輔助生殖行業(yè)背景
我國不孕不育率逐年攀升,根據(jù)《柳葉刀中國婦幼健康特邀 重大報(bào)告》預(yù)測數(shù)據(jù),2023年我國不孕率18.2% ,預(yù)計(jì)2025年將接近20%。不孕不育率的快速上升意味著輔助生殖服務(wù)潛在需求人數(shù) 增長,從而驅(qū)動輔助生殖市場擴(kuò)容。輔助生殖(ART)由三種手段組成:人工授精、配子移植技術(shù)、體外受精-胚胎移植(IVF-EF)。其中體外受精-胚胎移植即試管嬰兒,是指將不孕夫婦的卵子和精子通過人工方式取出,在體外培育受精并完成早期胚胎發(fā)育后,再移植回母體子宮內(nèi)實(shí)現(xiàn)妊娠。
圖1.輔助生殖診療過程(來源:艾瑞咨詢)
輔助生殖技術(shù):從“盲選”到“優(yōu)選”的生育革命
中國每年新增出生缺陷兒約90萬例,其中單基因遺傳病占比高達(dá)22.2%。隨著基因檢測技術(shù)的突破,PGT(胚胎植入前遺傳學(xué)檢測)技術(shù)為這些家庭提供了從源頭阻斷遺傳病的新選擇。迄今為止,全球已經(jīng)有數(shù)萬例家庭通過試管技術(shù)助孕,順利圓夢→獲得健康寶寶!誠然一個(gè)個(gè)試管寶貝的誕生也見證了輔助生殖技術(shù)從無到有,從有到優(yōu)的過程;該技術(shù)的不斷更新升級更幫助人們有效解決“生不出”難題,且致力于化解“生不好”的困擾。
什么是第三代試管嬰兒PGS和PGD技術(shù)?
第三代試管嬰兒即胚胎植入前遺傳學(xué)篩查診斷技術(shù)(PGS/PGD),主要是對胚胎的遺傳物質(zhì)進(jìn)行檢測。PGS即胚胎植入前遺傳學(xué)篩查,是對胚胎的染色體數(shù)目和結(jié)構(gòu)進(jìn)行檢測,分析對比是否有重復(fù)、缺失或易位等異常情況;PGD即胚胎植入前遺傳學(xué)診斷,是對染色體上的基因進(jìn)行檢測,診斷胚胎有沒有攜帶導(dǎo)致某種特定疾病的基因突變。
根據(jù)世界衛(wèi)生組織的定義,PGD\PGS有了新的命名,統(tǒng)一稱PGT,包括PGT-A,PGT-M,PGT-SR;PGT技術(shù)通過在體外受精后對胚胎進(jìn)行基因檢測,篩選出無遺傳缺陷的胚胎進(jìn)行移植,將遺傳病防控從產(chǎn)前診斷提前至胚胎階段。這一技術(shù)被譽(yù)為“第三代試管嬰兒”。
圖2.PGT的工作流程
PGT 的分類
表1.PGT的分類
PGT-A
利用單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)和NGS技術(shù)對輔助生殖過程中體外培養(yǎng)的卵裂期或囊胚期胚胎進(jìn)行檢測,既單細(xì)胞測序全基因組擴(kuò)增(WGA),該技術(shù)可檢測全部的23對染色體非整倍體、≥4Mb的染色體片段缺失和重復(fù)、≥10Mb且比例≥30%的嵌合和夫婦一方或雙方已知1-4 Mb遺傳型CNVs。測序數(shù)據(jù)量1-2 M左右。
目前存在的主要三種擴(kuò)增方法有:簡并寡核苷酸引物PCR擴(kuò)增(DOP-PCR)、多重置換擴(kuò)增(MDA)、多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增(MALBAC),三種方法各有優(yōu)缺點(diǎn)。
表2.單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)的三種方法對比
DOP-PCR
采用隨機(jī)引物或者部分隨機(jī)引物,通過熱循環(huán)實(shí)現(xiàn)指數(shù)擴(kuò)增,具體來說DOC-PCR(Degenerate Oligonucleotide Primed PCR),即退化寡核苷酸引物PCR,是隨機(jī)擴(kuò)增得到全基因組序列的;這不同于一般的PCR,一般的PCR只能擴(kuò)增特定的DNA片段。該技術(shù)需要使用簡并配對引物,即類脫氧肌苷引物,它可以結(jié)合到DNA任何部位。引物的3’端為6bp退化寡核苷酸,5’端為正常的堿基。3’端和DNA鏈隨機(jī)結(jié)合,最初幾個(gè)循環(huán)退火溫度要低(30℃左右),然后延伸直到5’端引物配對處。但該技術(shù)容易造成堿基對突變、短串聯(lián)重復(fù)( short tandem repeat,STR)增加或減少。
圖3.DOP-PCR原理
多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增技術(shù)
技術(shù)原理:擬線性的擴(kuò)增過程降低了指數(shù)擴(kuò)增的序列偏好性。擴(kuò)增引物,5’含有27 bp的共同序列,3’是8 bp的隨機(jī)序列。利用特殊的隨機(jī)引物,使擴(kuò)增產(chǎn)物能首尾互補(bǔ)形成環(huán),進(jìn)行近乎線性的全基因組預(yù)擴(kuò)增,再通過PCR技術(shù)進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增,從而降低擴(kuò)增過程中錯(cuò)誤累積。擴(kuò)增偏好性可重復(fù),適合CNV檢測;聚合酶保真性一般,不適合SNV檢測。
圖4.MALBAC原理圖
多重置換擴(kuò)增
采用隨機(jī)6堿基引物,在恒溫條件下,由Phi29 DNA聚合酶引導(dǎo),與模板DNA結(jié)合,進(jìn)而置換模板的互補(bǔ)鏈,而后循環(huán)擴(kuò)增。Phi29 DNA聚合酶相對傳統(tǒng)的DNA聚合酶具備更高的擴(kuò)增效率和保真性。具體來說MDA擴(kuò)增原理是使用隨機(jī)的六聚體引物和phi29DNA聚合酶進(jìn)行反應(yīng),在恒溫條件下進(jìn)行擴(kuò)增。該聚合酶具有很強(qiáng)的鏈置換特性,可擴(kuò)增產(chǎn)生50~200 kb的DNA片段,可用于構(gòu)建大片段文庫,同時(shí)該酶還能以新合成的DNA子鏈為模板,繼續(xù)合成新的DNA子鏈,擴(kuò)增產(chǎn)量高,同時(shí)由于其3’-5’核酸外切酶活性和校對活性,phi29 DNA聚合酶具有很高的復(fù)制保真性,準(zhǔn)確性更高、基因組覆蓋度更高,適用于SNV分析。雖然產(chǎn)物產(chǎn)量高和擴(kuò)增產(chǎn)物長度可達(dá)100 Kb左右,覆蓋度好,但是對樣本質(zhì)量要求高且指數(shù)擴(kuò)增的偏好性重復(fù)性不好,不適合CNV類檢測。
圖5.MDA單細(xì)胞基因組測序流程
生育健康NGS檢測產(chǎn)品選擇指南
翌圣生物
翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)鏈上游核心原料,從事核苷酸、蛋白、細(xì)胞和類器官四大品類生物試劑的研發(fā)、生產(chǎn)與銷售的高新技術(shù)企業(yè)。公司兼?zhèn)浜诵募夹g(shù)自主研發(fā)和規(guī)?;a(chǎn)能力,核心產(chǎn)品數(shù)量達(dá)數(shù)千種,覆蓋分子克隆、qPCR、NGS、體外轉(zhuǎn)錄、抗體、蛋白純化及分析、細(xì)胞培養(yǎng)、轉(zhuǎn)染、報(bào)告基因檢測和類器官等多種系列,廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)研究、診斷檢測和生物醫(yī)藥等領(lǐng)域。
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