2021年1月24日，ZG疾病預(yù)防控制ZX（CDC）發(fā)布了“關(guān)于新冠疫苗接種單位環(huán)境標本監(jiān)測相關(guān)工作技術(shù)建議”的指導(dǎo)文件。

文件中解釋了在新冠疫苗接種單位采集和檢測的環(huán)境標本中檢測到新冠病毒核酸陽性，對疫苗接種和監(jiān)測工作帶來困惑這一情況，并給予了相關(guān)的專家技術(shù)意見。

意見中指出新冠疫苗接種場所有可能因為疫苗中滅活病毒自帶的核酸而造成核酸檢測呈陽性，而滅活疫苗中的核酸本身沒有活性，并不具備傳染性，這種情況就會給相關(guān)防疫人員造成一定的困惑，所以在建議中要求：

“如已經(jīng)開展監(jiān)測發(fā)現(xiàn)陽性，或在疫苗接種場所附近采集的環(huán)境樣本病毒核酸檢測陽性，建議通過病毒全基因組測序的方式，明確核酸是否來自疫苗。”

二代測序技術(shù)在新冠疫情中的作用

國家疾控的工作技術(shù)建議中提到的測序技術(shù)，特別是二代測序技術(shù)（NGS）及相關(guān)的微生物宏基因組測序（mNGS），在新冠疫情的抗擊中也發(fā)揮著重要的作用，對于目前Z常用的定量 PCR 技術(shù)是非常好的補充，在病毒的突變與溯源中發(fā)揮著極其重要的作用。

也正是因為其可以判斷出是何種類型的病毒，故可以將某地發(fā)生流行的病毒與疫苗的病毒中所帶的核酸進行區(qū)分，結(jié)合其他流行病學(xué)手段即可判斷是否是疫苗中的病毒核酸引起的環(huán)境陽性。

*新冠病毒滅活疫苗中保留的病毒核酸片段已沒有活性、不具備感染性

二代測序流程冗長的應(yīng)對之法

二代測序的一般流程過程非常冗長，也較易出錯，Eppendorf 為此專門推出了 epMotion^? 5073 和epMotion^? 5075 的 NGS 套裝，可以自動化完成二代測序文庫構(gòu)建過程中的移液和純化工作，包括十分讓人頭疼的 pooling 工作，epMotion 也可以輕松應(yīng)對。

▲ epMotion^? 5073m  NGS solution

▲ epMotion^? 5075t  NGS solution

二代測序流程離不開定性 PCR 儀

定性 PCR 雖然不能直接進行新冠病毒的檢測，但是在二代測序的流程中卻是離不開定性 PCR 儀進行酶反應(yīng)孵育和核酸擴增的，在定性 PCR 方面，Eppendorf 有著悠久的歷史，在 90 年代發(fā)明了梯度 PCR 技術(shù)，近年又推出了 2D 梯度功能，極大地提高了 PCR 條件的優(yōu)化效率，在這次新冠檢測中也是被用戶認可，用于二代測序文庫構(gòu)建的過程。比如美國的 Ginkgo Bioworks 一次就采購了 100 多臺 Mastercycler^? X50 用于新冠相關(guān)的二代測序項目，來滿足美國目前居高不下的檢測通量需求。

Mastercycler^? X50 系列梯度 PCR 儀

同時該用戶還購買了多套 CycleManager X50 軟件來對如此之多的 PCR 儀進行集中控制和管理。一套 CycleManager X50 軟件可以同時管理多達 50 臺的 X50 系列 PCR 儀，極大地提高了實驗室的運行效率。

隨著疫苗接種工作的進行，疫苗接種場所檢測到新冠病毒核酸陽性的可能性也隨之增加，而二代測序?qū)椭覀兏玫刈R別這些病毒是源自疫苗還是其他。可以預(yù)見，二代測序的應(yīng)用將會越來越廣泛，我們也就能更加快速地分清“假警報”。