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基于引物酶的全基因組擴(kuò)增pwga 誰Z先提出使用

電閃leiming 2016-12-19 19:09:09 480  瀏覽
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  • towerrt 2016-12-20 00:00:00
    PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR是一種體外DNA擴(kuò)增技術(shù),是在模板DNA、引物和4種脫氧核苷酸存在的條件下,依賴于DNA聚合酶的酶促合反應(yīng),將待擴(kuò)增的DNA片段與其兩側(cè)互補的寡核苷酸鏈引物經(jīng)“高溫變性——低溫退火——引物延伸”三步反應(yīng)的多次循環(huán),使DNA片段在數(shù)量上呈指數(shù)增加,從而在短時間內(nèi)獲得我們所需的大量的特定基因片段。PCR擴(kuò)增儀在環(huán)境檢測中,靶核酸序列往往存在于—個復(fù)雜的混合物如細(xì)胞提取液中,且含量很低,對于探測這種復(fù)雜群體中的特異微生物或某個基因,雜交就顯得不敏感。使用PCR技術(shù)可將靶序列放大幾個數(shù)量級,再用探針雜交探測對被擴(kuò)增序列作定性或定量研究分析微生物群體結(jié)構(gòu)。PCR技術(shù)常與其他技術(shù)結(jié)合起來使用,如RT-PCR、競爭PCR、巢式PCR、RAPf)、ARDRA等。類別聽語音競爭性PCR是一種定量PCR,通過向PCR反應(yīng)體系中加入人工構(gòu)建的帶有突變的競爭模板、控制競爭模板的濃度來確定目的模板的濃度,對目的模板作定量研究。將PCR技術(shù)和限制酶切技術(shù)結(jié)合使用,用限制酶酶切目的基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,通過對酶切產(chǎn)物的分析,探測該基因的多態(tài)性。RAPD(randomlyamplifiedpolymorphicDNA,RAPD)也是應(yīng)用比較廣泛的一項技術(shù)。RAPD是用那些對某—特定基因的非特異性的引物來擴(kuò)增某些片段。RAPD分析用于探測含有混合微生物種群的各種生物反應(yīng)器中的微生物多樣性。用RAPD分析所得到的基因組指紋圖譜在比較一段時間內(nèi)微生物種群的變化以及比較小試規(guī)模和中試規(guī)模的反應(yīng)器方面是有用的,但還不足以用來估測群落的生物多樣性。步驟聽語音PCR由變性--退火--延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:模板DNA的變性模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;模板DNA與引物的退火(復(fù)性)模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈,重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍。到達(dá)平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。

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