引言
原子力顯微鏡(AFM)作為一種高分辨率表面分析技術(shù),自1986年問世以來,在生命科學(xué)研究中的應(yīng)用穩(wěn)步拓展,已發(fā)展成為能在液體環(huán)境中對柔軟生物樣本進(jìn)行成像的完整工具集(即BioAFM)。它突破了傳統(tǒng)顯微鏡的諸多限制,可在近生理環(huán)境下對從單分子、病毒、蛋白質(zhì)到活細(xì)胞和組織等不同尺度的生物樣本進(jìn)行研究,不僅能實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)高分辨率可視化,還能全面表征樣本的生物力學(xué)特性,且易于與先進(jìn)光學(xué)顯微鏡結(jié)合實(shí)現(xiàn)關(guān)聯(lián)成像,為生命科學(xué)研究提供了獨(dú)特的技術(shù)支撐。
優(yōu)化生物型原子力顯微鏡(Bio-AFM)設(shè)計(jì),賦能生命科學(xué)應(yīng)用
生物型原子力顯微鏡的適用樣本范圍與應(yīng)用場景十分廣泛,涵蓋單分子成像、分子相互作用可視化、活體細(xì)胞及組織生物力學(xué)表征,以及臨床前研究等領(lǐng)域。因此,為特定應(yīng)用選擇AFM技術(shù)或模式時(shí),需綜合考量多方面因素,包括樣本環(huán)境(液相/氣相)、成像速度、操作靈活性,以及與光學(xué)顯微鏡技術(shù)的聯(lián)用兼容性。
AFM分辨率優(yōu)異且可直接接觸樣本,但存在短板:無法對表面特征進(jìn)行化學(xué)表征,掃描范圍也有限(通常僅100×100平方微米)。這些局限可通過與熒光顯微鏡等先進(jìn)光學(xué)技術(shù)聯(lián)用解決?;跓晒獾墓鈱W(xué)技術(shù)可通過特異性熒光標(biāo)記,精準(zhǔn)識別特定生物分子、細(xì)胞結(jié)構(gòu)、細(xì)胞器或抗原;同時(shí)光學(xué)技術(shù)視野更廣,能先定位目標(biāo)區(qū)域,再通過AFM做精細(xì)分析。因此,生物樣本成像時(shí),AFM與先進(jìn)光學(xué)顯微鏡聯(lián)用已成標(biāo)配,可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)互補(bǔ)與測量關(guān)聯(lián)。
研究分子和細(xì)胞動(dòng)態(tài)時(shí),需匹配生物過程的時(shí)間尺度(細(xì)胞遷移、膜囊泡形成、細(xì)胞骨架動(dòng)態(tài)等多發(fā)生在秒級、毫秒級),因此工具需兼具高空間分辨率與高時(shí)間分辨率。近年高速針尖掃描型AFM取得突破,可解析胞吐、囊泡運(yùn)輸、細(xì)胞骨架重構(gòu)、細(xì)胞遷移等秒/毫秒級動(dòng)態(tài)細(xì)胞過程,其分辨率突破傳統(tǒng)光學(xué)衍射極限;此時(shí)與光學(xué)/熒光檢測系統(tǒng)聯(lián)用,優(yōu)勢會進(jìn)一步放大。
傳統(tǒng)AFM僅能表征單分子、細(xì)胞及薄組織切片的納米力學(xué)特性,而生命科學(xué)與臨床研究對大尺寸、不均一、表面粗糙、難改性的天然樣本需求迫切,推動(dòng)了AFM設(shè)備升級。應(yīng)對大樣本橫向尺寸問題:可加裝電動(dòng)位移臺,結(jié)合軟件拼接功能,將XY掃描范圍拓展至數(shù)毫米(采集多幅小范圍圖像拼接為全景圖);應(yīng)對大樣本高度差超Z軸量程問題:布魯克推出HybridStage混合平臺,整合電動(dòng)位移臺與壓電XYZ掃描儀,Z軸量程最高達(dá)300微米,主打力譜應(yīng)用,可實(shí)現(xiàn)各類復(fù)雜大樣本的全面納米力學(xué)表征;另一種方案是布魯克SmartMapping智能成像技術(shù):基于力成像原理,通過AFM內(nèi)置Z軸電機(jī)拓展壓電Z軸的有限量程,且支持自定義2D力成像區(qū)域(無需局限于矩形)。
研究生物樣本需模擬近生理環(huán)境:液相體系、適配的緩沖液成分、鹽度、pH值等,還需具備控溫能力,適配各類基底與樣本。單一環(huán)境控制方案無法滿足多樣化需求,因此生物AFM需配備豐富附加配件,布魯克就提供生物池、液相池等多款產(chǎn)品。
培養(yǎng)皿:適合細(xì)胞培養(yǎng)與固定,是活細(xì)胞AFM研究常用載體;布魯克PetriDishHeater培養(yǎng)皿加熱器可適配各類商用35毫米培養(yǎng)皿,控溫最高60℃,支持氣體交換維持穩(wěn)定CO2濃度,滿足活細(xì)胞長期研究需求。
蓋玻片:表面易改性以實(shí)現(xiàn)樣本固定/功能化,且厚度僅130-170微米,適配高分辨率倒置光學(xué)顯微鏡;但蓋玻片易受機(jī)械振動(dòng)干擾,影響AFM測量穩(wěn)定性,布魯克BioCell生物池可針對性解決:兼具15-60℃精準(zhǔn)控溫與毛細(xì)管接口,抗振性優(yōu)異;若振動(dòng)影響較小,可選用玻璃底培養(yǎng)皿,視野更廣、樣本容量更大。
典型應(yīng)用案例
DNA是納米技術(shù)核心生物分子,其雙螺旋結(jié)構(gòu)具獨(dú)特結(jié)合特性,BioAFM可在液相中實(shí)現(xiàn)DNA高分辨率成像,清晰呈現(xiàn)質(zhì)粒DNA超螺旋狀態(tài)下的局部解鏈現(xiàn)象,助力解析轉(zhuǎn)錄、復(fù)制等DNA/RNA核心生命過程(Fig.8)。
DNA折紙納米結(jié)構(gòu)(DONs)是優(yōu)異分子載體,可固定配體用于細(xì)胞受體激活、早期信號通路研究,還能構(gòu)建生物功能材料與生物傳感器。借助高速BioAFM(50幀/秒)可實(shí)時(shí)觀測其表面生物分子結(jié)合動(dòng)態(tài),如鏈霉親和素-生物素的逐步結(jié)合過程,通過量化結(jié)合位點(diǎn)占有率,可分析分子結(jié)合強(qiáng)度等關(guān)鍵特性,為細(xì)胞培養(yǎng)體系研究提供重要工具(Fig.9)。
該技術(shù)可研究和操控單分子力學(xué)特性,既適用于受體-配體結(jié)合、抗原-抗體反應(yīng)等分子間相互作用,也能解析多結(jié)構(gòu)域蛋白、DNA等分子內(nèi)相互作用,為理解健康與病變狀態(tài)下生物分子的生物力學(xué)、折疊路徑、動(dòng)力學(xué)提供關(guān)鍵依據(jù),有望成為疾病發(fā)病機(jī)制診斷工具。實(shí)驗(yàn)中通過探針與基底固定目標(biāo)分子,結(jié)合連接臂減少干擾,以 (GB1) 8多聚蛋白為例,其解折疊力-距離曲線呈鋸齒狀,結(jié)合蠕蟲狀鏈(WLC)模型可提取分子參數(shù);全自動(dòng)設(shè)備(如ForceRobot400)日均可獲25萬條曲線,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)統(tǒng)計(jì)分析(Fig.10)。
傳統(tǒng)AFM接觸模式難以適配邊緣陡峭、柔軟黏附的活細(xì)胞,輕敲模式需專業(yè)操作,而商用快速力成像技術(shù)(如 PeakForce-QI)更適配,通過逐像素采集力曲線將側(cè)向力降至最低。以小鼠NIH-3T3成纖維細(xì)胞為例,在37℃培養(yǎng)液中可實(shí)現(xiàn)細(xì)胞表面斷層重建,結(jié)合接觸力學(xué)模型計(jì)算楊氏模量,還能通過不同壓力下的成像,區(qū)分細(xì)胞膜(近0pN)與細(xì)胞骨架 F-肌動(dòng)蛋白(300pN)等特定結(jié)構(gòu),支持原位與離線分析(Fig.11)。
活細(xì)胞、組織為復(fù)雜不均一材料,傳統(tǒng)赫茲力學(xué)模型假設(shè)不適用,需突破純彈性分析。通過采集力-距離曲線可觀測材料黏性響應(yīng),結(jié)合Z軸正弦振蕩可測量頻率依賴的力學(xué)響應(yīng),計(jì)算儲能模量(彈性形變)與損耗模量(黏性形變)(Fig.12)。
傳統(tǒng)AFM掃描量程不足,難以實(shí)現(xiàn)天然大尺寸生物/臨床樣本的統(tǒng)計(jì)性表征,SmartMapping技術(shù)結(jié)合內(nèi)置Z軸電機(jī)突破Z軸量程限制,搭配電動(dòng)位移臺(20mm×20mm)與光學(xué)拼接,可實(shí)現(xiàn)大樣本納米力學(xué)與光學(xué)聯(lián)合表征。以羊肌肉組織為例,可完成Z軸110μm范圍內(nèi)的力學(xué)成像,結(jié)合Z軸正弦振蕩,能獲取頻率依賴的儲能、損耗模量及損耗角正切值,明確組織黏彈性分布(Fig.13)。
BioAFM可無縫聯(lián)用光學(xué)及超分辨顯微鏡,結(jié)合DirectOverlay等校準(zhǔn)技術(shù)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)精準(zhǔn)疊加,融合AFM的形貌、三維結(jié)構(gòu)、力學(xué)數(shù)據(jù)與光學(xué)的免疫化學(xué)識別信息,實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢互補(bǔ)。超分辨技術(shù)(STED、STORM 等)縮小了與AFM的分辨率差距,DNA納米結(jié)構(gòu)可作為其校準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn);以DNA納米尺為例,AFM與STED聯(lián)用可實(shí)現(xiàn)跨技術(shù)精準(zhǔn)表征,光學(xué)端量化熒光分子間距,AFM端獲取納米結(jié)構(gòu)尺寸,二者數(shù)據(jù)高度吻合,提升表征可靠性支撐(Fig.14)
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