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cdna測(cè)序怎么控制從3'端測(cè)序和5'端測(cè)序

趙志勇521 2017-04-16 10:09:37 321  瀏覽
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全部評(píng)論(1條)

  • 一只小鳥5711 2017-04-17 00:00:00
    cdna測(cè)序怎么控制從3'端測(cè)序和5'端測(cè)序 高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(Next-generation sequencing technology),以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。 根據(jù)發(fā)展歷史、影響力、測(cè)序原理和技術(shù)不同等,主要有以下幾種:大規(guī)模平行簽名測(cè)序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克?。≒olony Sequencing)、454焦磷酸測(cè)序(454 pyrosequencing)、Illumina (Solexa) sequencing、ABI SOLiD sequencing、離子半導(dǎo)體測(cè)序(Ion semiconductor sequencing)、DNA 納米球測(cè)序 (DNA nanoball sequencing)等。 基因分析儀(即DNA測(cè)序儀),采用毛細(xì)管電泳技術(shù)取代傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺平板電泳,應(yīng)用該公司ZL的四色熒光染料標(biāo)記的ddNTP(標(biāo)記終止物法),因此通過(guò)單引物PCR測(cè)序反應(yīng),生成的PCR產(chǎn)物則是相差1個(gè)堿基的3'末端為4種不同熒光染料的單鏈DNA混合物,使得四種熒光染料的測(cè)序PCR產(chǎn)物可在一根毛細(xì)管內(nèi)電泳,從而避免了泳道間遷移率差異的影響,大大提高了測(cè)序的精確度。由于分子大小不同,在毛細(xì)管電泳中的遷移率也不同,當(dāng)其通過(guò)毛細(xì)管讀數(shù)窗口段時(shí),激光檢測(cè)器窗口中的CCD(charge-coupled device)攝影機(jī)檢測(cè)器就可對(duì)熒光分子逐個(gè)進(jìn)行檢測(cè),激發(fā)的熒光經(jīng)光柵分光,以區(qū)分代表不同堿基信息的不同顏色的熒光,并在CCD攝影機(jī)上同步成像,分析軟件可自動(dòng)將不同熒光轉(zhuǎn)變?yōu)镈NA序列,從而達(dá)到DNA測(cè)序的目的。分析結(jié)果能以凝膠電泳圖譜、熒光吸收峰圖或堿基排列順序等多種形式輸出。 它是一臺(tái)能自動(dòng)灌膠、自動(dòng)進(jìn)樣、自動(dòng)數(shù)據(jù)收集分析等全自動(dòng)電腦控制的測(cè)定DNA片段的堿基順序或大小和定量的精密儀器。PE公司還提供凝膠高分子聚合物,包括DNA測(cè)序膠(POP 6)和GeneScan膠(POP 4)。這些凝膠顆??讖骄?,避免了配膠條件不一致對(duì)測(cè)序精度的影響。它主要由毛細(xì)管電泳裝置、Macintosh電腦、彩色打印機(jī)和電泳等附件組成。電腦中則包括資料收集,分析和儀器運(yùn)行等軟件。它使用Z新的CCD攝影機(jī)檢測(cè)器,使DNA測(cè)序縮短至2.5h,PCR片段大小分析和定量分析為10~40min。

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