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一代測序,二代測序,三代測序的優(yōu)點(diǎn)缺點(diǎn)分別是什么,求大神賜教

zhudie1 2017-09-22 00:48:59 673  瀏覽
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全部評論(1條)

  • 好心情的朋友 2017-09-23 00:00:00
    diyi代指雙脫氧末端終止法,擴(kuò)增后通過毛細(xì)管電泳讀取序列,每次獲取數(shù)據(jù)量少 第二代為高通量測序,采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次獲得數(shù)G數(shù)據(jù),相對與第三代,都仍然需要擴(kuò)增的方法放大信號,擴(kuò)增后再檢測。 第三代特點(diǎn)是單分子測序,多基于納米科技,無需擴(kuò)增,對單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過納米孔等方式直接測序,核心特點(diǎn)是無需擴(kuò)增所以成本更低

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2017-10-24 02:40:15 615 2
深度測序和普通的二代測序有什么區(qū)別?有什么應(yīng)用

有兩種體細(xì)胞突變?nèi)菀妆缓鲆昩ai,一種是局限在特定組織的突變。舉例來說,如果突變只存在于大腦,而我們檢測的是血液,那就找不到這些致病突變。另一種致病性體細(xì)胞突變雖然發(fā)生在所有組織中,但是只影響一部分細(xì)胞,因此不容易被檢測到。

  普通的二代測序,全基因組或外顯子組測序是將DNA分成小片段,然后對各個(gè)片段多次讀取(一般是三十次)。然而,如果突變只發(fā)生在15-20%的細(xì)胞中,三十次讀取還不足以可靠地捕捉到它們,尤其是當(dāng)突變只影響一個(gè)基因拷貝時(shí)。

  Walsh和博士后Saumya Jamuar通過“定向高覆蓋度測序”技術(shù),為158名腦部疾病的患者鑒定致病突變,這些患者的癥狀包括癲癇、智力障礙、語言障礙等。

  研究人員并沒有分析整個(gè)基因組或外顯子組(所有蛋白編碼基因),而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上,并且大大提高了測序的深度。

  在一些疾病如唐氏綜合征中,嵌合突變相較于影響全身細(xì)胞的突變,產(chǎn)生的癥狀要輕一些。但是很少量的變異細(xì)胞就足以引發(fā)損害人身心健康的癥狀,在以往的研究中,為了從普通基因組中檢測到這些突變,研究人員就不得不增加測定的序列數(shù)量。而對少數(shù)候選基因區(qū)域進(jìn)行的平均300次深度測序,就可以有效辨別被誤認(rèn)為測序錯(cuò)誤的突變。


2020-10-23 15:49:28 611 0
Gwas和二代測序是不是一回事?
 
2013-07-13 08:38:24 362 2
DNA 的 1代測序,2代測序,3代測序的區(qū)別是什么啊?
那位GG/JJ內(nèi)告訴我啊 ,Z好說你具體點(diǎn) ,我不懂 0-0!
2013-08-07 02:51:15 791 2
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2018-03-11 05:00:55 530 2
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