全部評(píng)論(1條)
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- CH68453622 2017-06-17 00:00:00
- 找甲基化位點(diǎn)也就CpG島一般是有以下幾個(gè)方法： 1. MSP，亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化后，將你想測(cè)的基因區(qū)域（如啟動(dòng)子區(qū)）轉(zhuǎn)入細(xì)菌質(zhì)粒中，進(jìn)行測(cè)序（金標(biāo)準(zhǔn)）.挑克隆7/10是甲基化的克隆認(rèn)為這個(gè)位點(diǎn)70%甲基化.大概可以測(cè)400+片段，但是問(wèn)題是沒(méi)有辦法太精確，因?yàn)闇y(cè)得越多越精確，測(cè)太多太貴. 2. 焦磷酸測(cè)序，這里指的是Qiagen的PyroMark焦磷酸測(cè)序，亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化后，對(duì)于啟動(dòng)子片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增，測(cè)序，測(cè)出甲基化程度，儀器中Q24有FDA的認(rèn)證，可以合作開(kāi)發(fā)開(kāi)發(fā)試劑盒.大概可以測(cè)60-70bp片段，勝在快速和穩(wěn)定，但是引物設(shè)計(jì)成功率不高50%左右，適合小樣本. 3. MassARRAY平臺(tái)進(jìn)行甲基化檢測(cè)，用的是質(zhì)譜法，也是亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化，針對(duì)目標(biāo)片段可以Z多到500bp，但是問(wèn)題是要求樣本量一般比較大，位點(diǎn)數(shù)*樣本數(shù)要等于384才好做，至少大于300因?yàn)槟菛|西一張片子384，用兩次就廢了，一周不用完也廢了. 4. 甲基化芯片如果你一還沒(méi)有找到基因那你用這個(gè)做個(gè)初篩不錯(cuò). 5. 甲基化測(cè)序，這個(gè)比較高端，也比較貴，25000一個(gè)，一般來(lái)說(shuō)是去篩選未知的一些甲基化位點(diǎn)的方式，全基因組范疇，效果拔群.
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- 不是只能發(fā)現(xiàn)哪里不一樣嗎 但是沒(méi)辦法知道變成什么基因了不是嗎 謝謝 后天就高考了啊
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