實(shí)驗(yàn)溫度,ph,激動(dòng)劑及YZ劑對(duì)酶促反應(yīng)的影響的實(shí)驗(yàn)結(jié)果是怎樣的
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- 位heart 2018-03-11 15:56:11
- 淀粉酶活性的檢測:取一支試管,注入1%淀粉溶液5ml與稀釋的唾液0.5~2ml?;靹蚝蟛迦?支玻棒,將試管連同玻棒置于37℃水浴中。不時(shí)地用玻棒從試管中取出1滴溶液,滴加在白磁板上,隨即加1滴碘液,觀察溶液呈現(xiàn)的顏色。此實(shí)驗(yàn)延續(xù)至溶液僅表現(xiàn)碘被稀釋后的微黃色為止。記錄淀粉在水解過程中,遇碘后溶液顏色的變化。2.PH對(duì)酶活性的影響:取4支試管,分別加入0.4%鹽酸(PH≈1)、0.1%乳酸(PH≈5)、蒸餾水(PH≈7)與1%碳酸鈉(PH≈9)各2ml,再向以上四支試管中各加2ml1%淀粉溶液及2ml淀粉酶液。混合搖勻后置于37℃水浴中,保溫15分鐘。向四支試管中各加2ml班氏試劑,在沸水浴上加熱,根據(jù)生成紅棕色沉淀的多少,說明淀粉水解的強(qiáng)弱。綜合以上結(jié)果,說明PH對(duì)酶活性的影響。3.溫度對(duì)酶活性的影響:取3支試管,各加3ml1%淀粉溶液;另取3支試管,各加1ml淀粉酶液。將此6支試管分為三組,每組中盛淀粉溶液與淀粉 酶液的試管各1支,三組試管分別置入0℃、37℃與70℃的水浴中。5分鐘后,將各組中的淀粉溶液倒入淀粉酶液中,繼續(xù)維持原溫度條件5min后,立即滴 加2滴碘液,觀察溶液顏色的變化。根據(jù)觀察結(jié)果說明溫度對(duì)酶活性的影響。4.激活劑與YZ劑對(duì)酶活性的影響:取3支試管,按下表加入各種試
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- qPCR實(shí)驗(yàn)的重要影響因素--YZ劑
在決定實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測靈敏度、準(zhǔn)確性和可靠性的眾多因素中,模板質(zhì)量是決定重復(fù)性和生物學(xué)相關(guān)性的重要因素之一。諸多報(bào)告中也描述了生物樣品中常見的YZ成分會(huì)導(dǎo)致qPCR分析靈敏度和動(dòng)力學(xué)的顯著降低。
如何檢測YZ劑:
多種方法可用于評(píng)估生物樣品中是否存在YZ劑。常用方法是通過連續(xù)稀釋樣品來評(píng)估樣品的PCR效率,PCR效率的高低一定程度上反映出樣品質(zhì)量的好壞。一個(gè)GX的PCR反應(yīng)要求擴(kuò)增效率在90%-110%之間,當(dāng)擴(kuò)增效率>110%或<90%,無論是相對(duì)定量還是JD定量其ZZ結(jié)果都會(huì)不準(zhǔn)確。那么怎么來判斷是由于YZ劑引起的擴(kuò)增效率異常呢?如圖1所示,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線的狀態(tài)判斷,當(dāng)原液的數(shù)據(jù)點(diǎn)位于標(biāo)曲上方(紅色箭頭),則極有可能是樣本YZ劑YZPCR反應(yīng)導(dǎo)致Cq值偏大。
內(nèi)部擴(kuò)增控制(IACs)是一種與目標(biāo)核酸共純化和共擴(kuò)增的方法,可用來檢測YZ劑和指示加工過程中的模板丟失。IACs可包裝在噬菌體外殼中,也可以是包含引物結(jié)合序列和探針檢測序列的單鏈寡核苷酸。在熒光信號(hào)采集過程中,探針結(jié)合位點(diǎn)的部分不匹配阻止了與IACs雜交,隨后可對(duì)熔解曲線進(jìn)行分析,用以區(qū)分IACs和目標(biāo)擴(kuò)增子。IACs將是檢測病原體的優(yōu)質(zhì)方案,但這種方法不適用于細(xì)胞mRNA定量,因?yàn)榭紤]為每個(gè)單一mRNA設(shè)計(jì)模擬物是不現(xiàn)實(shí)的。
另外,也可以通過使用外源性對(duì)照來測試YZ劑,也稱為Spikes。該方法無論是在其構(gòu)造技術(shù)的復(fù)雜性方面,還是在分析之后與它們的準(zhǔn)確檢測相關(guān)的額外工作方面,相對(duì)都是比較簡單的。Spikes可以是RNA也可以是DNA分子,這取決于靶標(biāo)類型。mRNA表達(dá)分析選RNA Spikes,DNA靶標(biāo)分析選DNA Spikes。Spikes通常是幾千個(gè)堿基/堿基對(duì)異型序列,所以不會(huì)與任何已知目標(biāo)交叉反應(yīng)。
YZ劑類型:
YZ劑可以是核酸提取過程中使用的試劑,也可以是從生物樣品中提取的成分。YZ劑的影響,較好的情況是YZ劑會(huì)產(chǎn)生不準(zhǔn)確的定量結(jié)果;最壞的情況是高度YZ會(huì)產(chǎn)生假陰性結(jié)果。常見的YZ劑類型如下:
1)樣品本身的成分:許多生物樣品本身就含有嚴(yán)重YZ逆轉(zhuǎn)錄和PCR反應(yīng)的成分,如血液中的血紅蛋白、免疫球蛋白G,肌肉中的肌紅蛋白、膽鹽、腐殖酸、尿素和膠原蛋白,植物中的多糖多酚等。
2)提取和純化試劑的成分:許多用于純化核酸的試劑,如苯酚、氯仿、硫氰酸胍、鹽酸胍、乙二胺四乙酸、二甲基亞砜、十二烷基硫酸鈉、噻唑、三唑和核糖核酸等。
如何降低YZ劑的影響:
當(dāng)樣本中存在YZ劑,高濃度模板中YZ劑濃度較高,對(duì)PCR反應(yīng)的影響較大。低濃度模板由于稀釋使得YZ劑濃度有所下降,YZ劑的YZ作用也相應(yīng)降低。如果是樣品本身的成分,可對(duì)模板進(jìn)行稀釋,或者進(jìn)一步純化,又或者改進(jìn)提取方法來降低YZ劑的干擾。如果提取和純化試劑的成分,其本身就是最有效的逆轉(zhuǎn)錄和聚合酶鏈反應(yīng)的YZ劑,因此需要在提取和純化過程中注意對(duì)試劑成分的去除,F(xiàn)Z污染模板。
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