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學(xué)術(shù)成果丨《LWT-FOOD SCI TECHNOL》中國科學(xué)院長春光機(jī)所李備研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表發(fā)酵乳酸菌快速檢測新方法

來源:長春長光辰英生物科學(xué)儀器有限公司 更新時(shí)間:2024-07-30 16:30:12 閱讀量:338
導(dǎo)讀:中國科學(xué)院長春光機(jī)所李備研究團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)用長光辰英P300共聚焦拉曼光譜儀在《LWT-Food Science and Technology》期刊上發(fā)表了文章。

2024年7月1日,中國科學(xué)院長春光機(jī)所李備研究團(tuán)隊(duì)在《LWT-Food Science and Technology》期刊上發(fā)表了題為“Ultra-fast identification of lactic acid bacteria colonies based on droplet microcavity label-free SERS”的文章。文章基于液滴微腔技術(shù)結(jié)合無標(biāo)記表面增強(qiáng)拉曼技術(shù)和機(jī)器學(xué)習(xí)算法,成功實(shí)現(xiàn)了乳酸菌的快速檢測鑒定。核心產(chǎn)品——P300共聚焦拉曼光譜儀為本文乳酸菌的快速檢測及分類提供了有力工具。

一、研究背景


乳酸菌的快速檢測一直是科研工作者頭疼的問題,常規(guī)細(xì)菌鑒定方法耗時(shí)非常長,一般需要2-3天才能出結(jié)果。過去的研究中,納米銀結(jié)合表面增強(qiáng)拉曼光譜(SERS)鑒定的方法雖然檢測速度較快,但納米銀孵育等待的時(shí)間較長,不能及時(shí)地對菌落樣品進(jìn)行檢測。本研究中,為了提高整體的細(xì)菌檢測速率,將SERS與液滴微腔技術(shù)結(jié)合,縮短樣品制備檢測流程,又將拉曼技術(shù)與機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)相結(jié)合,提高了細(xì)菌的識(shí)別分類效率。

二、研究方法


本研究設(shè)計(jì)搭載了拉曼檢測平臺(tái),并針對液滴微腔設(shè)計(jì)了疏水性芯片,將微生物與納米銀混合后直接點(diǎn)樣至芯片上,對液滴進(jìn)行拉曼檢測(圖1)。對收集到的5種乳酸菌的拉曼光譜進(jìn)行統(tǒng)計(jì),采用2種機(jī)器學(xué)習(xí)算法對拉曼光譜的鑒定分類進(jìn)行預(yù)測。

圖1 納米銀SERS對乳酸菌的快速檢測流程示意圖

三、結(jié)果


本研究將培養(yǎng)的乳酸菌與納米銀膠體混合,直接點(diǎn)樣至疏水芯片上,置于拉曼光譜儀下進(jìn)行拉曼檢測,具體步驟為,從固體培養(yǎng)基上挑取待測單菌落放入離心管種,然后滴加納米銀膠體混合,渦旋儀混合后直接滴加在疏水載玻片上,放置在物鏡下直接進(jìn)行拉曼光譜檢測。

圖2 5類乳酸菌SERS光譜統(tǒng)計(jì)
A為5類乳酸菌SERS光譜均譜指紋區(qū)示意圖;B為5類乳酸菌SERS光譜的信噪比(SNR)統(tǒng)計(jì);C為5類乳酸菌SERS光譜的tSNE聚類圖

對五種酸奶發(fā)酵的乳酸菌進(jìn)行SERS拉曼光譜檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)表面增強(qiáng)拉曼光譜信噪比較高,而且不同種之間信噪比分布均勻,而t-SNE分析也得到了很好的分布結(jié)果(圖2C)。

接著,利用SVM、KNN機(jī)器學(xué)習(xí)算法對SERS光譜進(jìn)行聚類鑒定。得到的識(shí)別準(zhǔn)確率都在90%以上,達(dá)到了很好的區(qū)分效果。


圖 3 兩種機(jī)器學(xué)習(xí)算法對5種乳酸菌SRES光譜的預(yù)測
A為SVM機(jī)器學(xué)習(xí)算法對SRES光譜預(yù)測結(jié)果的混淆矩陣;B為KNN機(jī)器學(xué)習(xí)算法對SRES光譜預(yù)測結(jié)果的混淆矩陣

四、結(jié)論


本研究使用液滴微腔SERS的方法對五種乳酸菌進(jìn)行SERS光譜檢測。利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法(SVM 和KNN)分析 SERS 光譜,將乳酸菌識(shí)別率提高至 90% 以上。提高了無標(biāo)簽 SERS 技術(shù)檢測的速度,增強(qiáng) SERS 技術(shù)在細(xì)菌檢測,尤其是乳酸菌快速鑒定方面的適用性,滿足了乳品釀造業(yè)對及時(shí)檢測細(xì)菌的實(shí)際要求。


原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002364382400714X

五、辰英價(jià)值


該研究中采用了P300激光共聚焦拉曼光譜儀是研制的一款高端科研級光譜儀。在本文中,利用P300對納米銀與乳酸菌混合液進(jìn)行了表面增強(qiáng)拉曼光譜檢測,該儀器配套搭載的HOOKE IntP智能分析軟件對光譜進(jìn)行了t-SNE聚類分析和SVM、KNN分類預(yù)測。這些結(jié)果為進(jìn)一步提高SERS在食品發(fā)酵行業(yè)的應(yīng)用提供了參考依據(jù),同時(shí)也體現(xiàn)了P300在食品發(fā)酵與菌株快速檢測領(lǐng)域的應(yīng)用潛力,為開發(fā)食品發(fā)酵行業(yè)菌群鑒定與快速檢測提供了新的思路。


END


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