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- 一文帶你了解分子生物學(xué)研究技術(shù):聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)
1、什么是PCR
PCR是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction)的簡(jiǎn)稱,其是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA(或RNA)片段的分子生物學(xué)技術(shù)。這種技術(shù)模擬體內(nèi)DNA的天然復(fù)制過(guò)程,能將微量的DNA進(jìn)行特異性的擴(kuò)增,在短時(shí)間內(nèi)獲得足夠的DNA,是分子生物學(xué)研究中不可缺少的一員。
2、標(biāo)準(zhǔn)PCR的過(guò)程
此項(xiàng)技術(shù)是模擬DNA的天然復(fù)制過(guò)程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物,在整個(gè)PCR過(guò)程中包含了變性——退火(復(fù)性)——延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟。
DNA變性(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA。
退火(復(fù)性)(40℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。
延伸(68℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右最佳的活性)的作用下,以dNTP為原料,從引物的5′端→3′ 端延伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。
每一循環(huán)經(jīng)過(guò)變性、退火和延伸,DNA含量既增加一倍。
3、為什么要使用梯度PCR儀呢
梯度PCR儀是指一次性PCR擴(kuò)增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件的儀器,因?yàn)椴煌腄NA片段其最適退火溫度不同,采用梯度PCR儀通過(guò)設(shè)置一系列的梯度退火溫度進(jìn)行擴(kuò)增,從而一次性PCR擴(kuò)增就可以篩選出表達(dá)量高的最適退火溫度,優(yōu)化反應(yīng)條件,進(jìn)行有效的擴(kuò)增。
在理想狀態(tài)下,退火溫度足夠低,以保證引物同目的序列有效退火,同時(shí)還要足夠高,以減少非特異性結(jié)合。
使用普通的PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增時(shí),只能運(yùn)行一個(gè)特定的退火溫度,當(dāng)目的基因的退火溫度不適時(shí),就可能出現(xiàn)假陽(yáng)性,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。而對(duì)于梯度PCR儀,不但可以作為普通PCR儀使用,也可以通過(guò)設(shè)置不同的溫度梯度(通常為12個(gè)梯度溫度),研究未知DNA退火溫度的擴(kuò)增,有效降低或避免假陽(yáng)性,同時(shí)在不理想的工作條件下擴(kuò)增出產(chǎn)物,既節(jié)約成本也提高了實(shí)驗(yàn)效率。
適用于分子生物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、食品科學(xué)和農(nóng)學(xué)等領(lǐng)域,進(jìn)行分子克隆、基因表達(dá)分析、基因型鑒定、測(cè)序、病原微生物分析等實(shí)驗(yàn)研究。
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