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TelN端粒酶:DNA酶法合成的新動力

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新時(shí)間:2024-12-25 14:39:42 閱讀量:190

 

談及生物學(xué)中的端粒和端粒酶,人們的心頭往往首先浮現(xiàn)出衰老這一不可抗拒的自然現(xiàn)象。端粒,作為真核生物染色體末端的DNA重復(fù)序列,它肩負(fù)著維持染色體完整和調(diào)控細(xì)胞分裂周期的重任。端粒酶是使端粒延伸的逆轉(zhuǎn)錄DNA合成酶,是由RNA和蛋白質(zhì)組成的核糖核酸-蛋白復(fù)合物。其RNA組分為模板,蛋白組分具有催化活性,可催化合成端粒重復(fù)序列。

 

圖1. 端粒酶延長端粒機(jī)理[1]

 

端粒酶能夠修復(fù)并延長端粒,彌補(bǔ)DNA復(fù)制缺陷,防止細(xì)胞分裂中端粒損耗,從而增加細(xì)胞分裂次數(shù)。2009年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)授予了Elizabeth H Blackburn、Carol W Greider和Jack W Szostak以表彰他們在“揭示端粒與端粒酶在細(xì)胞功能和老化中的關(guān)鍵作用”中做出的杰出貢獻(xiàn)。

今天,要為大家介紹的是一個(gè)與眾不同的端粒酶:TelN端粒酶(TelN Protelomerase),TelN端粒酶來自噬菌體N15,是N15復(fù)制系統(tǒng)的組成部分,參與線性前噬菌體DNA的生成。與真核生物的端粒酶不同,TelN是不含任何RNA成分的純蛋白酶,具有切割-連接活性,在切割雙鏈DNA(dsDNA)后會在酶切位點(diǎn)處留下共價(jià)閉合的末端。

 

圖2. TelN端粒酶切割位點(diǎn)

 

 

TelN端粒酶作用原理

 
TelN端粒酶的識別位點(diǎn)telRL,是一個(gè)長達(dá)56 bp的回文序列,兩側(cè)是telR和telL。靶序列中心位置同樣是一個(gè)回文序列telO。TelN端粒酶在telO序列內(nèi)部切割并且在2個(gè)切割末端形成共價(jià)閉合的發(fā)卡結(jié)構(gòu),酶切后的DNA載體末端依然由telR和telL組成,形似“狗骨頭”(doggybone)。

圖3. TelN端粒酶切割原理[2]

 

由于TelN端粒酶特殊的酶切-連接活性,可以經(jīng)過一步酶促反應(yīng)將環(huán)狀質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)變成線性共價(jià)閉合的啞鈴型分子。與線性開口DNA分子相比,線性閉合DNA在細(xì)胞內(nèi)具有更高的蛋白表達(dá)水平,非常適合用于構(gòu)建高穩(wěn)定性、攜帶最少外源序列的線性閉合末端的迷你DNA。
質(zhì)粒DNA,作為mRNA疫苗、DNA疫苗以及細(xì)胞基因治療等多個(gè)領(lǐng)域的核心“元件”,扮演至關(guān)重要的角色。傳統(tǒng)的質(zhì)粒生產(chǎn)方式涉及大腸桿菌發(fā)酵和多級放大擴(kuò)增過程,而發(fā)酵過程中的不可控風(fēng)險(xiǎn)限制了高質(zhì)量質(zhì)粒載體的產(chǎn)量,這成為了限制疫苗產(chǎn)能的關(guān)鍵。英國的Touchlight公司推出了doggybone DNA(dbDNA)載體技術(shù),這項(xiàng)技術(shù)顛覆了傳統(tǒng)細(xì)菌發(fā)酵制備質(zhì)粒DNA的方法,開創(chuàng)性地采用體外酶促法合成DNA,其中使用TelN端粒酶特殊的酶切-連接活性來生成線性閉合末端的迷你DNA是該技術(shù)的關(guān)鍵。

 

 

TelN端粒酶在DNA酶法合成中的應(yīng)用

 

基于phi29 DNA聚合酶及TelN端粒酶的DNA體外酶法技術(shù)可以避開生物發(fā)酵過程的諸多不可控風(fēng)險(xiǎn),且體外酶促法合成DNA的速度快、產(chǎn)量高,合成的DNA可用于眾多新興技術(shù),如mRNA疫苗、DNA疫苗、基因治療載體以及基因編輯等。

 

圖2. DNA酶法合成流程圖[3]

 

 

 

酶法DNA合成工藝流程

 
 
01
 

模板變性

環(huán)狀質(zhì)粒DNA模板通過變性處理,將其轉(zhuǎn)化為兩個(gè)單鏈環(huán)狀DNA。

02
 

滾環(huán)擴(kuò)增

利用Phi29 DNA聚合酶以單鏈環(huán)狀DNA為模板,進(jìn)行滾環(huán)擴(kuò)增,生成具有端粒酶識別序列間隔的長線性雙鏈多聯(lián)體DNA。

03
 

切割及共價(jià)閉合

TelN端粒酶識別多聯(lián)體DNA上的端粒酶識別序列(telRL)發(fā)揮切割和連接活性,生成線性、末端共價(jià)連接DNA單體。

04
 

去除細(xì)菌骨架DNA

限制性內(nèi)切酶或核酸外切酶降解末端具有開放結(jié)構(gòu)的細(xì)菌骨架DNA得到僅含有目標(biāo)基因表達(dá)元件的DNA。

 

酶法合成DNA技術(shù)完美避開生物發(fā)酵,可快速實(shí)現(xiàn)GMP級別的質(zhì)粒DNA合成,解決基因治療領(lǐng)域、mRNA疫苗領(lǐng)域中質(zhì)粒生產(chǎn)的產(chǎn)能限制,蘊(yùn)藏著巨大的產(chǎn)業(yè)化潛力。為推動DNA酶法合成技術(shù)的發(fā)展,翌圣生物可提供DNA酶法合成的核心酶原料:phi29 DNA聚合酶(14404ES)及TelN端粒酶(14540ES)等,助力DNA酶法合成技術(shù)研發(fā)生產(chǎn)。

 

 

翌圣TelN端粒酶性能展示

 
01

切割-連接性能優(yōu)異,與進(jìn)口品牌相當(dāng)

以含有TelN端粒酶識別位點(diǎn)的超螺旋質(zhì)粒為模板,梯度加入(0.078-5 U)翌圣及進(jìn)口品牌A*的TelN端粒酶將0.5 μg超螺旋質(zhì)粒轉(zhuǎn)換成封閉線性雙鏈DNA,凝膠電泳檢測轉(zhuǎn)換效率,結(jié)果顯示翌圣TelN端粒酶的切割-連接活性與進(jìn)口品牌A*相當(dāng)。

圖3. TelN端粒酶切割活性檢測 M:Marker,C:超螺旋質(zhì)粒對照

 

02

雙鏈DNA末端閉合完整性>90%

以含有TelN端粒酶識別位點(diǎn)的超螺旋質(zhì)粒為模板,加入翌圣及進(jìn)口品牌A*的TelN端粒酶,將0.5 μg超螺旋質(zhì)粒轉(zhuǎn)換為封閉線性雙鏈DNA,再加入T5核酸外切酶通過條帶降解程度來檢測其末端完整性,結(jié)果顯示翌圣的TleN端粒酶生成的雙鏈DNA末端閉合完整性>90%,與進(jìn)口品牌A*相當(dāng)。

圖4. TelN端粒酶末端閉合完整性檢測 

C1:含TelN識別位點(diǎn)質(zhì)粒,不加TelN端粒酶與T5核酸外切酶;
C2:含TelN識別位點(diǎn)質(zhì)粒,加TelN端粒酶,不加T5核酸外切酶;
A*:含TelN識別位點(diǎn)質(zhì)粒,加A*的TelN端粒酶,加T5核酸外切酶;
Yeasen:含TelN識別位點(diǎn)質(zhì)粒,加Yeasen的TelN端粒酶,加T5核酸外切酶。

 

 

DNA酶法合成相關(guān)產(chǎn)品

 

產(chǎn)品定位

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

端粒酶

TelN Protelomerase (5 U/μL)

14540ES

Phi29 DNA 聚合酶

phi29 DNA Polymerase (10 U/μL)

14404ES

核酸外切酶

Exonuclease III

14525ES

T5 Exonuclease (10 U/µL)

14538ES

dNTP

dNTP Mix(25 mM each)

10125ES

 

參考文獻(xiàn)

[1] Giardini MA, Segatto M, da Silva MS, Nunes VS, Cano MI. Telomere and telomerase biology. Prog Mol Biol Transl Sci. 2014;125:1-40.

[2] Heinrich J, Schultz J, Bosse M, Ziegelin G, Lanka E, Moelling K. Linear closed mini DNA generated by the prokaryotic cleaving-joining enzyme TelN is functional in mammalian cells. J Mol Med (Berl). 2002;80(10):648-654.

[3] Heinrich J, Schultz J, Bosse M, Ziegelin G, Lanka E, Moelling K. Linear closed mini DNA generated by the prokaryotic cleaving-joining enzyme TelN is functional in mammalian cells. J Mol Med (Berl). 2002;80(10):648-654. doi:10.1007/s00109-002-0362-2.

 

 

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