用CTAB法提取細(xì)菌DNA的過程
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- heitiansh1 2017-10-09 00:00:00
- 一、針對(duì)一些不易于提取的細(xì)菌的方法: 試驗(yàn)試劑: 抽提緩沖液:2%CTAB(W/V)2%PVPK25(w/v)(去色素) 100mMTris-HCl(pH8.0) 25mMEDTA(pH8.0)2.0MNaCl 10MLiCl 2MLiCl DEPC-water(YZRNA酶活性) 3MNaAc(pH5.2) 96%乙醇 70%乙醇 試驗(yàn)步驟: 1、抽提緩沖液65℃預(yù)熱。 2、加菌體到已經(jīng)預(yù)熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min。 3、加酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),振蕩,以12000rpm,離心10min。 4、取上清,加氯仿/異戊醇(24:1)振蕩,以12000rpm,離心10min。 5、重復(fù)再作一次步驟4。 6、加入1/10體積的3M醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的異丙 醇),-20C下沉淀。 7、以2000rpm,離心10min。 8、棄上清,以70%乙醇條洗沉淀,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于 100ml 水中。 二、較為常用的細(xì)菌DNA提取方法: 實(shí)驗(yàn)步驟: 1、將菌株接種于液體LB培養(yǎng)基,37℃震蕩培養(yǎng)過夜。 2、取1.5ml 培養(yǎng)物12000rpm離心2min。 3、沉淀中加入567ul 的TE緩沖液,反復(fù)吹打使之重新懸浮,加入 30ul10%SDS和15ul 的蛋白酶K,混勻,于37℃溫育1h. 4、加入100ul5mol/LNaCl 充分混勻,再加入80ulCTAB/NaCl 溶液,混勻 后再65℃溫育10min。 5、加入等體積的酚/氯仿/異戊醇混勻,離心4-5min將上清轉(zhuǎn)入一只新管中, 加入0.6-0.8倍體積的異丙醇,輕輕混合直到DNA沉淀下來,沉淀可稍加離心。 6、沉淀用1ml 的70%乙醇洗滌后,離心棄乙醇. 三、菌液直接PCR 菌液直接PCR只需要用槍頭沾取菌落,或者加入1-2微升菌液即可。預(yù)變性時(shí)間可稍微延長(zhǎng)。如果引物特異性好,效果與用DNA模板差不多。
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