Protein Select填料是一種用于重組蛋白純化的親和層析填料,其最主要特點是通過標(biāo)簽自裂解的方式實現(xiàn)目標(biāo)蛋白的純化,在洗脫過程中實現(xiàn)目的蛋白收獲和標(biāo)簽去除的雙重目標(biāo)(圖1)。
圖1:Protein Select填料純化重組蛋白步驟示意圖
相較于其它親和標(biāo)簽純化如組氨酸標(biāo)簽蛋白純化、GST標(biāo)簽蛋白純化和MBP標(biāo)簽蛋白純化等純化過程省去了標(biāo)簽去除步驟,提高了蛋白純化效率。
親和層析填料Protein Select
主要特點:
1
適用面廣,適用于不同類型重組蛋白純化;
2
純化過程簡單,一步即可完成蛋白純化和標(biāo)簽去除;
3
蛋白純度高,使用Protein Select填料可以獲得高純度不含有標(biāo)簽的重組蛋白;
4
操作條件溫和,使用單一溶液(pH 6-9),避免造成蛋白聚集和生物活性降低的現(xiàn)象;
5
適用于不同表達(dá)系統(tǒng),包括常用的大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)、昆蟲細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)和哺乳動物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)。
Protein Select純化重組蛋白盡管具有以上的多種優(yōu)勢,但作為創(chuàng)新型重組蛋白純化系統(tǒng),填料的相關(guān)優(yōu)化使用技巧需要進(jìn)一步的積累和驗證。
本文介紹法國巴斯德研究所(Institut Pasteur)研究人員使用Protein Select填料的使用實例及經(jīng)驗總結(jié),希望對Protein Select填料的使用和優(yōu)化提供參考,推動Protein Select填料應(yīng)用的推廣和普及。
實驗?zāi)繕?biāo)
使用Protein Select填料純化大腸桿菌(E. coli)系統(tǒng)表達(dá)的重組綠色熒光蛋白(GFP),利用GFP熒光更加直觀的觀察蛋白與填料結(jié)合與洗脫過程。
研究不同純化溫度對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響;Protein Select使用說明中提到目的蛋白N端前三位氨基酸性質(zhì)影響Protein Select自剪切速率(表1)。
研究人員在重組GFP蛋白中驗證了N端前三位氨基酸性質(zhì)變化對于Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響。
表1:目的蛋白前三位氨基酸性質(zhì)
對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響
實驗步驟與結(jié)果
重組GFP蛋白獲取過程從質(zhì)粒構(gòu)建開始(目的蛋白N端添加Protein Select標(biāo)簽),然后是蛋白表達(dá),最后進(jìn)行標(biāo)簽蛋白純化。
1. 質(zhì)粒構(gòu)建
為了提高重組蛋白的表達(dá),研究人員對Protein Select tag的密碼子進(jìn)行了優(yōu)化處理,以達(dá)到最小化RNA二級結(jié)構(gòu)的自由能同時增加mRNA翻譯起始位點可及性的目的(圖2)。
圖2:優(yōu)化前后Protein Select tag的RNA二級結(jié)構(gòu)對比
依據(jù)填料使用說明中給出的目的蛋白N端前三位氨基酸性質(zhì)對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響,分別構(gòu)建N端前3位氨基酸性質(zhì)不同的3個質(zhì)粒GFP#1、GFP#2和GFP#3(圖3)。
圖3:N端前3位氨基酸性質(zhì)不同的3個GFP質(zhì)粒
2. 蛋白表達(dá)
重組GFP蛋白表達(dá)體積10 ml,培養(yǎng)溫度30°C,攪拌速度180 rpm,過夜培養(yǎng)。
最終通過熒光定量的方法10 ml表達(dá)體積,獲得GFP蛋白大約12 mg;另外研究發(fā)現(xiàn)含有Protein select標(biāo)簽GFP蛋白與沒有標(biāo)簽GFP蛋白相比,蛋白表達(dá)量基本沒太大變化(圖4)。
圖4:Protein Select標(biāo)簽對GFP蛋白表達(dá)量結(jié)果
3. Protein Select標(biāo)簽蛋白純化
3.1溫度對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響
溫度對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響,實驗采用GFP#1質(zhì)粒在4°C和室溫進(jìn)行對比實驗。
比較兩種條件下孵育4個小時蛋白收獲量(量度標(biāo)簽自剪切速率)和兩種溫度條件下總蛋白收獲量(間隔4小時收集一次,共進(jìn)行4次收集)。
實驗結(jié)果表明室溫條件較4°C條件Protein Select標(biāo)簽自剪切速率明顯提高,而且總蛋白收獲量也明顯提高(表2)。
表2:4°C和室溫條件下
孵育4個小時蛋白收獲量和兩種溫度條件下總蛋白收獲量
3.2目的蛋白N端前3位氨基酸性質(zhì)對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響
為了研究目的蛋白N端前3位氨基酸性質(zhì)對Protein Select標(biāo)簽自剪切速率的影響,研究人員構(gòu)建質(zhì)粒GFP#1、GFP#2和GFP#3(圖3)。
分別使用3個質(zhì)粒進(jìn)行表達(dá)和蛋白純化(室溫條件),比較孵育4個小時蛋白收獲量(量度標(biāo)簽自剪切速率)和總蛋白收獲量(間隔4小時收集一次,共進(jìn)行4次收集)(表3)。
從Protein Select標(biāo)簽自剪切速率角度看,GFP#2與GFP#1相比目的蛋白N端第二位增加一個芳香族氨基酸苯丙氨酸(F),其孵育4個小時蛋白收獲量顯著多于GFP#1孵育4個小時蛋白收獲量,表明GFP#2的標(biāo)簽自剪切效率明顯高于GFP#1。
GFP#3與GFP#2相比保留了目的蛋白N端第二位苯丙氨酸(F),但是N端第一位氨基酸替換成丙氨酸(A)同時N端第三位增加一個纈氨酸(V),實驗結(jié)果表明GFP#3標(biāo)簽自剪切速率快于GFP#2,更是明顯快于GFP#1標(biāo)簽自剪切速率(表3)。
表3:室溫條件3種質(zhì)粒表達(dá)GFP蛋白
孵育4個小時蛋白收獲量和總蛋白收獲量
總結(jié)
以上實驗結(jié)果來自Institut Pasteur,研究人員最后總結(jié)了 Protein Select填料應(yīng)用的相關(guān)優(yōu)勢及使用過程中需要注意的問題。
優(yōu)勢:
1
Protein select標(biāo)簽的添加不會影響重組蛋白表達(dá)量。
2
Protein Select填料與Protein select標(biāo)簽結(jié)合效率高。
3
純化系統(tǒng)簡單,純化過程中只使用單一溶液。
4
收獲蛋白純度高,標(biāo)簽自剪切后不會有氨基酸殘留。
5
Protein Select填料可以清潔,多次重復(fù)使用。
使用過程中需要注意的問題:
1
目的蛋白N端前三位氨基酸會對標(biāo)簽自剪切速率產(chǎn)生較大影響,在質(zhì)粒構(gòu)建時需要依據(jù)Protein select 使用說明中相關(guān)建議對N端前三位氨基酸進(jìn)行優(yōu)化以提高標(biāo)簽的自剪切速率。
2
純化過程中實驗溫度對Protein select 標(biāo)簽自剪切速率影響較大,進(jìn)而影響總蛋白收獲量。
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參考文獻(xiàn):
1. Protein Select resin Datafile
2. Protein Select resin Instructions for Use 29711002 AB
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