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- sijie199396 2017-05-17 00:00:00
- 提取DNA主要有SDS和CTAB法,其實提取效果的好壞主要看提取的對象是什么樣的材料,在提取之前一定要好好分析材料的特性,然后在設計實驗步驟。
一)CTAB法
CTAB是一種去污劑,可溶解細胞膜,它能與核酸形成復合物,在高鹽溶液中(0.7 mol/L NaCl)是可溶的,當降低溶液鹽濃度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)時,從溶液中沉淀,通過離心就可將CTAB與核酸的復合物同蛋白質、多糖類物質分開,然后將CTAB與核酸的復合物沉淀溶解于高鹽溶液,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇。
(二)SDS法
利用高濃度的SDS,在較高溫度(55—65℃)條件下裂解細胞,使染色體離析,蛋白質變性,釋放出核酸,然后采用提高鹽濃度及降低溫度的做法使蛋白質及多糖雜質沉淀(Z常用的是加入5M的KAc于冰上保溫,在低溫條件下KAc與蛋白質及多糖結合成不溶物),離心除去沉淀后,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反復抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。
以下是在提取熱帶水果DNA時設計的兩種不同方法步驟,對比起來CTAB法好,在禾本科植物效果差不多!
1、 CTAB法
1) 在所需量的CTAB抽提液中加入2-巰基乙醇,使終濃度達2%(v/v)。將此溶液預熱至65℃。
對于每克新鮮的葉組織大約需要4ml的2-ME/CTAB抽提液。
2) 用液氮(-196℃)或干冰(-78℃)冷卻粉碎器/勻漿器,將0.5 g植物組織粉碎成細粉,然后將組織轉移到2.0 ml離心管。
3) 加入800 µl預熱的2-Me/CTAB,混合使之充分濕潤,于65℃溫育20 min,不時顛倒混勻。
4) 待冷至室溫后,加入800 µl氯仿/異戊醇(24:1),顛倒混勻至溶液呈乳濁狀----但不要振蕩。25℃,10000 rpm離心10 min。
5) 上清(~700 µl)轉移至另一干凈的離心管中,加入5 µl RNaseA貯液,37℃溫育30 min。
6) 加入700 µl氯仿/異戊醇,顛倒混勻,25℃,10000 rpm離心10 min。
7) 上清(~600 µl)轉移至另一干凈的1.5 ml離心管中,加入600 µl異丙醇,顛倒混勻,室溫或-20℃放置20 min。
8) 25℃,12000 rpm,離心10 min,收集沉淀。
9) 去上清,加1 ml70%乙醇洗滌沉淀兩次。(25℃,12000 rpm,離心10 min)
10)涼干DNA,溶于50 µl ddH2O,4℃保存?zhèn)溆谩?2、 SDS法
① 將0.3 g植物材料于液氮速凍,然后在研缽中將其磨碎,將粉末轉至2 ml離心管中。
② 加入1.2 ml預熱至65℃的提取緩沖液(其中加入3 μl β—巰基乙醇,增加DNA的穩(wěn)定性),置65℃水浴中放置30分鐘,不時顛倒混勻。。
③ 加入0.45 ml 5M的醋酸鉀,混勻,冰浴20分鐘,在10000 rpm離心20 min。需要的話,Miracloth紗布過濾除去沉淀,上清液轉入另一離心管中。
④ 加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),輕輕顛倒混勻,12000 rpm離心15 min。
⑤ 轉移上清液到另一新離心管中,加5 μl RNaseA貯液,37℃溫育30 min。
⑥ 加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),輕輕顛倒混勻,12000 rpm離心15 min。
⑦ 轉移上清液到另一新離心管中,加入0.7V異丙醇,輕輕顛倒混勻,-20℃放置30分鐘沉淀核酸。
⑧ 25℃,12000 rpm,離心10 min,收集沉淀。
⑨ 棄上清,70%乙醇洗兩次。
⑩ 涼干DNA,溶于50 µl ddH2O,4℃保存?zhèn)溆谩?/dd>
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