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string怎樣做蛋白互作網(wǎng)絡分析

skyyang200801 2017-09-15 00:59:30 371  瀏覽
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參與評論

全部評論(1條)

  • 小布阿TvT 2017-09-16 00:00:00
    簡單說就是用抗體去ip(免疫沉淀)你的蛋白,然后從沉淀中分理出dna拿去測序。這樣就知道蛋白和哪一段dna作用了。 具體的,要看你做什么了,染色體結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)路因子,還是rna,都可以。

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【應用案例】楊樹生長調(diào)節(jié)因子間互作

近日,浙江農(nóng)林大學盧孟柱教授團隊在Journal of Integrative Plant Biology (JIPB)上發(fā)表了題為“PagGRF12a interacts with PagGIF1b to regulate secondary xylem development through modulating PagXND1a expression in Populus alba × P. glandulosa”的研究論文。

該研究發(fā)現(xiàn),楊樹生長調(diào)節(jié)因子PagGRF12a過量表達,會使轉(zhuǎn)基因楊樹次生木質(zhì)部變窄;PagGRF12a抑 制表達,則會使轉(zhuǎn)基因楊樹次生木質(zhì)部變寬,表明PagGRF12a負調(diào)控次生木質(zhì)部的發(fā)育。

進一步研究發(fā)現(xiàn),PagGRF12a可以結(jié)合次生木質(zhì)部發(fā)育調(diào)控因子PagXND1a的啟動子而激活其表達,而PagGRF12a與PagGIF1b的互作可以增強對PagXND1a的調(diào)控。

其中,PagGRF12a與PagGIF1b的互作通過熒光素酶(Luciferase)的表達得到了驗證,生物發(fā)光成像在VILBER Newton 7.0 Bio上完成。


VILBER Newton 7.0 Bio植物活體成像系統(tǒng)

產(chǎn)品特點

· 采用新一代深度制冷的CCD相機,暗電流可降低至0.0001e/p/s@-90℃;

· F0.7超大光圈定焦鏡頭,大大提高了單位時間內(nèi)的進光量,從而有效縮短曝光時間,尤其適用于生物發(fā)光成像;

· 兩個藍光通道,滿足GFP及其不同變種,結(jié)合獨特的光譜分離技術,有效分辨GFP熒光和葉綠素自發(fā)熒光;

· 可30°旋轉(zhuǎn)的載物臺,可獲得更多植株細節(jié)成像;


應用范圍:

可應用于植株,葉片,種子,愈傷組織等熒光和生物發(fā)光成像,可同時顯示多個報告基因,滿足不同熒光探針的檢測需求,如GFP, RFP及紅外染料等,尤其適用于植株體內(nèi)Luc報告基因的檢測。


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