還在為克隆陽性率低而煩惱嗎?
明明每一步都認(rèn)真操作,結(jié)果卻總不盡如人意——PCR、酶切、連接、轉(zhuǎn)化,反復(fù)嘗試,耗時耗力。
今天給大家介紹一個更高效、更靈活的克隆技術(shù)——同源重組克隆,與傳統(tǒng)酶切克隆相比,同源重組克隆速度更快、設(shè)計更自由,完全不受酶切位點的限制,可以在質(zhì)粒任意位置插入一個或多個DNA片段,讓克隆實驗從此更輕松!
傳統(tǒng)的酶切克?。?/span>克隆載體的多克隆位點需攜帶可用的單一酶切位點,同時酶切位點若存在于外源片段也會極大程度限制克隆。此外,還需要購買各式各樣不同的內(nèi)切酶。
同源重組克?。?/span>僅靠同源臂進(jìn)行互補(bǔ)配對。
傳統(tǒng)的酶切克?。?/span>由于酶切位點的限制和酶切位點之間存在著一定的距離和交叉覆蓋,可組裝的片段有限,酶切克隆通常需要分多次拼接,一般只能拼接2-3個片段,耗時耗力。
同源重組克隆:可同時拼接4-6個片段,并且只需要將所有片段混在一個試劑管中反應(yīng)即可。
傳統(tǒng)的酶切克?。?/span>傳統(tǒng)的片段和載體酶切均需要2-4小時,此外還需要對相關(guān)產(chǎn)物進(jìn)行末端補(bǔ)平、磷酸化、產(chǎn)物純化等一系列操作。為保證連接成功,還需在16℃條件下過夜連接。
同源重組克?。?/span>僅需PCR和膠回收,連接體系反應(yīng)時間為5-30min左右,連接單個和多個片段的時間一致。相比于傳統(tǒng)酶切克隆,可節(jié)約1天左右的時間。
定向:可滿足1-7個DNA片段的定向同源重組克隆
簡便:片段無需酶切,多片段連接一管內(nèi)即可完成
快速:最快5分鐘完成連接反應(yīng)
高效:菌落數(shù)多,克隆陽性率可達(dá)95%以上
超長:載體+片段連接長度可達(dá)25kb以上
小體系:低至5-6μL的連接總體系
圖1. 在6 μL小體系非復(fù)蘇感受態(tài)下,連接10 ng低投入量單片段基因。結(jié)果顯示,10923ES性能好于競品,連接效率高,菌落數(shù)多,陽性率達(dá)100%。A-B:重組轉(zhuǎn)化平板。載體(10 kb)和插入片段(1 kb)摩爾比為1:2。C:插入片段PCR鑒定電泳圖,M:Yeasen 10505ES。
圖2. 兩片段(3 kb)連接。結(jié)果顯示,10923ES菌落數(shù)多,陽性率100%。A:重組轉(zhuǎn)化平板。載體(11.6 kb)和插入片段(3 kb)摩爾比為1:2。B:插入片段PCR鑒定電泳圖,M:Yeasen 10505ES。
圖3. 三片段(4.4 kb)連接。結(jié)果顯示,10923ES菌落數(shù)多,陽性率100%。A:重組轉(zhuǎn)化平板。載體(11.6 kb)和插入片段(4.4 kb)摩爾比為1:2。B:插入片段PCR鑒定電泳圖,M:Yeasen 10505ES,菌落PCR長度2.6 kb。
圖4. 六片段(7.6 kb)連接。結(jié)果顯示,10923ES產(chǎn)品性能好于競品,菌落數(shù)多,陽性率100%。A-B:重組轉(zhuǎn)化平板。載體(11.6 kb)和插入片段(7.6 kb)摩爾比為1:2。C:插入片段PCR鑒定電泳圖,M:Yeasen 10505ES,菌P長度2.6 kb。
圖5. 超長片段連接。結(jié)果顯示,10923ES菌落數(shù)多,陽性率100%。A:重組轉(zhuǎn)化平板。載體(21 kb)和插入片段(4.5 kb)摩爾比為1:2。B:插入片段PCR鑒定電泳圖,M:Yeasen 10505ES。
圖6. 分別連接低濃度的五片段和六片段。結(jié)果顯示,10923ES在低濃度下連接性能穩(wěn)定,菌落數(shù)多,陽性率100%。A-B:重組轉(zhuǎn)化平板。載體(11.6 kb)和插入片段(5片段共5.6 kb、六片段共7.6 kb)摩爾比為1:2。C-D:插入片段PCR鑒定電泳圖,M:Yeasen 10505ES,菌P長度2.6 kb。
圖7:10923ES超小體系連接1 kb單片段,連接效率高,菌落數(shù)多,陽性率達(dá)100%。3 μL總體系連接,10923ES的投入量可低至1 μL。A&C&E&I:50 ng載體(11.6 kb)+10 ng片段(1 kb);G:25 ng載體+5 ng片段。B&D&F&H&J:插入片段PCR鑒定電泳圖。
圖8:10923ES升級版凍融無影響,通過反復(fù)的完全冰凍和4℃解凍進(jìn)行測試,結(jié)果顯示產(chǎn)品凍融對產(chǎn)品不會產(chǎn)生影響。以反復(fù)凍融40次的試劑盒分別連接單片段和六片段,同比正常保存對照,性能無差異。
翌圣生物
翌圣生物科技(上海)股份有限公司成立于2014年,是一家聚焦生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)鏈上游核心原料,從事核苷酸、蛋白、細(xì)胞和類器官四大品類生物試劑的研發(fā)、生產(chǎn)與銷售的高新技術(shù)企業(yè)。公司兼?zhèn)浜诵募夹g(shù)自主研發(fā)和規(guī)?;a(chǎn)能力,核心產(chǎn)品數(shù)量達(dá)數(shù)千種,覆蓋分子克隆、qPCR、NGS、體外轉(zhuǎn)錄、抗體、蛋白純化及分析、細(xì)胞培養(yǎng)、轉(zhuǎn)染、報告基因檢測和類器官等多種系列,廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)研究、診斷檢測和生物醫(yī)藥等領(lǐng)域。
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