小片段DNA的PCR擴增程序
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我要擴的DNA片段138KB擴了很多次都沒有擴出來,想問問大家,誰擴過這么小的片段,PCR程序是怎么設定的
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- longwub 2009-10-30 00:00:00
- 恩。。上面說的對,跑高濃度膠 這個問題的歸類挺好玩的。。。 你的Tm差好像太高了。。。我總是會避免有這么大的差值的。萬不得已會用touch-down PCR
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- 一龍?zhí)?/a> 2009-10-26 00:00:00
- 這個沒有什么特別的吧,定量PCR一般擴增的長度也和你差不多。所以不存在小片段難擴增的問題。 要注意的東西和普通的PCR沒有區(qū)別,主要是由于片段這么短,可能跑出來的電泳條帶會容易和引物二聚體的位置比較接近,要注意和引物二聚體區(qū)分開來。 把體系檢測一次,首先除了引物,和模板之外的其他反應溶液檢測一遍,如果沒問題,想想模板有沒有問題?再沒問題就看看你的引物設計有沒有問題了。
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- 穩(wěn)穩(wěn)雯雯98 2009-10-30 00:00:00
- 138KB還是138bp?你這個先弄清楚。 擴不出來主要是你引物的問題吧。和擴增程序沒多大關系。 你變性30s、退火20s,延伸45s就行。 —————————————————————————————— 你這兩個引物Tm差異比較大。不過我想在55~57℃退火,用我上面給你的程序應該是能夠成功的。一般的real-time PCR的擴增產(chǎn)物也就150bp左右。如果低于55℃還是P不出來,那估計就是你的引物有問題或者模板降解了。
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- asd704616717a 2009-10-30 00:00:00
- 你的引物設計得不是很好,2個Tm值不協(xié)調。 但是已經(jīng)這樣了,我建議你優(yōu)化退火溫度: 先設計53、55、57、59(或60)4組,之后如果有跡象,在那個出來條帶的溫度附近再細化一下,再次優(yōu)化溫度,比如,如果你在55度出來帶了,再設計54、55、56試試看,也許就會很好了。 好運!
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