產(chǎn)出來的一類抗體。與傳統(tǒng)的多克隆抗體和單克隆抗體相比，重組抗體具有更高的特異性和親和力，并且可以針對特定的抗原表位進(jìn)行設(shè)計(jì)和優(yōu)化。重組抗體的類型包括嵌合抗體、雙特異性抗體、抗體片段和Fc融合蛋白等。下面一起來看一下他們各種的應(yīng)用：https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/recombinant-antibody-overview①嵌合抗體1975年，雜交瘤技術(shù)的發(fā)現(xiàn)徹底改變了抗體研究和臨床開發(fā)。然而，鼠源性抗體的療-效受到人抗鼠抗體（HAMA）效應(yīng)的限制，鼠源性單抗對人體具有異種蛋白的免疫原性 ,在人體內(nèi)半衰期較短。1984年，研究人員通過基因工程構(gòu)建了第一個(gè)嵌合抗體，也是公認(rèn)的第一種重組抗體，以降低鼠源抗體在人體內(nèi)的免疫原性。其中，約30%-35%的分子來源于小鼠的抗體序列，約65%-70%來源于人的抗體序列。所得嵌合抗體保留了親代小鼠抗體的抗原結(jié)合能力?？贵w嵌合是開發(fā)治-療性人源化抗體的第一步。義翹神州采用CDR移植技術(shù)和計(jì)算機(jī)輔助分子建模，提供高質(zhì)量的單克隆抗體人源化服務(wù)，成功率高，人源化程度>90%。②抗體片段每一個(gè)完整的免疫球蛋白（IgG）分子包含通過二硫鍵連接的兩條重鏈和兩條輕鏈?？贵w片段（如Fab、scFv和VHH）體積小，比其全長抗體具有更好的組織或腫瘤穿透力。因此，它們在免疫治-療方面具有巨大的前景，尤其是在實(shí)體瘤方面。此外，它們的半衰期也較短，可用作放射性顯像劑。然而，由于缺乏Fc區(qū)，它們不能引起Fc介導(dǎo)的抗體效應(yīng)功能，如抗體依賴性細(xì)胞毒性（ADCC）和補(bǔ)體依賴性細(xì)胞毒性（CDC）。起初采用酶解法對IgG抗體進(jìn)行片段化。胃蛋白酶作用于鉸鏈區(qū)二硫鍵所連接的兩條重鏈的近C端，水解產(chǎn)生被稱為F(ab’)2的二價(jià)Fab片段。然后，通過木瓜蛋白酶將該片段裂解為兩個(gè)相同的Fab片段。然而，酶解法限制了可制備的抗體片段類型，而且不適合工業(yè)化大規(guī)模生產(chǎn)和純化。隨著抗體工程技術(shù)的進(jìn)步，這些問題可以通過重組生產(chǎn)抗體片段來解決?？贵w基因克隆測序成功后，可通過瞬時(shí)轉(zhuǎn)染在原核表達(dá)系統(tǒng)（如大腸桿菌）和哺乳動(dòng)物系統(tǒng)（HEK293細(xì)胞）中表達(dá)抗體片段。憑借豐富的重組生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn)，義翹神州建立了高通量VHH表達(dá)平臺(tái)，交付了多個(gè)VHH抗體生產(chǎn)項(xiàng)目，總體成功率超過90%。除了常見的VHH形式，我們還可以表達(dá)雙特異和多特異VHH。此外，義翹神州還可以表達(dá)其他各種高特異性和親和力的抗體片段，如scFv和Fab。③雙特異性抗體與常規(guī)單克隆抗體不同，雙特異性抗體（bsAb）具有兩個(gè)結(jié)合位點(diǎn)，可識(shí)別同一抗原上兩個(gè)不同抗原或表位。由于這一特性，雙特異性抗體備受研究者和制藥業(yè)的關(guān)注。截止目前，美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）已批準(zhǔn)了4種雙抗藥物，而且160多種雙抗正在進(jìn)行臨床試驗(yàn)，用于治-療癌癥、糖尿病、阿爾茨海默病和其他疾病。起初，雙特異性抗體通過四源雜交瘤技術(shù)制備，但這對下游抗體生產(chǎn)和純化構(gòu)成了巨大的挑戰(zhàn)。隨著過去20年重組DNA技術(shù)的發(fā)展，出現(xiàn)了幾種雙特異性抗體形式，以適應(yīng)所需的靶標(biāo)-產(chǎn)品特征。為了解決重鏈錯(cuò)配問題，Genentech首先提出了“knob-into-hole”（KiH）技術(shù)，該技術(shù)通過對CH3結(jié)構(gòu)域進(jìn)行改造，在每條重鏈中創(chuàng)建一個(gè)“knob”或一個(gè)“hole”，以誘導(dǎo)異源二聚化。同樣地，研究人員也采用了common light chain 和CrossMab等其他技術(shù)來解決輕鏈錯(cuò)配問題。表達(dá)雙特異性抗體主要在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中進(jìn)行。由于單克隆抗體和雙特異性抗體之間的各種結(jié)構(gòu)相似性，許多已建立的常規(guī)單抗純化工藝也可適用于雙特異性抗體。（參見另一篇文章：“雙特異性抗體：抗體治-療中的新星”）④Fc融合蛋白Fc融合蛋白（又稱Fc嵌合融合蛋白、Fc-Ig和Fc標(biāo)簽蛋白）是一種同源二聚體，由免疫球蛋白的Fc段與具有生物學(xué)活性的蛋白分子組成。雖然單克隆抗體是治-療性生物制劑開發(fā)的重-點(diǎn)，但Fc融合蛋白也是一類成功的生物制藥產(chǎn)品，至少有13種藥物獲得了歐洲藥品管理局（EMA）和美國FDA的批準(zhǔn)。除治-療應(yīng)用外，F(xiàn)c融合蛋白還是基礎(chǔ)研究中的檢測試劑，包括流式細(xì)胞術(shù)、免疫組織化學(xué)和蛋白結(jié)合試驗(yàn)。事實(shí)上，與Fc區(qū)的連接可以提高一些結(jié)合蛋白的溶解度和穩(wěn)定性。鑒于其大小和對糖基化的需求（大多數(shù)是糖蛋白），F(xiàn)c融合蛋白主要在哺乳動(dòng)物表達(dá)系統(tǒng)中產(chǎn)生。目前，抗體工程技術(shù)取得了一定的進(jìn)步，這極大地促進(jìn)了各種形式重組抗體的開發(fā)，用于疾病治-療。FDA已批準(zhǔn)了100多種抗體藥物，目前有多種抗體處于臨床后期開發(fā)階段。此外，重組抗體還可用于許多研究應(yīng)用：蛋白免疫印跡（WB）、免疫組織化學(xué)（IHC）、免疫熒光（IF）、流式細(xì)胞術(shù)（FC）和表面等離子體共振（SPR）?？傊?，重組抗體是基因工程技術(shù)的重要應(yīng)用之一，其類型多樣，具有廣泛的應(yīng)用前景。隨著基因工程技術(shù)的發(fā)展，重組抗體的生產(chǎn)成本和安全性問題也將得到進(jìn)一步優(yōu)化，為臨床治-療和科學(xué)研究提供更多有效的工具。同時(shí)，我們也應(yīng)該認(rèn)識(shí)到重組抗體的潛在風(fēng)險(xiǎn)和挑戰(zhàn)，加強(qiáng)對其安全性和有效性的評(píng)估和監(jiān)管，以確保其能夠更好地服務(wù)于人類的健康事業(yè)。更多重組抗體詳情關(guān)注：https://cn.sinobiological.com/news/recombinant-antibodies-formats
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2025-10-15 17:04:30數(shù)字化轉(zhuǎn)型下，各類實(shí)驗(yàn)室軟件如何構(gòu)建高效合規(guī)的智能生態(tài)？
在數(shù)字化轉(zhuǎn)型浪潮下，實(shí)驗(yàn)室軟件已成為現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室提升運(yùn)營效率、規(guī)范作業(yè)流程、挖掘數(shù)據(jù)深層價(jià)值的核心支撐，不同類型的軟件聚焦特定環(huán)節(jié)痛點(diǎn)，協(xié)同構(gòu)建起覆蓋實(shí)驗(yàn)室全場景的數(shù)字化生態(tài)體系。以下為幾種主流實(shí)驗(yàn)室軟件及其核心功能詳解：?1. King's LIMS（實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)）?嚴(yán)格遵循 ISO 17025 等國際標(biāo)準(zhǔn)與行業(yè)規(guī)范，構(gòu)建樣品全生命周期的閉環(huán)管理體系。核心功能包括檢驗(yàn)流程標(biāo)準(zhǔn)化管控、人機(jī)料法環(huán)全要素資源管理、合規(guī)性校驗(yàn)與質(zhì)量風(fēng)險(xiǎn)防控，以及檢測報(bào)告的自動(dòng)生成。且系統(tǒng)配備多級(jí)數(shù)據(jù)審核機(jī)制與深度統(tǒng)計(jì)分析能力，確保實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營合規(guī)、高效且數(shù)據(jù)全程可追溯。2. King's ELN（電子實(shí)驗(yàn)記錄本）?以結(jié)構(gòu)化數(shù)字化形式全面替代傳統(tǒng)紙質(zhì)記錄，支持實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)直接錄入、公式自動(dòng)計(jì)算、實(shí)驗(yàn)步驟與結(jié)果電子化追溯，有效避免紙質(zhì)記錄易丟失、難檢索、易篡改等問題。該系統(tǒng)可與 King's LIMS 無縫集成，實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與檢驗(yàn)流程數(shù)據(jù)的互聯(lián)互通，進(jìn)一步提升實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)效率。?3. King's SDMS（科學(xué)數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)）?專注于實(shí)驗(yàn)室原始數(shù)據(jù)的高效管理，能夠自動(dòng)采集、精準(zhǔn)存儲(chǔ)各類儀器生成的原始數(shù)據(jù)，支持對結(jié)果數(shù)據(jù)與文件進(jìn)行分類管理，打破數(shù)據(jù)孤島，為后續(xù)數(shù)據(jù)復(fù)用、深度分析與合規(guī)審計(jì)奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。?4. King's Bl 高性能敏捷分析系統(tǒng)?聚焦實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)價(jià)值挖掘，可滿足用戶在報(bào)表、數(shù)據(jù)可視化、自助探索分析、數(shù)據(jù)挖掘建模、智能分析等方面的多樣化需求，幫助用戶打破信息孤島有效整合數(shù)據(jù)，提供敏捷開發(fā)能力同時(shí)快速響應(yīng)業(yè)務(wù)和管理層的數(shù)據(jù)需求，幫助實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)數(shù)字化運(yùn)營，并全流程支持。?5. King's IOT 實(shí)驗(yàn)室設(shè)備及環(huán)境物聯(lián)監(jiān)控預(yù)警系統(tǒng)?依托物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)構(gòu)建實(shí)驗(yàn)室安全與環(huán)境智能管控體系，可實(shí)時(shí)采集實(shí)驗(yàn)室關(guān)鍵環(huán)境參數(shù)與設(shè)備運(yùn)行狀態(tài)數(shù)據(jù)，通過穩(wěn)定的無線傳輸硬件將數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)上傳至監(jiān)控平臺(tái)。平臺(tái)具備數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)顯示、存儲(chǔ)與分析功能，當(dāng)監(jiān)控參數(shù)超出預(yù)設(shè)安全范圍時(shí)，可自動(dòng)觸短信通知等預(yù)警機(jī)制，為科研與檢測活動(dòng)提供穩(wěn)定、安全的環(huán)境保障。 數(shù)字化生態(tài)系統(tǒng)的成功運(yùn)行，依賴于各模塊之間的深度互聯(lián)與數(shù)據(jù)流的閉環(huán)整合。實(shí)驗(yàn)室藉此構(gòu)建出“可視、可控、可預(yù)測”的數(shù)字孿生體，在合規(guī)、效率與創(chuàng)新之間達(dá)成最優(yōu)平衡。上述系統(tǒng)各司其職又緊密協(xié)同，共同構(gòu)建起高效、合規(guī)、智能的數(shù)字化實(shí)驗(yàn)室新生態(tài)，推動(dòng)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營邁向智能化與高效化的新階段。
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2023-06-16 14:28:25構(gòu)建表達(dá)載體想降本增效？看這一篇就夠了
想要開發(fā)有穩(wěn)定生產(chǎn)能力的細(xì)胞株，除了在細(xì)胞開發(fā)中對于細(xì)胞表達(dá)能力的評(píng)估篩選以外，前期的表達(dá)載體的構(gòu)建過程也非常重要。使用納升移液技術(shù)可以顯著提高細(xì)胞株過程基因合成，表達(dá)載體構(gòu)建以及轉(zhuǎn)染篩選等實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)效率，降低實(shí)驗(yàn)成本。聲波移液展示Echo?移液系統(tǒng)依靠專 利技術(shù)（U.S. Patent 6938995）和創(chuàng)新方法改變移液操作在整個(gè)生命科學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用。它采用動(dòng)態(tài)液體分析（Dynamic Fluid Analysis?, DFA）技術(shù)和聲波移液（Acoustic Droplet Ejection，ADE）技術(shù)，讓研究人員能夠移取多種不同類型的液體，完成微量小體積（2.5/25nL）的移液工作。全流程無需槍頭耗材，無交叉風(fēng)險(xiǎn)。納升移液技術(shù)讓細(xì)胞株構(gòu)建更快、更準(zhǔn)、更經(jīng)濟(jì)更快—— Echo快速任意孔到任意孔移液，極速基因組裝在質(zhì)粒構(gòu)建前期，需要非常多的準(zhǔn)備實(shí)驗(yàn)，如基因組裝中將不同的DNA片段混合，在檢測反應(yīng)中將不同的樣本組合，在NGS文庫構(gòu)建過程中將多個(gè)文庫pooling到一起，在CRISPr基因編輯中構(gòu)建sgRNA文庫等等，這些實(shí)驗(yàn)都需要進(jìn)行快速、靈活的加樣移液，就算使用高通量的移液工作站，往往也要好幾小時(shí)才能完成。納升移液技術(shù)Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點(diǎn)則讓此類應(yīng)用簡單、快速化，每次轉(zhuǎn)移花費(fèi)更少時(shí)間更短。這為基因組裝節(jié)省了高達(dá)82%的時(shí)間。從母板任意孔轉(zhuǎn)移任意體積樣品到目標(biāo)板任意孔中，實(shí)現(xiàn)快速挑選、樣品混合和組合。有效縮短實(shí)驗(yàn)周期更準(zhǔn)—— Echo加樣精 準(zhǔn)，提高克隆效率利用質(zhì)粒上含有的抗性選擇進(jìn)行篩選，需要對篩選結(jié)果進(jìn)行鑒定， 而qPCR也是常用的鑒定方法之一。使用Echo納升移液技術(shù)進(jìn)行微量化克隆篩選鑒定，可以以更少的實(shí)際成本精 準(zhǔn)完成實(shí)驗(yàn)。使用Echo完成 qPCR的反應(yīng)體系構(gòu)建，通過減少每個(gè)組件的體積，并使用不使用tips的Echo，將反應(yīng)體積縮小10倍，從10 μL減少到1 μL，成本降低了8倍。精 準(zhǔn)減小實(shí)驗(yàn)體積更經(jīng)濟(jì)—— Echo微量化，縮小反應(yīng)體系，讓新技術(shù)更經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)化的設(shè)計(jì)必然會(huì)帶來更大的樣本量，從而導(dǎo)致更高的費(fèi)用， Echo采用聲波的能量進(jìn)行無接觸式移液，且每滴液滴僅為2.5nL或25nL，因此可以直接省去吸頭耗材的消耗，也可以將檢測反應(yīng)體系降低4-100倍，使成本急劇下降。有效縮減試劑成本Gibson and Golden Gate Assembly實(shí)驗(yàn)：不同反應(yīng)體積的成本效益和組裝效率比較產(chǎn)品信息“僅用于科研，不用于臨床診斷”
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2024-01-16 16:35:20免疫組化抗體（IHC）的實(shí)踐應(yīng)用與常見問題詳解
免疫組化法（IHC）是使用抗體檢測組織切片（例如肝臟、胰-腺或心臟）中細(xì)胞蛋白質(zhì)（抗原）的過程。 當(dāng)組織樣本被送到實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行疾病檢查時(shí)，有幾個(gè)細(xì)節(jié)不易確定。幾種疾病或疾病亞型在顯微鏡下可能看起來相似或看起來具有相似大小的細(xì)胞，但具有不同的行為和必要的治-療，區(qū)分它們的最佳方法是檢測這些細(xì)胞上作為標(biāo)記的特定分子。免疫組化法（IHC）是一種使用抗體（匹配分子）的技術(shù)，用于尋找、識(shí)別附著在細(xì)胞上的標(biāo)記物。在顯微鏡下可以看到抗體本身，這有助于技術(shù)人員進(jìn)行精確識(shí)別。 免疫組化法（IHC）已廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)中，特別是癌癥診斷。淋巴瘤是依賴于IHC進(jìn)行正確診斷和治-療決策的癌癥之一。  免疫組化常見問題：問題一：我應(yīng)該使用PIER還是HIER進(jìn)行抗原修復(fù)？ 固定過程可能會(huì)掩蓋抗原，導(dǎo)致抗體結(jié)合無法進(jìn)行。這種掩蓋可以通過一種稱為抗原修復(fù)/抗原去掩蔽的技術(shù)來逆轉(zhuǎn)，該技術(shù)可以通過加熱（HIER；熱誘導(dǎo)抗原修復(fù)）或蛋白酶（PIER；蛋白水解誘導(dǎo)抗原修復(fù)）介導(dǎo)。后者使用蛋白酶K、胰蛋白酶和胃蛋白酶等酶。PIER方法通過降解掩蓋表位的肽而起作用。然而，PIER也可能導(dǎo)致樣品形態(tài)或抗原本身的改變。因此，PIER的使用頻率低于HIER，后者通過恢復(fù)表位的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)而起作用。為了確定是否應(yīng)該進(jìn)行抗原修復(fù)以及采用哪種方法，應(yīng)遵循以下指南：進(jìn)行文獻(xiàn)檢索，以確定其他研究人員如何可視化您感興趣的抗原。檢查抗體供應(yīng)商是否推薦了特定的抗原修復(fù)-方案。如果沒有特定的協(xié)議可用，我們建議使用HIER而不是PIER協(xié)議。對于HIER，總是使用中性抗原修復(fù)緩沖液，并與未進(jìn)行抗原修復(fù)的樣品進(jìn)行比較。如果中性染色溶液沒有產(chǎn)生良好的染色效果，則應(yīng)測試堿性或酸性抗原修復(fù)緩沖液。除了pH值外，其他需要優(yōu)化的參數(shù)是溫度和持續(xù)時(shí)間。理想情況下，嘗試各種pH值、溫度和時(shí)間組合。為了排除由HIER過程引起的偽影，始終包括一個(gè)控制樣品，該樣品在沒有HIER步驟的情況下進(jìn)行染色。  問題二：如何選擇IHC實(shí)驗(yàn)的抗體，單克隆抗體還是多克隆抗體？ 單克隆抗體和多克隆抗體的抗體特性決定了其優(yōu)缺點(diǎn)。單克隆抗體是針對單個(gè)表位的同種免疫球蛋白?？贵w是由一個(gè)動(dòng)物的單個(gè)B細(xì)胞克隆產(chǎn)生的，因此在免疫化學(xué)上相似。多克隆抗體是針對同一抗原的各種表位的異質(zhì)抗體混合物?？贵w是由動(dòng)物的不同B細(xì)胞克隆產(chǎn)生的，因此在免疫化學(xué)上不同。多克隆混合物中的抗體可能具有略微不同的特異性和親和力。 如果蛋白質(zhì)靶標(biāo)具有相同的氨基酸序列，單克隆抗體更合適。一旦抗原因各種原因發(fā)生構(gòu)象變化，如蛋白質(zhì)相互作用、翻譯后修飾、溫度、pH值、固定、鹽濃度等，單克隆抗體和抗原的聯(lián)合作用將受到嚴(yán)重影響。由于多克隆抗體具有多個(gè)表位，不受蛋白質(zhì)構(gòu)象變化的影響，一般來說，在一定范圍內(nèi)的pH和鹽濃度內(nèi)，多克隆抗體之間的抗原結(jié)合比單克隆抗體更穩(wěn)定。 問題三：一抗的孵育時(shí)間多久？一抗的孵育時(shí)間與溫度,抗體濃度有關(guān)。一般情況下,在37℃的條件下,孵育1-2小時(shí)左右。在室溫的條件下,孵育3小時(shí)左右。在4℃的條件下,孵育18-24小時(shí)左右。 義翹神州提供石蠟切片免疫組化（IHC）檢測服務(wù)，更多免疫組化的問題可以上義翹神州網(wǎng)咨詢！https://cn.sinobiological.com/services/immunohistochemistry-service
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2023-01-10 12:42:52貝克曼庫爾特Biomek NGeniuS與IDT文庫制備自動(dòng)化解決方案
隨著基因組測序和數(shù)據(jù)分析方法的廣泛普及，越來越多的實(shí)驗(yàn)室正在探索下一代測序（Next-Generation Sequencing，NGS）作為研究工具的可行性。然而，NGS文庫的手動(dòng)制備過程單調(diào)乏味，根據(jù)所構(gòu)建文庫的類型而異，耗時(shí)從數(shù)小時(shí)到數(shù)天時(shí)間不等，并且操作過程中必須小心謹(jǐn)慎，以避免人工出錯(cuò)導(dǎo)致的制備失敗，浪費(fèi)寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統(tǒng)是一款全自動(dòng)文庫制備系統(tǒng)，幫助我們從第 一步即確保正確無誤。DNA樣品上機(jī)，撥動(dòng)轉(zhuǎn)盤，按下按鈕，運(yùn)行過程無需值守，每批次可支持運(yùn)行4-24任意數(shù)量的樣品，是實(shí)驗(yàn)室追求靈活性和自動(dòng)化的理想之選。圖1 Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫制備系統(tǒng)IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動(dòng)化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫制備方法，獨(dú)特的兩步連接法能夠有效抑 制接頭二聚體和模板DNA自連，因而可有效提高文庫轉(zhuǎn)換率，尤其適用于cfDNA和FFPE等低質(zhì)量樣品，有助于研究人員發(fā)現(xiàn)和表征腫瘤樣品中出現(xiàn)的低頻變異位點(diǎn)。圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我們使用Biomek NGeniuS系統(tǒng)對三種不同類型的樣品，cfDNA、FFPE和gDNA，分別構(gòu)建24個(gè)、10個(gè)和4個(gè)文庫。cfDNA 樣品所得文庫平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴(kuò)增片段平均長度為362bp，長度分布一致且呈正態(tài)。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫比對率為99.49%，配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。23份樣品中reads平均重復(fù)率為0.46%。圖3  以cfDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。FFPE樣品構(gòu)建的文庫平均片段長度為378 bp，長度呈正態(tài)分布。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫比對率為99.8%，配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。10份樣品中reads平均重復(fù)率為0.37%。圖4  以FFPE DNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。gDNA樣品制備的文庫平均片段長度為391bp，長度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預(yù)期一致。與參考基因組相比，該樣品組從 NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫的比對率為99.2%，配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.3%。3份樣品中reads平均重復(fù)率為0.56%。圖5  以gDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。在Biomek NGeniuS全自動(dòng)文庫制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構(gòu)建文庫，所得文庫片段大小分布一致，并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說明書建議的文庫大小范圍。對三種不同濃度的樣品重復(fù)進(jìn)行測序，結(jié)果表明，平均文庫大小為362~391bp。所獲文庫比對率>99.2%，配對的reads比對到參考基因組的比對率>99.3%，重復(fù)率
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