隨機(jī)引物擴(kuò)增多態(tài)性DNA？

目垂神· 2006-02-01 02:22:37 508 瀏覽

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墨尐顏爬 2006-02-04 00:00:00

我有幾種方法; 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)標(biāo)記：這種多態(tài)性是由于限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)或位點(diǎn)間DNA區(qū)段發(fā)生突變引起的。  隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性(RAPD)標(biāo)記：RAPD是通過(guò)短的隨機(jī)引物擴(kuò)增個(gè)體基因組DNA體現(xiàn)多態(tài)性  擴(kuò)增片段長(zhǎng)度(AFLP)多態(tài)性標(biāo)記：AFLP是將PCR技術(shù)與RFLP結(jié)合的一種方法，通過(guò)對(duì)基因組DNA酶切片段的選擇性擴(kuò)增來(lái)檢測(cè)DNA酶切片段長(zhǎng)度的多態(tài)性。  微衛(wèi)星多態(tài)性標(biāo)記(SSRP)：基于PCR技術(shù)的DNA標(biāo)記，多態(tài)性是由同一座位上的串聯(lián)單元數(shù)量的不同而產(chǎn)生的。  單鏈構(gòu)象多態(tài)性標(biāo)記(SSCP)  單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記(SNP)：將被測(cè)DNA片段與高密度DNA探針(中部單核苷酸替代探針)微陣列雜交，一次性快速顯示被測(cè)序列的單核苷酸多態(tài)性，并通過(guò)計(jì)算機(jī)分析雜交類型，Z終顯示SNP結(jié)果。

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晧瀚 2006-02-02 00:00:00

樓主想問(wèn)什么？樓主這個(gè)句子不包括那個(gè)問(wèn)號(hào)的話，是一種基因試驗(yàn)中的技術(shù)。隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA標(biāo)記（RandomamplificationpolymorphismDNA，簡(jiǎn)稱RAPD標(biāo)記）多個(gè)等位基因同時(shí)存在于一個(gè)基因座稱為遺傳多態(tài)性（genetic polymorphism）。遺傳多態(tài)性一般是建立遺傳分子標(biāo)記來(lái)分析的。主要有以下幾種方法：  限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)標(biāo)記：這種多態(tài)性是由于限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)或位點(diǎn)間DNA區(qū)段發(fā)生突變引起的。  隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性(RAPD)標(biāo)記：RAPD是通過(guò)短的隨機(jī)引物擴(kuò)增個(gè)體基因組DNA體現(xiàn)多態(tài)性  擴(kuò)增片段長(zhǎng)度(AFLP)多態(tài)性標(biāo)記：AFLP是將PCR技術(shù)與RFLP結(jié)合的一種方法，通過(guò)對(duì)基因組DNA酶切片段的選擇性擴(kuò)增來(lái)檢測(cè)DNA酶切片段長(zhǎng)度的多態(tài)性。  微衛(wèi)星多態(tài)性標(biāo)記(SSRP)：基于PCR技術(shù)的DNA標(biāo)記，多態(tài)性是由同一座位上的串聯(lián)單元數(shù)量的不同而產(chǎn)生的。  單鏈構(gòu)象多態(tài)性標(biāo)記(SSCP)  單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記(SNP)：將被測(cè)DNA片段與高密度DNA探針(中部單核苷酸替代探針)微陣列雜交，一次性快速顯示被測(cè)序列的單核苷酸多態(tài)性，并通過(guò)計(jì)算機(jī)分析雜交類型，Z終顯示SNP結(jié)果。

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隨機(jī)引物擴(kuò)增多態(tài)性DNA？:

同樣的DNA 一個(gè)引物能擴(kuò)增出來(lái) 另一個(gè)引物擴(kuò)增不出來(lái)？？:

葉綠體DNA擴(kuò)增時(shí)引物的尋找: 課題往下做需要做草果cpDNA的擴(kuò)增測(cè)序，現(xiàn)在卡在引物的查找確定上，老師給了部分的引物，比如rpS16—rpS16F；rpS16—AAA CGA TGT GGT ARA AAG CAA C；rpS16R—AAC ATC WAT TGC AAS GAT TCG ATA，但是自己取查文獻(xiàn)的時(shí)候查到了rps16這個(gè)序列，可是用的引物不同... 課題往下做需要做草果cpDNA的擴(kuò)增測(cè)序，現(xiàn)在卡在引物的查找確定上，老師給了部分的引物，比如rpS16—rpS16F；rpS16—AAA CGA TGT GGT ARA AAG CAA C；rpS16R—AAC ATC WAT TGC AAS GAT TCG ATA，但是自己取查文獻(xiàn)的時(shí)候查到了rps16這個(gè)序列，可是用的引物不同啊，是不是要先直接找到序列，再自行去設(shè)計(jì)？求各位大神幫幫忙，卡了好幾天了，還是不太明白。展開(kāi)

如何選擇用同源保守序列設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增DNA還是用RACE擴(kuò)增DNA: 我通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的基因序列ORF是不完整的?？吹骄W(wǎng)上有人說(shuō)可以通過(guò) Blast找到和序列相似的其他物種的序列，通過(guò)序列比對(duì)找到保守區(qū)，在保守區(qū)設(shè)計(jì)引物就可以擴(kuò)增DNA.還有人說(shuō)ORF不完整要設(shè)計(jì)3”5“的引物通過(guò)RACE先將3”端5“端擴(kuò)增出來(lái)拿到完整序列。我... 我通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的基因序列ORF是不完整的。看到網(wǎng)上有人說(shuō)可以通過(guò) Blast找到和序列相似的其他物種的序列，通過(guò)序列比對(duì)找到保守區(qū)，在保守區(qū)設(shè)計(jì)引物就可以擴(kuò)增DNA.還有人說(shuō)ORF不完整要設(shè)計(jì)3”5“的引物通過(guò)RACE先將3”端5“端擴(kuò)增出來(lái)拿到完整序列。我該做那一步呢，剛開(kāi)始做，實(shí)驗(yàn)小白，求指教展開(kāi)