近日，浙江農林大學盧孟柱教授團隊在Journal of Integrative Plant Biology (JIPB)上發(fā)表了題為“PagGRF12a interacts with PagGIF1b to regulate secondary xylem development through modulating PagXND1a expression in Populus alba × P. glandulosa”的研究論文。

該研究發(fā)現(xiàn)，楊樹生長調節(jié)因子PagGRF12a過量表達，會使轉基因楊樹次生木質部變窄；PagGRF12a抑 制表達，則會使轉基因楊樹次生木質部變寬，表明PagGRF12a負調控次生木質部的發(fā)育。

進一步研究發(fā)現(xiàn)，PagGRF12a可以結合次生木質部發(fā)育調控因子PagXND1a的啟動子而激活其表達，而PagGRF12a與PagGIF1b的互作可以增強對PagXND1a的調控。

其中，PagGRF12a與PagGIF1b的互作通過熒光素酶（Luciferase）的表達得到了驗證，生物發(fā)光成像在VILBER Newton 7.0 Bio上完成。

VILBER Newton 7.0 Bio植物活體成像系統(tǒng)

產(chǎn)品特點：

· 采用新一代深度制冷的CCD相機，暗電流可降低至0.0001e/p/s@-90℃；

· F0.7超大光圈定焦鏡頭，大大提高了單位時間內的進光量，從而有效縮短曝光時間，尤其適用于生物發(fā)光成像；

· 兩個藍光通道，滿足GFP及其不同變種，結合獨特的光譜分離技術，有效分辨GFP熒光和葉綠素自發(fā)熒光；

· 可30°旋轉的載物臺，可獲得更多植株細節(jié)成像；

應用范圍：

可應用于植株，葉片，種子，愈傷組織等熒光和生物發(fā)光成像，可同時顯示多個報告基因，滿足不同熒光探針的檢測需求，如GFP, RFP及紅外染料等，尤其適用于植株體內Luc報告基因的檢測。

Dr. H?nle AG 能為印刷過程提供多種多樣定制的 UV / LED / IR / 熱風干燥機解決方案。

作為系統(tǒng)供應商，我們能夠提供包含了所有關鍵元件的高度集成產(chǎn)品并且專門提供整套解決方案，例如平張印刷和膠印、噴墨打印、柔印、移印或絲網(wǎng)印刷。

印刷能力 目錄

                               噴墨打印中的 LED 固化                       膠印中的 IR 熱風干燥

應用實例：

• 包裝

• 商標

• 紙

• 波紋材料

• 紙盒

• PP、PE、PVC、PET 薄膜

• 層壓制品

• 鋁

• 塑料

• 玻璃、木頭、金屬

• 金屬板（鋁、鋼）

• 無標簽薄膜

• 門

PCR（polymerase chain reaction，PCR)即聚合酶鏈反應，是利用一段DNA為模板，在DNA聚合酶和核苷酸底物共同參與下，將該段DNA擴增至足夠數(shù)量，以便進行結構和功能分析。PCR應用場景廣泛，不僅在基礎研究方面，還包括醫(yī)學診斷、法醫(yī)學和農業(yè)科學等各大領域。

近期多篇醫(yī)學研究多篇文獻中均應用到PCR技術及PCR儀產(chǎn)品，小編為大家做一下簡要分享。

近期南方醫(yī)科大學臨床醫(yī)學博士生導師、主任醫(yī)師王雅棣課題組在醫(yī)學期刊《Oncology Research and Treatment》上發(fā)表題為Preliminary Clinical Validation of a Filtration-Based CTC Assay for Tumor Burden and HER2 Status Monitoring in Metastatic Breast Cancer的文章，探索研究基于過濾的CTC測定轉移性乳腺癌腫瘤負荷和HER2狀態(tài)監(jiān)測的初步臨床驗證情況。

背景介紹：

循環(huán)腫瘤細胞(CTC，CirculatingTumorCell)是存在于外周血中的各類腫瘤細胞的統(tǒng)稱，因自發(fā)或診療操作從實體腫瘤病灶(原發(fā)灶、轉移灶)脫落，大部分CTC在進入外周血后發(fā)生凋亡或被吞噬，少數(shù)能夠逃逸并錨著發(fā)展成為轉移灶，增加惡性腫瘤患者死亡風險。CTC檢測通過捕捉檢測外周血中痕量存在的CTC，監(jiān)測CTC類型和數(shù)量變化的趨勢，以便實時監(jiān)測腫瘤動態(tài)、評估治療效果，實現(xiàn)實時個體治療。循環(huán)腫瘤細胞 (CTC) 承載著從基因組改變到蛋白質組構成的多維腫瘤相關信息，是一種很有前途的液體活檢材料。 CTC 的臨床有效性在轉移性乳腺癌 (MBC) 中得到了最廣泛的研究。  CELLSEARCH?檢測是目前使用最廣泛的方法，研究者們同時也在尋求替代策略。一種基于過濾的微流體裝置已被用于富集 CTC，但其臨床相關性仍然未知。

方法：在這項初步研究中，作者研究團隊招募了 47 名 MBC 患者，并評估了上述 CTC 檢測在腫瘤負荷監(jiān)測和人表皮生長因子受體 2 (HER2) 狀態(tài)測定方面的性能。結果：在基線時，51.1% 的患者 (24/47) 為 CTC 陽性。在伴隨著較差的放射學反應評估的樣本中，CTC 計數(shù)和陽性率也顯著升高。連續(xù)抽血表明，與血清標志物癌胚抗原和癌抗原 15-3 相比，CTC 計數(shù)能夠更準確地監(jiān)測腫瘤負荷。此外，與之前的報告相比，CTC-HER2 狀態(tài)與腫瘤-HER2 狀態(tài)中度一致。選定樣本中的 HER2 拷貝數(shù)測量進一步支持了 CTC-HER2 狀態(tài)評估。

結論：這項研究的初步結果表明，CDC 檢測在幾個方面都有希望，包括敏感的 CTC 檢測、準確的疾病狀態(tài)反映和 HER2 狀態(tài)確定。目前需要更多的研究來驗證這些發(fā)現(xiàn)，并進一步表征CTC測定的價值。

在實驗驗證中，柏恒科技RePure-A 梯度PCR儀發(fā)揮了一定作用，助力作者實驗研究進行。

而在另一篇發(fā)表在《Frontiers in Molecular Biosciences》期刊上的論文，柏恒科技PCR儀也發(fā)揮了不小作用。哈爾濱醫(yī)科大學附屬二院腎內科主任醫(yī)師、博士生及碩士生導師李冰課題組發(fā)表的題為Bioinformatic Analysis Combined With Experimental Validation Reveals Novel Hub Genes and Pathways Associated With Focal Segmental Glomerulosclerosis的文章，作者研究團隊利用生物信息學分析與實驗驗證相結合，揭示了與局灶性節(jié)段性腎小球硬化相關的新型Hub基因和通路。

 背景介紹：局灶節(jié)段性腎小球硬化癥 (focal segmental glomerulosclerosis, FSGS)是一種臨床病理綜合征，臨床表現(xiàn)為大量蛋白尿或腎病綜合征，病理以局灶節(jié)段分布的腎小球硬化病變及足細胞變性所致足突融合或消失為特征，多數(shù)表現(xiàn)為激素治療抵抗，并進行性發(fā)展至終末期腎病 (ESRD)。本研究旨在探索與FSGS相關的樞紐基因和通路，以確定潛在的診斷和治療靶點。

方法：作者團隊從 Gene Expression Omnibus (GEO) 數(shù)據(jù)庫下載了微陣列數(shù)據(jù)集 GSE121233 和 GSE129973。數(shù)據(jù)集包括 25 個 FSGS 樣本和 25 個正常樣本。使用R包“l(fā)imma”識別差異表達基因（DEG）。Gene Ontology (GO)功能和（KEGG）通路富集分析使用數(shù)據(jù)庫進行注釋，可視化和集成發(fā)現(xiàn) (DAVID)，用于識別 DEG 的通路和功能注釋。蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）是基于檢索相互作用基因（STRING）數(shù)據(jù)庫的搜索工具構建的，并使用 Cytoscape 軟件進行可視化。然后使用 Cytoscape 的 cytoHubba 插件評估 DEG 的中心基因。使用 FSGS 大鼠模型通過定量實時聚合酶鏈反應 (qRT-PCR) 驗證中shu基因的表達，并進行接受者操作特征 (ROC) 曲線分析以驗證這些中(shu)樞基因的準確性。

結果：在兩個 GSE 數(shù)據(jù)集（GSE121233 和 GSE129973）中共識別出 45 個 DEG，包括 18 個上調和 27 個下調的 DEG。其中，選擇了5個具有高度連通性的樞紐基因。在 PPI 網(wǎng)絡中，前 5 個中(shu)樞基因中，F(xiàn)N1 上調，而 ALB、EGF、TTR 和 KNG1 下調。 FSGS大鼠的qRT-PCR分析證實FN1的表達上調，EGF和TTR的表達下調。 ROC 分析表明 FN1、EGF 和 TTR 對 FSGS 顯示出相當大的診斷效率。

結論：通過生物信息學分析結合實驗驗證，鑒定出三個新的 FSGS 特異性基因，這可能會促進對 FSGS 的分子基礎的理解，并為臨床管理提供潛在的治療靶點。

實驗驗證中，實驗團隊應用了柏恒科技熒光定量PCR儀進行樣品測定并分析。

除了以上列出的幾篇文獻，柏恒科技PCR儀在生物科研、動物疫病等方面均有廣泛應用，下期我們再繼續(xù)分享。

文獻中PCR儀產(chǎn)品簡介

RePure系列智能二維梯度PCR儀

本系列PCR儀具有二維梯度摸索功能，多種梯度摸索模式；

自適應壓桿式熱蓋，合蓋緊蓋一步到位；

前進后出式風道，機器可并排放置，節(jié)約實驗空間；

Q3200系列熒光定量PCR儀

本系列熒光PCR儀采用四通道雙16孔模塊設計，可實現(xiàn)一機多用；

最大升降溫速率8℃/s，大大節(jié)約實驗時間；

體積小，重量輕，方便攜帶；

更多PCR儀技術應用，歡迎關注柏恒科技，我們提供各類梯度PCR儀、熒光PCR儀等，并為客戶提供生物學相關檢測解決方案。

原文以 The photosynthetic response of C3 and C4 bioenergy grass species to fluctuating light 為標題發(fā)表在GCB BIOENERGY上

作者 | Moon-Sub Lee 等

翻譯 | 武海月&子毅

人類對能源的需求與日俱增。能源草，作為一種可再生能源，越來越受到研究者們的重視。傳統(tǒng)化石燃料在使用過程中，會產(chǎn)生很多廢物，造成生態(tài)及環(huán)境污染問題，而能源草在使用過程中，產(chǎn)生的廢物少，被認為是一種清潔能源。由于土地資源有限，為了不擠兌現(xiàn)有農業(yè)用地，如何提高能源草的產(chǎn)量就顯得尤為重要。

自然界的光照波動是一個普遍存在的現(xiàn)象，這往往會導致作物的光合效率下降。光照波動的原因包括：冠層葉片的相互遮擋、風、云以及太陽入射角的變化等。

不同品種的能源草，如果在應對光照波動的能力方面有差別，就可以深入挖掘其背后原因，強化適應性強的品種，改良適應性差的品種。

目前，研究者們已經(jīng)篩選出很多潛在高產(chǎn)的草種。然而缺乏對這些能源草品種之間光合效率的橫向對比，尤其是在光照波動條件下。

當植物從低光轉入高光，或是相反，凈光合速率的調整會受到電子傳遞速率、代謝物、酶活、光保護、氣孔導度等因素的調控。這些限制因素在不同品種間可能存在差異。

能源草種，既有C3，也有C4品種。很多高產(chǎn)的能源草如巨芒或柳枝稷，都是C4植物。而蘆竹則為C3植物。C4和C3植物的主要差別在于，C4植物有CO2濃縮機制，這一機制會讓Rubisco酶羧化位點的CO2濃度更高。C3和C4植物都是利用C3循環(huán)來制造細胞呼吸所需要的化學能，而C4步驟會造成ATP的額外消耗。和C3植物對比來看，C4植物的水分利用效率和氮利用效率更高。人們感興趣的是，兩者對光照波動的響應一致嗎？

Slattery等（2018）回顧了光照波動對作物的影響，除了分析可能的限制因素，還討論了在光照波動條件下，C3和C4植物可能會有的一些區(qū)別：C4植物，由于增加了光合系統(tǒng)的復雜性，在光照波動下可能會遜色于C3植物。此外，C4植物還有3種亞型（NADP-ME,NAD-ME, PEPCK），這無疑增加了評估的難度。

為了回答上述問題，本研究以6種C4和6種C3植物為對象，對比分析了其在光照波動條件下光合效率的差別。

6種C4植物分別是巨芒、甘蔗、柳枝稷、大須芒草、草原網(wǎng)茅、玉米；6種C3植物是蘆竹、草蘆、高羊茅、高冰草、煙草、小麥。

在這12種測試植物中，有7種能源草：巨芒（Miscanthus× giganteus）、甘蔗（Sugarcane）、柳枝稷（Switchgrass）、大須芒草（Big Bluestem）、草原網(wǎng)茅（Prairie Cordgrass）、蘆竹（Giant reed）、草蘆（Reed Canary grass）。

研究者們的目標是：（1）在光照波動條件下，量化C3和C4植物的光合氣體交換特征；（2）分析C3和C4能源草在光合效率方面的差異。結果發(fā)現(xiàn)，與穩(wěn)態(tài)光環(huán)境下的測量數(shù)據(jù)相比，光照波動會使所有測試植物的碳同化速率降低，整體約減少16%。總體而言，光照波動條件下，C4植物比 C3植物能固定更多的碳。C3植物對波動光的響應種間差異較小，從高光到低光轉換期，光呼吸是導致其凈光合速率下降的主因。而在C4植物中，四種NADP-ME型對光照波動的響應存在明顯差異，揭示這種差異背后的原因，是將來的一個研究方向。

穩(wěn)態(tài)氣體交換測量

使用LI-6800高級光合-熒光測量系統(tǒng)，測量新長出且完全展開葉片的CO2響應曲線和光響應曲線。

設置初始光強為1500 μmol m-2 s-1，其中紅光(635 nm)占90%，藍光(465 nm)占10%。設置模塊溫度 30℃，流速 500 μmol s-1，相對濕度60%。將CO2R設置為以下濃度來測量CO2響應曲線 (A/Ci ) ：400、300、200、150、100、75、0、400、400、400、600、800、1000、1200、1400和400 μmol mol-1。

之后將光強增加到 2000 μmol m-2 s-1，等待15-30 min，葉片光合速率達到穩(wěn)定后，測量同一葉子的光響應曲線( A/Qabs )。CO2S濃度維持在400 μmol mol-1 (~40 Pa)，光強按以下強度變化：2000、1600、1200、900、750、600、500、400、300、 200、120、60和20 μmol m-2 s-1。

在100 μmol m-2 s-1的光強下，對同一片葉子進行額外的 A/Ci曲線測量，等待15-30min讓葉片先達到穩(wěn)定狀態(tài)。環(huán)境條件設置與之前在1500 μmol m-2 s-1光強下的A /Ci曲線一致。參比室和樣品室紅外氣體分析儀 (IRGA) 在每個測量點都進行匹配。

光照波動條件下的氣體交換測量

在穩(wěn)態(tài)測量結束后，在同一葉片上，測量光照波動條件下的光合反應。設置光強1500 μmol m-2 s-1，模塊溫度30℃，流速500 μmol s-1，CO2R濃度400 μmol mol-1，相對濕度 60%。讓葉片適應 15-30min，直到光合速率達到穩(wěn)定，之后執(zhí)行光照波動程序化測量。

光照波動程序設置如下：4min高光，光強1500 μmol m-2 s-1，2min低光，100 μmol m-2 s-1，高低光轉換重復 4 次，然后以 4 分鐘1500 μmol m-2 s-1結束。在28分鐘的程序中，每5s記錄一次氣體交換數(shù)據(jù)。紅外氣體分析儀IRGA在程序開始之前進行匹配，程序運行期間不做匹配，以避免對測量過程的干擾。

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原文中的主要數(shù)據(jù)圖表

原文以  Spatial variations in daytime methane and carbon dioxide emissions in two urban landscapes, Sakai, Japan 為標題發(fā)表在Urban Climate（IF=3.834）上。
作者 | Tsugumi Takano , Masahito Ueyama 
翻譯 | 子毅

在準確評估城市生態(tài)系統(tǒng)的甲烷（CH4）和二氧化碳（CO2）排放時，很重要的一點就是要充分考慮這種生態(tài)系統(tǒng)的空間異質性。

研究者使用渦度協(xié)方差方法，測量了兩個城市景觀的CH4和CO2通量。結合通量貢獻區(qū)分析（Footprint Analysis）以及移動式測量平臺，對通量的空間分布進行了評估。

識別出的CH4排放熱點區(qū)域包括以下幾類：污水處理廠、煉油廠以及天然氣設施。

受排放熱點影響的區(qū)域，CH4通量能達到60±65 nmol m-2 s-1，而城市郊區(qū)和居民區(qū)的CH4通量大約為22±30 nmol m-2 s-1。

移動式測量平臺數(shù)據(jù)顯示，熱點區(qū)域的CH4濃度可達5130ppb。

即便不考慮排放熱點的存在，研究區(qū)整體上仍表現(xiàn)為CH4的源（Source）。

移動式測量平臺排查出一些CH4的泄漏/排放源：天然氣運輸管網(wǎng)、污水管線、以天然氣為能源的空調機、河道。

就CO2通量而言，商業(yè)區(qū)和工業(yè)區(qū)的排放強度高于居民區(qū)和城市郊區(qū)，城市綠地在白天能近似達到碳中和。

LI-7810便攜式CH4/CO2/H2O分析儀在本研究中的作用

L7810組成的移動式測量平臺（點擊了解詳情）

2020年秋，在排放熱點潛在區(qū)域，使用LI-7810便攜式CH4/CO2/H2O分析儀（LI-COR Inc., Lincoln, USA）進行了移動式觀測。進氣口距離地面高度約1.3m，安裝在車窗外面。使用泵將氣體抽入，泵速為3.5LPM。使用GPS獲取位置信息。數(shù)據(jù)采樣頻率1Hz，電腦記錄。

原文中的主要數(shù)據(jù)圖