在浩瀚的微生物群落中,低豐度菌株如同“滄海一粟”——數(shù)量稀少卻價值非凡,他們很可能是疾病治療、生態(tài)修復(fù)或工業(yè)發(fā)酵的“黃金鑰匙”。然而,傳統(tǒng)篩選方法卻讓科研人員舉步維艱:
· 大海撈針:人工挑取重復(fù)率高,耗時數(shù)月仍可能錯失目標;
· 成本黑洞:無差別挑取下,大量檢測資源浪費在重復(fù)菌株上;
· 隨機之痛:稀有菌株捕獲率低,科研突破遙遙無期!
如何從“菌?!敝写驌瞥?/span>
真正的“黃金菌株”?
01
破局之道:RAcolony
——高效去重復(fù),從“滄海之粟”中挑選“菌中黃金”
RAcolony高通量菌落智能篩選系統(tǒng),結(jié)合圖像識別+拉曼光譜檢測,打造“識別/檢測-去重-篩選”全鏈路解決方案,有效識別并排除優(yōu)勢菌株,進而提高低豐度菌篩選效率。
1
微觀成像:
AI透視菌落“身份證”
· 20+項形態(tài)特征分析:尺寸、形態(tài)、紋理等,細節(jié)無處遁形;
· 智能聚類去重:使用特征相似性降維聚類算法,基于比較菌落圖像間的相似性進行圖像“去重”篩選;
· 數(shù)據(jù)見證:僅挑取總菌落數(shù)的10%(40個),即可覆蓋85%物種,豐度為0.5%的稀有物種捕獲率超80%(圖1)!
圖1 圖像去重菌落挑取數(shù)量與物種覆蓋度和低豐度物種捕獲率。
A)低豐度物種存在群體中,菌落挑取數(shù)量與物種覆蓋度的關(guān)系圖 ;B)不同低豐度閾值菌株的捕獲效率。
2
拉曼光譜:
解碼菌落“分子指紋”
· 原位無創(chuàng)檢測:免標記、原位獲取菌落 “分子指紋”,為菌落形態(tài)相似的不同物種提供另一維度的去重依據(jù);
· 精準去重升級:使用降維聚類算法,基于菌落光譜間“分子指紋”的相似性進行拉曼精細“去重”篩選;
· 數(shù)據(jù)見證:僅挑取總菌落數(shù)的10%(40個),物種覆蓋度達95%,豐度為0.5%的稀有物種100%捕獲(圖2)!
圖2 拉曼去重菌落挑取數(shù)量與物種覆蓋度和低豐度物種捕獲率。
A)存在低豐度物種群體中,菌落挑取數(shù)量與物種覆蓋度的關(guān)系圖 ;B)不同低豐度閾值菌株的捕獲效率。
02
告別低效,
讓“菌中黃金”觸手可及
RAcolony不僅是設(shè)備,更是微生物研究的“黃金探測器”:
· 從“人力苦熬”到“智能篩選”:全自動化操作,解放科研生產(chǎn)力;
· 從“盲目試錯”到“精準定位”:微觀圖像+拉曼光譜,鎖定目標菌株;
· 從“高成本”到“高回報”:縮短研發(fā)周期,降低經(jīng)費壓力,加速成果轉(zhuǎn)化!
立即行動,開啟“菌中黃金”
挖掘新時代!
#微生物篩選 #拉曼光譜 #菌落去重
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